| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 822269 = | 59 (1.200) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.8% | coding (1640/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 822299 = | 42 (0.890) | coding (1670/2412 nt) | PP_0707 | hypothetical protein | |||||
GATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAAC > NC_002947/822153‑822444 | gATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTAGCCATcc > 3:251076/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATcc < 8:57158/148‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATcc < 6:21607/148‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCgt > 8:88842/1‑149 (MQ=255) tGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCgt < 5:259854/149‑1 (MQ=255) aggaacaggaaacccaggtaacccaccagggtcaccagcgaggcccgcatgccggcgtccatctcggtttccggcagcaggcggtcgctcagccagcgcttgaccacacggaTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCgtgt > 8:179105‑M1/113‑149 (MQ=255) gggTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTc > 5:116392/1‑148 (MQ=255) gTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAg > 5:5516/1‑149 (MQ=255) cccTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCgctggc > 5:185586/1‑149 (MQ=255) tAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCgctggct > 2:5172/1‑147 (MQ=255) gCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGa < 6:112298/147‑1 (MQ=255) gCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGa < 2:182040/147‑1 (MQ=255) aTTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGAcc < 1:146881/149‑1 (MQ=255) accagggtcaccagcgaggcccgcatgccggcgtccatctcggtttccggcagcaggcggtcgctcaaccagcgcttgaccacacggaTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCAt > 6:321677‑M1/89‑119 (MQ=255) accagggtcaccagcgaggcccgcatgccggcgtccatctcggtttccggcagcaggcggtcgctcaaccagcgcttgaccacacggaTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCAt < 5:321677‑M1/31‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGc < 7:88842/148‑1 (MQ=255) tGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCctg > 3:289533/1‑149 (MQ=255) ttGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCctgct < 1:5172/149‑1 (MQ=255) aGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGcc < 3:262204/149‑1 (MQ=255) tCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCg > 5:270472/1‑148 (MQ=255) ggCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGaaa < 4:150711/148‑1 (MQ=255) ggCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGaa < 6:185586/147‑1 (MQ=255) cGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCg < 4:152616/149‑1 (MQ=255) tgggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGAt > 5:105056/1‑149 (MQ=255) ggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGAt < 6:270472/147‑1 (MQ=255) ggatgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGAt < 6:73653/147‑1 (MQ=255) atgggaCCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGAc < 6:136806/149‑1 (MQ=255) cggcggAAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACAGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCa > 7:94994/1‑149 (MQ=255) gcggcAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATg > 5:165682/1‑149 (MQ=255) gcAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCgg < 3:181302/149‑1 (MQ=255) tGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCg < 4:289533/149‑1 (MQ=255) ggCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGt > 7:265583/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCg < 3:296239/136‑1 (MQ=255) gCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCg > 4:296239/1‑136 (MQ=255) cAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGa < 6:165682/149‑1 (MQ=255) aaCCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTgg > 5:113702/1‑145 (MQ=255) aaCCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTgg < 6:113702/145‑1 (MQ=255) aCCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGAcc > 1:173419/1‑149 (MQ=255) gAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCg < 1:175936/103‑1 (MQ=255) gAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCg > 2:175936/1‑103 (MQ=255) gAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCAGGTAAcccac > 4:285183/1‑146 (MQ=255) tGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTAc < 2:173419/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTAcc > 7:204173/1‑149 (MQ=255) cGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTg > 7:269819/1‑149 (MQ=255) gCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTgg < 3:156949/149‑1 (MQ=255) gACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTCGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGttt > 1:93924/1‑149 (MQ=255) acacggatggcgaacaggccaccgaggaagatcgccaTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTttcctgttcct > 8:179105‑M2/38‑149 (MQ=255) gCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTttcctgttcctg < 2:93924/147‑1 (MQ=255) cTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCa > 7:38970/1‑149 (MQ=255) atggcgaacaggccaccgaggaagatcgccaTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGTTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCtggt > 6:321677‑M2/32‑119 (MQ=255) atggcgaacaggccaccgaggaagatcgccaTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGTTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCtggt < 5:321677‑M2/88‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGt < 8:265583/144‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGa < 6:105056/146‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGc < 8:38970/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCg > 2:122502/1‑149 (MQ=255) ttCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGt < 6:5516/147‑1 (MQ=255) gccaTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGTCATGCGGGCCTCGCTGGTGACACTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCa > 8:235732‑M2/5‑148 (MQ=255) gccaTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTGACCTGGGTTTGCTGTTGCTGGCGATGTTGGTGATGTGGACCTTGCGTATcat > 8:249925‑M2/5‑148 (MQ=255) ccaTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGCTGATTTAGAACTTGCGTAtcaca > 6:222973‑M2/4‑147 (MQ=255) caTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCct > 2:82363‑M2/3‑36 (MQ=255) caTCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCct < 1:82363‑M2/34‑1 (MQ=255) | GATGCCGTCGGGTACCAGCCCTAGCGAATTGCTGTTGAGTCTGGGCGACTGGGATGGGACCGGCGGCAAGGTGCTCGGCAACCTGAACATCGTGCCGCAGGACATCCTGCTGGCCTTGGCGATCTTCCTCGGTGGCCTGTTCGCCATCCGTGTGGTCAAGCGCTGGCTGAGCGACCGCCTGCTGCCGGAAACCGAGATGGACGCCGGCATGCGGGCCTCGCTGGTGACCCTGGTGGGTTACCTGGGTTTCCTGTTCCTGGCCATGTTGGTGATGTCGACCTTGCGTATCAAC > NC_002947/822153‑822444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |