New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3039828 = | 40 (0.810) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 8.4% | coding (913/1344 nt) | PP_2651 | MFS transporter |
? | NC_002947 | 3039879 = | 27 (0.570) | coding (964/1344 nt) | PP_2651 | MFS transporter |
GACCTGGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGAACATGGCCAGCTCTAC > NC_002947/3039734‑3040027 | gcaggaagccgctaccgaacgacaggggaacggtgaatgcagccgccgcgagcaacgcagtcacgacaacccgcttgcggctacccagcacactGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAgt > 2:282710‑M1/95‑148 (MQ=255) ggaagccgctaccgaacgacaggggaacggtgaatgcagccgccgcgagcaacgcagtcacgacaacccgcttgcggctacccagcacactGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGc > 2:89483‑M1/92‑149 (MQ=255) gggCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTggg < 1:285972/144‑1 (MQ=255) gggCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTggg > 2:285972/1‑144 (MQ=255) ttCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTggg < 4:12181/137‑1 (MQ=255) ttCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTggg > 3:12181/1‑137 (MQ=255) cgcgAGCATGCCAAGAGACTGAATCTGACCGCCTGGCTGGTTTCGCTCGCCTAACTGTACGGCGCGATGGGCACCATTGTCGCCGGCCGCATCTTCGACCGACTGGTGAAGCAAGGTGCCAGAGTCCAGCGTAGACGCAAGCGGCTTg > 4:72177/1‑148 (MQ=255) gAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGt > 2:2289/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGt < 3:240673/149‑1 (MQ=255) ttGAGCCTGTACCAGACCGCCTGAGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGtt > 1:34140/1‑149 (MQ=255) tACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCgcggc > 5:182798/1‑149 (MQ=255) aGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCt < 1:196641/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCaa > 4:17110/1‑110 (MQ=255) gCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCaa < 3:17110/110‑1 (MQ=255) gggTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCAcc > 7:244140/1‑149 (MQ=255) ggtggtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCAc < 5:196182/147‑1 (MQ=255) ggtggtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCg > 4:176046/1‑149 (MQ=255) ggtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTc > 5:22360/1‑149 (MQ=255) ggtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTc < 8:244140/149‑1 (MQ=255) gtTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTcc < 1:2289/149‑1 (MQ=255) tttCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTccc < 3:176046/149‑1 (MQ=255) cTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTc < 6:182798/149‑1 (MQ=255) tgtTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGc > 1:283521/1‑149 (MQ=255) gtTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCg > 3:188986/1‑149 (MQ=255) gcacactggcaccttgcttcaccaggcggtcgcagatgcggcccgcgacaatggtgccAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTcc > 2:89483‑M2/59‑149 (MQ=255) actggcaccttgcttcaccaggcggtcgcagatgcggcccgcgacaatggtgccAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGc > 2:282710‑M2/55‑148 (MQ=255) CACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCg < 6:295770‑M1/128‑1 (MQ=255) CACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCg > 5:295770‑M1/1‑128 (MQ=255) ACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAgtgt < 3:166895‑M1/149‑1 (MQ=255) gcttcaccaggcggtcgcagatgcggcccgcgacaatggtgccAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGgc < 1:89483‑M2/104‑1 (MQ=255) gggCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCtgt < 4:188986/149‑1 (MQ=255) aTCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTgcgc > 1:288893/1‑149 (MQ=255) tcGACCGGCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGTTAGGCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGtgtg < 3:197405/127‑1 (MQ=255) gCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCCTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGATCGGTAGCGGATTCCTCCTCAgtgtc > 4:197405/1‑127 (MQ=255) gTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGaa > 3:236594/1‑149 (MQ=255) aGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGAACATg < 2:288893/149‑1 (MQ=255) aGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGAACATGGCCa < 4:166895/149‑1 (MQ=255) ccAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGAACATGGCCAGctc > 3:247499‑M2/3‑148 (MQ=255) aGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGAACATGGCCAGCTCTAc < 2:283521/149‑1 (MQ=255) | GACCTGGCTGCCGGGCTACTTCGAACGCGAGCATGGCTTGAGCCTGTACCAGACCGCCTGGGTGGTTTCGCTGGCCTATGTGTTCGGCGCGTTGGGCACCATTGTCGCGGGCCGCATCTGCGACCGCCTGGTGAAGCAAGGTGCCAGTGTGCTGGGTAGCCGCAAGCGGGTTGTCGTGACTGCGTTGCTCGCGGCGGCTGCATTCACCGTTCCCCTGTCGTTCGGTAGCGGCTTCCTGCTCAGTGTGGCGCTGCTGTGTTGCGCGCTGTTCAGCGTGAACATGGCCAGCTCTAC > NC_002947/3039734‑3040027 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |