New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5841842 = | 44 (0.890) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.5% | coding (411/1431 nt) | calB | coniferyl aldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5841870 = | 44 (0.920) | coding (439/1431 nt) | calB | coniferyl aldehyde dehydrogenase |
AAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGG > NC_002947/5841695‑5841988 | gtcgaagggcaggcgggcgaaggcctggcccacctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccgGt < 7:58296‑M1/2‑1 (MQ=255) tcgaagggcaggcgggcgaaggcctggcccacctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccgGtt < 1:164011‑M1/3‑1 (MQ=255) tcgaagggcaggcgggcgaaggcctggcccacctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccgGtt > 8:185117‑M1/147‑149 (MQ=255) cgaagggcaggcgggcgaaggcctggcccacctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccgGTTg > 8:58296‑M1/146‑149 (MQ=255) aaCGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGGCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGcc < 6:51838/149‑1 (MQ=255) gCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCGGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGCACTACCCGTTCTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTg < 6:104905/149‑1 (MQ=255) cTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTgg < 1:176436/149‑1 (MQ=255) cgaaggcctggcccacctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccgGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGgcc < 5:234636‑M1/19‑1 (MQ=255) gATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGgccg > 3:63523/1‑149 (MQ=255) gATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGACCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGgccg > 7:288876/1‑149 (MQ=255) cgcAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGccgccg < 1:143072/148‑1 (MQ=255) ccgcGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGc > 2:36746/1‑149 (MQ=255) cgcgTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCt > 6:314388/1‑149 (MQ=255) gCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGc < 4:63523/147‑1 (MQ=255) cGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAg < 3:216544/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCa > 7:191418/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGc > 3:266673/1‑149 (MQ=255) cAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCTTCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGa > 1:228618/1‑149 (MQ=255) cAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGccc < 3:146642/145‑1 (MQ=255) cAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGccc > 4:146642/1‑145 (MQ=255) gcACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACggg < 3:123943/149‑1 (MQ=255) gggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccgGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCggg > 1:284153‑M1/78‑109 (MQ=255) gggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagaatgacccgGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCggg < 2:284153‑M1/32‑1 (MQ=255) gTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGc < 3:173326/128‑1 (MQ=255) gTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGc > 4:173326/1‑128 (MQ=255) cgcTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCt < 4:266673/149‑1 (MQ=255) cgcTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCt < 4:201834/149‑1 (MQ=255) cTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTATCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTgc < 1:36746/149‑1 (MQ=255) cTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTgc < 8:288876/149‑1 (MQ=255) tCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTgcag > 5:160540/1‑148 (MQ=255) cAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTgcagc > 2:283653/1‑148 (MQ=255) aCCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAAc > 7:2389/1‑149 (MQ=255) ggCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGa < 6:160540/149‑1 (MQ=255) cGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGc < 1:283653/149‑1 (MQ=255) cGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACGCT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCgtgtg > 1:241464/1‑149 (MQ=255) tcgtCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTcccc < 3:60006/146‑1 (MQ=255) cTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CTGGCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGc > 1:47103/1‑149 (MQ=255) cTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCgt > 5:113312/1‑124 (MQ=255) cTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCgt < 6:113312/124‑1 (MQ=255) cccGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTgca < 4:241049/105‑1 (MQ=255) cccGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTgca > 3:241049/1‑105 (MQ=255) ccGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTtgt > 3:99496/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTtgtg > 5:128840/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCg < 5:314388/148‑1 (MQ=255) ccTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGt > 6:101816/1‑148 (MQ=255) gCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAgg < 2:241464/148‑1 (MQ=255) gCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAg < 8:2389/147‑1 (MQ=255) ccATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTc > 1:273065/1‑149 (MQ=255) catgacccgGTTG‑C‑CG‑GCGGCCAGGGCGCAGGTCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTc < 6:234636‑M1/139‑1 (MQ=255) aTCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTc > 3:132794/1‑147 (MQ=255) tCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGGCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAg < 7:112758/149‑1 (MQ=255) tCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAg > 5:89061/1‑149 (MQ=255) ccGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTggg > 7:50963/1‑149 (MQ=255) | AAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAC‑CT‑GCGCCCTGGCCGCCGG‑CAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTCGAGGTGGG > NC_002947/5841695‑5841988 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |