New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3552652 | 32 (0.650) | 3 (0.070) | 3/238 | NT | 8.9% | coding (309/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | = 3552675 | 32 (0.700) | coding (332/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
CCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCT > NC_002947/3552534‑3552823 | ccgccgCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCcgccgtg < 2:112501‑M2/149‑8 (MQ=255) ccgccgCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCcgccgtg < 1:80561‑M2/149‑8 (MQ=255) cgccgcACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCcgccgtgg < 7:242500‑M2/149‑9 (MQ=255) cgcgCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAgtggt < 7:95058/149‑1 (MQ=255) gcCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGgtgtg > 6:54057/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGc < 8:242500/149‑1 (MQ=255) aTGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGc > 7:37931/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGc < 2:80561/149‑1 (MQ=255) aaGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCgg > 7:40945/1‑149 (MQ=255) gccTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCtt < 3:270762/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTcc > 3:178338/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTcc < 8:37931/149‑1 (MQ=255) cTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTc < 5:184621/149‑1 (MQ=255) gATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACt < 6:106801/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCtg > 2:20809/1‑149 (MQ=255) tACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGAc < 8:40945/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCt > 4:122373/1‑149 (MQ=255) gTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGgtgtg < 3:264936/90‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGgtgtg > 4:264936/1‑90 (MQ=255) gTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTgg < 5:54057/149‑1 (MQ=255) gtcgATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTg < 1:20809/149‑1 (MQ=255) cgATGGCGACTGCGAGGTGGATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTgg > 7:28011/1‑148 (MQ=255) gACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGGCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATAccc > 1:237367/1‑149 (MQ=255) gAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtc < 7:233866/147‑1 (MQ=255) gAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtc > 8:233866/1‑147 (MQ=255) aGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt < 2:237367/149‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt > 3:278832/1‑147 (MQ=255) gctggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGTCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCtgtg < 3:110514/149‑1 (MQ=255) gctggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCtgtg < 1:112501/149‑1 (MQ=255) tggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGCGACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGc > 1:28479/1‑143 (MQ=255) tggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGc < 2:28479/142‑1 (MQ=255) gcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCcgccgtggccagccagctggcattcacctcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggc > 6:288927‑M2/1‑32 (MQ=255) gcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCcgccgtggccagccagctggcattcacctcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggc < 5:288927‑M2/119‑88 (MQ=255) ccACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCcgccgtggccagccagctggcattcacctcgcagtcgccatcgacgaactgtaccagctgcatcgatggcaacaggcgctgcaaggcggcaaaaccttcattgcgggcgcgtgcggcg < 7:117853‑M2/149‑119 (MQ=255) ggCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTAc < 1:165543/85‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTAc > 2:165543/1‑85 (MQ=255) aGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGGGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCt > 6:262485/1‑148 (MQ=255) agc‑aCCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGcc < 8:28011/149‑1 (MQ=255) ccgccgTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTtgct < 4:278832/149‑1 (MQ=255) | CCGCCGCACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGA‑GCAGC‑ACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCT > NC_002947/3552534‑3552823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |