New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 893784 | 53 (1.070) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 7.9% | coding (265/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 893815 | 43 (0.920) | coding (234/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
GTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGG > NC_002947/893668‑893958 | gTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTt > 5:63013‑M2/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGAGGTGTt < 7:214308‑M2/149‑2 (MQ=255) gCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTtgcgca < 4:96155‑M2/149‑7 (MQ=255) gACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGt > 4:11877/1‑149 (MQ=255) acacCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGtt < 8:75866/149‑1 (MQ=255) cacCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTtg < 4:108125/149‑1 (MQ=255) cAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGc > 6:65648/1‑149 (MQ=255) tggtgtcggCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCgg < 8:126267/144‑1 (MQ=255) gtcggtcgGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCggg < 3:96155/149‑1 (MQ=255) ggCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGc < 1:23316/148‑1 (MQ=255) aaTGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAg > 2:139780/1‑149 (MQ=255) tGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAggg < 7:89401/149‑1 (MQ=255) tGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAggg > 3:10595/1‑149 (MQ=255) aaaaaTGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGc > 3:32271/1‑149 (MQ=255) tGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGtgcctgc > 7:157368/1‑148 (MQ=255) cATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCAc > 7:34249/1‑149 (MQ=255) aTGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGt < 7:173111/122‑1 (MQ=255) aTGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGt > 8:173111/1‑122 (MQ=255) tcGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtggtgg > 8:91616/1‑149 (MQ=255) tcGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCt < 3:279842/144‑1 (MQ=255) tcGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCt > 4:279842/1‑144 (MQ=255) cGAAATAAGCGTTTCAAGAATTTAGCGGTCAAGGGTATCGCTATCGTCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTTCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACACAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGgc < 8:143632/149‑1 (MQ=255) gAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtggtg < 3:11877/146‑1 (MQ=255) gAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtggtg < 8:34249/146‑1 (MQ=255) aTAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCAcgg < 2:75354/134‑1 (MQ=255) aTAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCAcgg > 1:75354/1‑134 (MQ=255) gTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg > 2:311915/1‑149 (MQ=255) gTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg < 8:157368/149‑1 (MQ=255) tGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTggg < 4:32271/149‑1 (MQ=255) gAAATTTGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCGCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATgg < 7:91616/149‑1 (MQ=255) gCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCAc < 5:65648/148‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGaaa < 4:10595/149‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGaaa < 1:139780/149‑1 (MQ=255) aaGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGTTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAt < 4:260338/134‑1 (MQ=255) aaGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGTTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAt > 3:260338/1‑134 (MQ=255) gggTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTcc < 1:186304/149‑1 (MQ=255) gcTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCAcc > 3:55692/1‑148 (MQ=255) gCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGcc > 1:49072/1‑149 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTc < 6:229927/63‑1 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTc > 5:229927/1‑63 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCctt > 5:288459/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCcttct > 1:43483/1‑149 (MQ=255) ttGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttcgagaagcacgcatgcagacatttttcattgcgccgaccgactttggtgtc < 2:269248‑M2/149‑110 (MQ=255) tgtgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCttcttc > 6:26165/1‑149 (MQ=255) gtgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttcgagaagcacgcatgcagacatttttcattgcgccgaccgactttggtgtc > 1:269248‑M2/1‑38 (MQ=255) gtgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttcgagaagcacgcatgcagacatttttcatt < 4:301850‑M2/126‑89 (MQ=255) gtgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTtgcgcacaaggggccgatagcgctacccttgaccgctaatttcttgcaccgcttatttcgagaagcacgcatgcagacatttttcatt > 3:301850‑M2/1‑38 (MQ=255) tgCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGt < 4:55692/149‑1 (MQ=255) cgcACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTc < 2:9124/148‑1 (MQ=255) cccaaaGGCTGGCCGATGTCGAGCGCACGTTGTGCCGGGTCGCGCACCCATCGGCGTGCCAGCCACGCCGGCTGGTGGCGCAGTTGCAGGGTATGGCCGCACGAAAGATCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGtt < 4:222874/146‑1 (MQ=255) ggCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACt > 7:129872/1‑148 (MQ=255) ccGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTCATCCGACTGAt > 8:171113/1‑149 (MQ=255) aTGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATggg < 7:171113/149‑1 (MQ=255) | GTCAGGCCGACACCAAAGTCGGTCGGCGCAATGAAAAATGTCTGCATGCGTGCTTCTCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATGGG > NC_002947/893668‑893958 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |