| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 259606 = | 68 (1.380) | 4 (0.080) | 3/246 | NT | 6.4% | coding (1140/1407 nt) | PP_0207 | nitrate ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 259644 = | 52 (1.100) | coding (1178/1407 nt) | PP_0207 | nitrate ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
AGGCGCTGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTGCTCAAGGACC > NC_002947/259497‑259790 | ttgcgcacgaaccaggcctggttggcgagcaatttgatgccactgtcggcggcctgggcgtagatggcgcggatgtccttgccctcctgctccagctgggccaaggcacCAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGt > 3:95846‑M1/110‑149 (MQ=255)aGGCGCTGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGt < 3:49563/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTg < 3:86836/149‑1 (MQ=255) cgcTGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGcc < 8:33008/149‑1 (MQ=255) gcacgaaccaggcctggttggcgagcaatttgatgccactgtcggcggcctgggcgtagatggcgcggatgtccttgccctcctgctccagctgggccaaggcacCAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGt > 8:12961‑M1/106‑145 (MQ=255) gcacgaaccaggcctggttggcgagcaatttgatgccactgtcggcggcctgggcgtagatggcgcggatgtccttgccctcctgctccagctgggccaaggcacCAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGt < 7:12961‑M1/40‑1 (MQ=255) gcTGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCt > 2:141610/1‑149 (MQ=255) tGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTg > 1:162162/1‑149 (MQ=255) aaaGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTgtcctgca > 3:178643/1‑142 (MQ=255) aaaGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTgg < 5:305470/148‑1 (MQ=255) aaaGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTgg < 4:169928/148‑1 (MQ=255) aaaGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTg < 1:137283/147‑1 (MQ=255) aaaGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTg < 6:306574/147‑1 (MQ=255) aaaGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGGGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGc < 5:112437/149‑1 (MQ=255) cgacgTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTgg < 5:147219/149‑1 (MQ=255) cgacgTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTgg < 1:141610/149‑1 (MQ=255) gacgTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTg > 5:226185/1‑147 (MQ=255) ccACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCaggagg < 6:226185/148‑1 (MQ=255) aCTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCa < 2:12112/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCtt > 1:149900/1‑124 (MQ=255) tCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCtt < 2:149900/124‑1 (MQ=255) aaGGGCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCGCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAggg > 7:235998/1‑148 (MQ=255) aaGGCCGTTGACGCGCTGACCGGCCATCAGATCAGCGACTTCAGCGGCCTGGCGCTGAGCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGGCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAg < 3:222499/147‑1 (MQ=255) aaGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTgg < 3:219207/116‑1 (MQ=255) aaGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTgg > 4:219207/1‑116 (MQ=255) aaGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGa > 8:51536/1‑149 (MQ=255) gcTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCaggagg > 3:255226/1‑128 (MQ=255) gcTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCaggagg < 4:255226/128‑1 (MQ=255) tGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTAc > 5:202419/1‑149 (MQ=255) gACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACg > 5:150932/1‑149 (MQ=255) aaCCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGgcc > 1:31125/1‑149 (MQ=255) gATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTg > 3:270003/1‑94 (MQ=255) aTCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGa < 2:162162/149‑1 (MQ=255) tCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGc > 4:292144/1‑105 (MQ=255) aCCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAg > 2:296793/1‑149 (MQ=255) aCCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAg > 5:69824/1‑149 (MQ=255) cGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTg < 7:51536/149‑1 (MQ=255) gACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTgg < 2:31125/149‑1 (MQ=255) ccgccTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAAt > 7:175180/1‑149 (MQ=255) gccTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTg < 6:69824/149‑1 (MQ=255) gcAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGcc > 6:291308/1‑148 (MQ=255) gggTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGc > 7:187206/1‑83 (MQ=255) gggTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGc < 8:187206/83‑1 (MQ=255) ggTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGcc < 6:150932/148‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTc < 1:296793/149‑1 (MQ=255) gTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGGCATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTg < 8:235998/149‑1 (MQ=255) tGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCaaa > 8:11596/1‑121 (MQ=255) tGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCaaa < 7:11596/121‑1 (MQ=255) aGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTgcgc > 2:16044/1‑148 (MQ=255) gACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCaa > 5:85747/1‑149 (MQ=255) gACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCaa > 7:55957/1‑149 (MQ=255) accaagggcggcctccggcgaagtgtagtggcggaccttgGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTgc > 8:12961‑M2/41‑145 (MQ=255) accaagggcggcctccggcgaagtgtagtggcggaccttgGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTgc < 7:12961‑M2/105‑1 (MQ=255) accaagggcggcctccggcgaagtgtagtggcggaccttgGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCaa > 3:95846‑M2/41‑149 (MQ=255) aagggcggcctccggcgaagtgtagtggcggaccttgGTGCCTTGGCCAAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACACTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGCTTCCTTCGCAACgg > 3:16911‑M2/38‑149 (MQ=255) AAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAggg < 7:195310‑M1/65‑1 (MQ=255) AAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAggg > 8:195310‑M1/1‑65 (MQ=255) AGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGt > 5:78871‑M1/1‑149 (MQ=255) AGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGt > 3:44895‑M1/1‑149 (MQ=255) GGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGt < 2:137659‑M1/148‑1 (MQ=255) GGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGt < 7:111923‑M1/148‑1 (MQ=255) GGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTa > 6:276384‑M1/1‑149 (MQ=255) cGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAg < 1:16044/148‑1 (MQ=255) gCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACTTCAGAGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAggg < 7:203376/149‑2 (MQ=255) ccACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCg < 6:202419/149‑1 (MQ=255) aCTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGaa > 3:81821/1‑149 (MQ=255) aCTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGaa > 6:10281/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTg > 5:79782/1‑146 (MQ=255) cTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTg < 6:79782/146‑1 (MQ=255) gCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCAt < 8:111923/149‑1 (MQ=255) cGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTc < 5:291308/149‑1 (MQ=255) aGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTg < 1:137659/149‑1 (MQ=255) gccCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCGATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAg < 8:99172/124‑1 (MQ=255) gccCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAg > 7:99172/1‑124 (MQ=255) gccCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTGCTc > 3:209506/1‑147 (MQ=255) ccttgGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTGCTCAAgg < 4:81821‑M2/144‑1 (MQ=255) cttgGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACC‑GGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTGCTCAAGGAc > 1:178547‑M2/5‑149 (MQ=255) gGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTGCTCAAGGAcc < 8:55957‑M2/147‑1 (MQ=255) | AGGCGCTGAAAGACTACGACGTACTGCCACTCAAGGCCGATGACGCGCTGACCGGCCAACCGATCACCGACTTCAGCCGCCTGGCGCAGATCTGGGTGCGCGGTGAAGACAAGGTCCGCCACTACACTTCGCCGGAGGCCGCCCTTGGTGCCTTGGCCCAGCTGGAGCAGGAGGGCAAGGACATCCGCGCCATCTACGCCCAGGCCGCCGACAGTGGCATCAAATTGCTCGCCAACCAGGCCTGGTTCGTGCGCAACGGTAAAGGCGAACTGGCGGCATTCCTGCTCAAGGACC > NC_002947/259497‑259790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |