New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4408579 | 48 (0.970) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.6% | coding (150/297 nt) | ybcO | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4408605 | 55 (1.160) | coding (124/297 nt) | ybcO | hypothetical protein |
ATGCAACCAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGTTTCGATTGC > NC_002947/4408434‑4408723 | aTGCAACCAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCa < 2:76720/147‑1 (MQ=255) aTGCAACCAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATg > 2:21730/1‑149 (MQ=255) aTGCAACCAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATg > 6:129219/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGt > 6:27605/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑CGGCGCCCTGCATGTCGTGc > 8:226850/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGc < 3:199832/149‑1 (MQ=255) ccccTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCt < 8:1546/149‑1 (MQ=255) ccccTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTAGCAGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGAGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCt > 7:203398/1‑149 (MQ=255) cccTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCtt < 6:208711/149‑1 (MQ=255) cTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTgc < 5:27605/149‑1 (MQ=255) cTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTgc > 4:281929/1‑149 (MQ=255) aaTGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCggcggcggcaagaaaccgcacgacatgcagg < 6:257282‑M1/149‑32 (MQ=255) aCTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTc < 7:170765/128‑1 (MQ=255) aCTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTc > 8:170765/1‑128 (MQ=255) tGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGc > 3:150787/1‑149 (MQ=255) cGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAgtgt > 3:14820/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCg < 5:129219/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCg < 8:86051/129‑1 (MQ=255) tCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCg > 7:86051/1‑129 (MQ=255) tCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAg > 2:118759/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAg < 1:118759/149‑1 (MQ=255) gTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGggtg < 3:295946/148‑1 (MQ=255) aCTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGc < 3:208252/136‑1 (MQ=255) aCTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGc > 4:208252/1‑136 (MQ=255) ccGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCgg > 7:151262/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGTGTCAAGGTGTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGTTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCggg < 8:203398/149‑1 (MQ=255) ggCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGt < 7:35264/149‑1 (MQ=255) tCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGtt < 4:14820/149‑1 (MQ=255) tCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGtt > 4:279591/1‑149 (MQ=255) cACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTc < 5:301101/73‑1 (MQ=255) cACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTc > 6:301101/1‑73 (MQ=255) aCGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTg > 5:124414/1‑148 (MQ=255) tACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGc > 6:14930/1‑149 (MQ=255) cGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGc > 7:183009/1‑116 (MQ=255) cGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGc < 8:183009/116‑1 (MQ=255) ggCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCg > 2:314839/1‑131 (MQ=255) ggCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCg < 1:314839/131‑1 (MQ=255) tGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATgcg > 8:74988/1‑148 (MQ=255) cGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACCTAGGCGCCCTGCggcggcggcaagaaaccgcacgacatgcagggcgcctggtg > 1:42910‑M1/1‑45 (MQ=255) cGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCggcggcggcaagaaaccgcacgacatgcagggcgcctggtg < 2:42910‑M1/85‑42 (MQ=255) gCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGa > 2:154295/1‑134 (MQ=255) gCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGa < 1:154295/134‑1 (MQ=255) aGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTcc > 2:128184/1‑149 (MQ=255) atcatGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGc > 5:50597/1‑149 (MQ=255) atcatGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGc > 1:160499/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGggcggc > 8:2198/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCttt < 1:21730/149‑1 (MQ=255) cagcaCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTg < 3:281929/147‑1 (MQ=255) cagcaCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGt > 7:269597/1‑149 (MQ=255) cagcaCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGt < 7:226850/149‑1 (MQ=255) gcaCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCa < 8:151262/149‑1 (MQ=255) caCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCgcagggcgcctggtgctgcagcgcctgccatgatgcctgcgacg < 2:42910‑M2/85‑45 (MQ=255) caCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCgcagggcgcctaggtgctgcagcgcctgccatgatgcctgcgacg > 1:42910‑M2/1‑41 (MQ=255) caCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGCGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAg > 3:14849/1‑149 (MQ=255) aCC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGt < 8:269597/149‑1 (MQ=255) cc‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGtt < 6:124414/149‑1 (MQ=255) c‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGttt < 3:279591/149‑1 (MQ=255) c‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGttt > 8:32556/1‑149 (MQ=255) ccTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCgcagggcgcctggtgctgcagcgcctgccatgatgcctgcgacggccgcagccagtccgtagaccgtgacacagcccggcagtaccacgccgagggcgtcatgcgcacccagtccatt < 6:257282‑M2/149‑119 (MQ=255) ccTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGTTTCGATTGc < 1:23489/149‑1 (MQ=255) | ATGCAACCAGCACCCCCTCGCGAATCAAAATGGACTGGGTGCGCATGACGCCCTCGGCGTGGTACTGCCGGGCTGTGTCACGGTCTACGGACTGGCTGCGGCCGTCGCAGGCATCATGGCAGGCGCTGCAGCACC‑AGGCGCCCTGCATGTCGTGCGGTTTCTTGCCGCCGCCGCAGGTGCCGGCCAAGCGGTAGTGTGCGAGCAGGGTGGTTTCGGGGTTGCCGTTGCAGACGCCCGGGATGCGCACCTGGCACTCCCGGCCGCGGGCGGCTTTGGTCAGTTTCGATTGC > NC_002947/4408434‑4408723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |