New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4452248 | 41 (0.830) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.7% | coding (1852/3564 nt) | nicB | nicotinate dehydrogenase subunit B |
? | NC_002947 | = 4452306 | 32 (0.670) | coding (1910/3564 nt) | nicB | nicotinate dehydrogenase subunit B |
CATACCCGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGA > NC_002947/4452110‑4452396 | cATACCCGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACggg < 7:101985/149‑1 (MQ=255) cATACCCGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCCGCGCACggg > 4:32193/1‑149 (MQ=255) cccGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGaa < 4:9504/149‑1 (MQ=255) ccGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGGAGTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGaa > 1:228349/1‑149 (MQ=255) cGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGt > 3:174562/1‑149 (MQ=255) gACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGaa > 4:97795/1‑136 (MQ=255) gACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGaa < 3:97795/136‑1 (MQ=255) caGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCgt < 3:265943/149‑1 (MQ=255) aGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGGTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCcgcggg < 6:153941/149‑3 (MQ=255) gCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCgtggt > 5:24766/1‑149 (MQ=255) cGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGa > 8:43980/1‑149 (MQ=255) aaGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGTCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATc > 6:233543/1‑149 (MQ=255) aaGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATc > 4:79328/1‑149 (MQ=255) gTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCatcatcccggcatcgtggccgatcaccacgcgggtgacggc < 4:206692‑M1/149‑42 (MQ=255) tgctgcGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGAt < 5:69114/149‑1 (MQ=255) ctgcGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCg < 1:22666/139‑1 (MQ=255) ctgcGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCg > 2:22666/1‑139 (MQ=255) tgcGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTg < 4:151676/116‑1 (MQ=255) tgcGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTg > 3:151676/1‑116 (MQ=255) gcgcGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCg > 8:222231/1‑149 (MQ=255) gcgcGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCg > 2:208078/1‑149 (MQ=255) gcgGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCgg > 8:102261/1‑148 (MQ=255) ggg‑gTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCgg < 7:18290/92‑1 (MQ=255) ggg‑gTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCgg > 8:18290/1‑92 (MQ=255) ggg‑gTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATg > 2:228349‑M2/1‑148 (MQ=255) ggg‑gTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATg < 6:243683‑M2/149‑2 (MQ=255) gCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAAccc > 6:158987/1‑149 (MQ=255) cTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCatcatcccggcatcgtggccgatcaccacgcgggtgacggccacttcgcccgtgcgccggtccact < 8:182238‑M1/146‑67 (MQ=255) cTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCatcatcccggcatcgtggccgatcaccacgcgggtgacggccacttcgcccgtgcgccggtccact > 7:182238‑M1/1‑80 (MQ=255) cTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAAcccc > 6:205402/1‑148 (MQ=255) tGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAgg < 7:43980/149‑1 (MQ=255) cgcTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGgtgt < 5:205402/149‑1 (MQ=255) cacaGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCAc > 1:302963/1‑147 (MQ=255) cacaGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCAc > 1:289405/1‑147 (MQ=255) aGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCAc > 7:49901/1‑144 (MQ=255) aaTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCAc < 3:79328/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCTCGGTCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 5:233543/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 5:158987/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 8:130924/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 1:208078/149‑1 (MQ=255) tCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGt < 5:243683/148‑1 (MQ=255) cGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCgtgg < 5:135942/83‑1 (MQ=255) cGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCgtgg > 6:135942/1‑83 (MQ=255) cAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCgg < 3:32193/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCggg < 4:174562/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTAc < 8:49901/149‑1 (MQ=255) tGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAg < 6:160369/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAgg < 7:222231/148‑1 (MQ=255) aGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcatag > 7:182238‑M2/1‑66 (MQ=255) aGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcatag < 8:182238‑M2/146‑81 (MQ=255) gACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGa < 7:144931/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGa < 7:28551/89‑1 (MQ=255) ccGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGa > 8:28551/1‑89 (MQ=255) catcatcccggcatcgtggccgatcaccacgcgggtgacggccacttcgcccgtgcgccggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcataggcaaaacccc < 6:243683‑M1/149‑149 (MQ=255) catcatcccggcatcgtggccgatcaccacgcgggtgacggccacttcgcccgtgcgccggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcataggcaaaacccc > 2:228349‑M1/1‑1 (MQ=255) | CATACCCGGCCCATGCAGACACAGGCCGAAGGTGATGTGCTGCGCGGCCGGG‑GTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGA > NC_002947/4452110‑4452396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |