New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2275170 = | 67 (1.360) | 5 (0.110) | 5/240 | NT | 8.5% | coding (320/1119 nt) | PP_2005 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2275244 = | 45 (0.970) | coding (246/1119 nt) | PP_2005 | hypothetical protein |
CGGGTTGCTCAGTTCCAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGCCATGGTTAAGCGCCAGTTCGATGCGCAGG > NC_002947/2275097‑2275385 | cactgctgtaccccggcgactatcaaaacctgcaacgcctgcaccgcaagctcgcagcctatctggagcaagccCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCgg > 2:139727‑M1/75‑149 (MQ=255) cTCAGTTCCAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCTGAAACTCCGCCCGCCCACAGCCAGGTACAGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCCCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCATGCt > 1:249143/1‑149 (MQ=255) cTCAGTTCCAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTc > 4:139173/1‑149 (MQ=255) tCAGTTCCAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTc > 1:141508/1‑148 (MQ=255) tCAGTTCCAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTc > 3:179301/1‑148 (MQ=255) ccAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATa < 2:88885/148‑1 (MQ=255) cAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAgg > 1:99861/1‑149 (MQ=255) aGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGc > 1:268779/1‑149 (MQ=255) cATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGc > 6:77172/1‑149 (MQ=255) cATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGc > 3:33087/1‑149 (MQ=255) gggCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTg > 2:263901/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAg < 4:32056/149‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCa < 3:239407/147‑1 (MQ=255) ggCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCa > 4:239407/1‑147 (MQ=255) gCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAgg < 6:186290/148‑1 (MQ=255) tGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGtt < 5:77172/148‑1 (MQ=255) gggTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTg < 2:249143/148‑1 (MQ=255) ggTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTg > 5:24377/1‑147 (MQ=255) gTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAg > 7:237996/1‑149 (MQ=255) cTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGttt < 6:22481/149‑1 (MQ=255) cTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGttt > 1:204714/1‑149 (MQ=255) gATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAg > 1:269996/1‑133 (MQ=255) gATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAg < 2:269996/133‑1 (MQ=255) aTACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGa < 8:46722/148‑1 (MQ=255) aTACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGa < 8:237996/148‑1 (MQ=255) aTACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGAt < 7:85499/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAg < 2:204714/148‑1 (MQ=255) cTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGc > 8:286399/1‑149 (MQ=255) gTTCT‑TCTCTCCGCGCTGCCTCTGCAAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCAGCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGGGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGAGAGCTTGCGGTGCTGGCGTTGCAGGTTTTGATTGTCGCCg < 8:278096/148‑1 (MQ=255) ttct‑tcTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCggg < 2:268779/149‑1 (MQ=255) t‑tctCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTa > 3:130329/1‑149 (MQ=255) tctcCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTAcag > 6:182142/1‑149 (MQ=255) gcgcgcCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTg < 4:33087/149‑1 (MQ=255) ccgcgcccaaggcctggtgaacccgcgcaccgtggtggtgctgccggaacacatcggtacctggctgtgggcgcgGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTg > 2:139727‑M2/76‑149 (MQ=255) cgcgcccaaggcctggtgaacccgcgcaccgtggtggtgctgccggaacacatcggtacctggctgtgggcgcgGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTgg > 8:173707‑M2/75‑149 (MQ=255) CGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTgg < 4:76051‑M1/149‑1 (MQ=255) gcccaaggcctggtgaacccgcgcaccgtggtggtgctgccggaacacatcggtacctggctgtgggcgcgGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTc < 7:173707‑M2/78‑1 (MQ=255) GCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTc > 4:95623‑M1/1‑149 (MQ=255) CCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCg > 7:286399‑M1/1‑149 (MQ=255) caGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGacac < 4:179301/149‑1 (MQ=255) aggcctggtgaacccgcgcaccgtggtggtgctgccggaacacatcggtacctggctgtgggcgcgGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGacac > 3:125896‑M2/67‑149 (MQ=255) tACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAgg < 3:76051/149‑1 (MQ=255) gATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGc > 8:100035/1‑149 (MQ=255) tgtgTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCTCCACCGAGCAGGTTGCCg > 8:271893/1‑149 (MQ=255) gtTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGt > 2:212952/1‑122 (MQ=255) gtTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGt < 1:212952/122‑1 (MQ=255) gtTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGc > 5:242049/1‑149 (MQ=255) agcaCCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCgg < 2:141508/149‑1 (MQ=255) gcaCCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCgg > 2:51401/1‑148 (MQ=255) ccaccacGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACg > 8:196088/1‑149 (MQ=255) caccacGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGc < 2:99861/149‑1 (MQ=255) accacGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGcc < 5:182142/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCCTTGGGCGCTGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTTGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGCCATGGTTAAGCGCCAGtt < 6:24377/148‑1 (MQ=255) cctggctgtgggcgcgGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGCCATGGTTAAGCGCCAGTTc < 1:139727‑M2/132‑1 (MQ=255) gggcgcgGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGCCATGGTTAAGCGCCAGTTCGATGCGCAgg > 2:146933‑M2/8‑149 (MQ=255) | CGGGTTGCTCAGTTCCAGCCATTGTCGGGCTTCGTGGCTTTGGGTGACTTGATACAGCTCGTTCT‑TCTCTCCGCGCGCCCACAGCCAGGTACCGATGTGTTCCGGCAGCACCACCACGGTGCGCGGGTTCACCAGGCCTTGGGCGCGGGCTTGCTCCAGATAGGCTGCGAGCTTGCGGTGCAGGCGTTGCAGGTTTTGATAGTCGCCGGGGTACAGCAGTGGTTCGACACCGAGCAGGTTGCCGTGCTCGCCCGGTACGCCATGGTTAAGCGCCAGTTCGATGCGCAGG > NC_002947/2275097‑2275385 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |