New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 192172 | 31 (0.630) | 4 (0.090) | 4/238 | NT | 11.8% | coding (1346/2157 nt) | paxB | toxin secretion ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 192235 | 31 (0.680) | coding (1283/2157 nt) | paxB | toxin secretion ATP‑binding protein |
CGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTCACGCGCAGTTCCAG > NC_002947/192088‑192380 | cGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTa > 6:11391‑M2/1‑148 (MQ=255) gCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTag < 3:299613‑M2/148‑3 (MQ=255) gCGGGCGTTCTTCGAAGGTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTagcaagcc > 6:256400‑M2/1‑141 (MQ=255) gTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAgg > 8:285662/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAgg > 1:18013/1‑149 (MQ=255) cgcTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGTCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCa < 6:163415/148‑1 (MQ=255) cgcTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAg < 2:266836/149‑1 (MQ=255) gcTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAgg < 6:100525/149‑1 (MQ=255) gcTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAgg < 7:223598/149‑1 (MQ=255) gCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGcc < 4:299613/148‑1 (MQ=255) tgGACGGTGGAGACCATGGTCACCATGGCTAGCTGGTAGCGCGCCAGCAGGCCCTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTaccc > 1:120840/1‑147 (MQ=255) gTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGc > 4:234485/1‑149 (MQ=255) gagaCCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACg > 6:98687/1‑147 (MQ=255) aTGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcg < 1:66256‑M2/148‑67 (MQ=255) ggTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTg > 5:149779/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcgaagaac > 2:66256‑M2/1‑76 (MQ=255) aCCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCAc > 2:182257/1‑149 (MQ=255) gCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcgaagaacgcccgctgagc < 7:133701‑M2/149‑84 (MQ=255) cTGGTAGGGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCATCGGGGCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCTTGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGtt < 2:120840/149‑1 (MQ=255) gTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCTGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCt < 2:18013/149‑1 (MQ=255) tAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCt > 3:76085/1‑148 (MQ=255) tAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCt < 4:76085/148‑1 (MQ=255) cagcagGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTGAAGCATGTAGCAAGCCCCCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATcag > 1:69365/1‑148 (MQ=255) agcagGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATcagcag > 6:15337/1‑149 (MQ=255) gcagGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTCGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGGTCAGGTTGCCGGCGATGATCAGGTACCCGCCGACGCAGATCATTGCCCCGCCTGCCAGTTGCGGGATCAGCAgg > 3:99521/1‑149 (MQ=255) cagGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTg < 6:77679/138‑1 (MQ=255) cagGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTg > 5:77679/1‑138 (MQ=255) ggCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGt > 3:309838/1‑148 (MQ=255) ggCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGt > 8:243529/1‑148 (MQ=255) cGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATg < 4:309838/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTagcaagccaaggtgaccatggtctccaccgaccacatgatggatctaccgcaagagcgcaacttcgaagaacgcccgctgagccgcaaggtgctgcagggcagcg > 8:133701‑M2/1‑44 (MQ=255) gCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCa < 3:234485/149‑1 (MQ=255) cccAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACCCGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAg > 1:234544/1‑149 (MQ=255) ccAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACTCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAgg > 4:117738/1‑149 (MQ=255) aaCGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGt < 4:99378/136‑1 (MQ=255) aaCGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGt > 3:99378/1‑136 (MQ=255) cACGGCCGCTT‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTc < 2:56799/149‑1 (MQ=255) gCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTCACGCGCa < 6:149779/149‑1 (MQ=255) gCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTCACGCGCa < 7:243529/149‑1 (MQ=255) aGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTCACGCGCAGtt < 7:292603/148‑1 (MQ=255) aTGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGAt > 5:259889/1‑107 (MQ=255) aTGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGAt < 6:259889/107‑1 (MQ=255) aTGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTCACGCGCAGTTCCAg > 5:297750/1‑149 (MQ=255) tAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGAc < 2:136075/123‑1 (MQ=255) tAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGAc > 1:136075/1‑123 (MQ=255) | CGGCTCAGCGGGCGTTCTTCGAAGTTGCGCTCTTGCGGTAGATCCATCATGTGGTCGGTGGAGACCATGGTCACCTTGGCTTGCTGGTAGCGGGCCAGCAGGCCGTTGAGCTGGCCCAACGGGCCGAGGGCACGGCCGCTG‑AGCATGTAGCAAGCCACCAGGCCGCCCATGCTCAGGTTGCCGTCGATGATCAGGTACACGCCGACGCAGATCATTGCCACGCCTGCCAGTTGCTGGATCAGCAGGGTGATGTTCATCGCCAGGCTCGACAGCACTTTCACGCGCAGTTCCAG > NC_002947/192088‑192380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |