New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4452248 | 41 (0.830) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.7% | coding (1852/3564 nt) | nicB | nicotinate dehydrogenase subunit B |
? | NC_002947 | = 4452306 | 32 (0.670) | coding (1910/3564 nt) | nicB | nicotinate dehydrogenase subunit B |
GGGGTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAGCAAGGAATGGGGCGGCTACCCGATCCTGACCTTCCCCGAGCTG > NC_002947/4452159‑4452454 | ggggTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATg < 6:243683‑M2/149‑2 (MQ=255) ggggTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATg > 2:228349‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAAccc > 6:158987/1‑149 (MQ=255) cTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAAcccc > 6:205402/1‑148 (MQ=255) tGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAgg < 7:43980/149‑1 (MQ=255) cgcTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGgtgt < 5:205402/149‑1 (MQ=255) cacaGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCAc > 1:289405/1‑147 (MQ=255) cacaGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCAc > 1:302963/1‑147 (MQ=255) aGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCAc > 7:49901/1‑144 (MQ=255) aaTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCAc < 3:79328/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCTCGGTCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 5:233543/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 5:158987/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 1:208078/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACg < 8:130924/149‑1 (MQ=255) tCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGt < 5:243683/148‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCgg < 3:32193/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCggg < 4:174562/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTAc < 8:49901/149‑1 (MQ=255) tGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAg < 6:160369/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAgg < 7:222231/148‑1 (MQ=255) aGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcatag < 8:182238‑M2/146‑81 (MQ=255) aGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcatag > 7:182238‑M2/1‑66 (MQ=255) gACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGa < 7:144931/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGa > 8:28551/1‑89 (MQ=255) ccGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGa < 7:28551/89‑1 (MQ=255) gggCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAg < 6:24766/149‑1 (MQ=255) gTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAg > 2:180914/1‑149 (MQ=255) gCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATggtccactgcgacatcagccacccaggctgcccaggccgcgccgaagccgggaaatttactgtggatatagcgcgcataggcaaaaccccggccgcgcagcacatcac < 4:206692‑M2/149‑109 (MQ=255) ccGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATc > 2:116691/1‑79 (MQ=255) ccGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATc < 1:121223/79‑1 (MQ=255) ccGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATc < 1:116691/79‑1 (MQ=255) ccGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATc > 2:121223/1‑79 (MQ=255) gtgATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGc > 7:215819/1‑128 (MQ=255) gtgATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGc < 8:215819/128‑1 (MQ=255) gCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAGCAAGGAATGGGGCGGCTACCCGATc < 7:102261/149‑1 (MQ=255) ccACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGa < 2:113674/122‑1 (MQ=255) ccACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGa > 1:113674/1‑122 (MQ=255) aCGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAGCAAGGAATGGGGCGGCTACCCGATCCTg < 1:180914/149‑1 (MQ=255) atgGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAGCAAGGAATGGGGCGGCTACCCGATCCTGACCTTCCCCGAGCt > 1:165509/1‑149 (MQ=255) tgGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAGCAAGGAATGGGGCGGCTACCCGATCCTGACCTTCCCCGAGCTg > 1:301285/1‑149 (MQ=255) | GGGGTTTTGCCTATGCGCGCTATATCCACAGTAAATTTCCCGGCTTCGGCGCGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCTGATGTCGCAGTGGACCGGCGCACGGGCGAAGTGGCCGTCACCCGCGTGGTGATCGGCCACGATGCCGGGATGATGGTCAACCCCGAGGGTGTGCGTCACCAGATCCACGGTAACGTCATCCAGTCCACCAGCCGGGTACTCAAGGAGCAGGTCAGTTTCGAGGAATCGACAGTGGCGAGCAAGGAATGGGGCGGCTACCCGATCCTGACCTTCCCCGAGCTG > NC_002947/4452159‑4452454 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |