New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4535677 | 48 (0.970) | 4 (0.090) | 4/240 | NT | 7.7% | intergenic (+204/‑611) | PP_4022/PP_4024 | hypothetical protein/transposase |
? | NC_002947 | = 4535712 | 51 (1.100) | intergenic (+239/‑576) | PP_4022/PP_4024 | hypothetical protein/transposase |
CCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGG > NC_002947/4535566‑4535848 | ccTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCAt < 3:12554/147‑1 (MQ=255) cTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCATACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCCGCATgcc < 4:265056‑M2/149‑4 (MQ=255) tGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccg < 3:88476‑M2/149‑5 (MQ=255) tGAAGCCCCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACACCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccg < 1:52586‑M2/149‑5 (MQ=255) aaGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccgcc < 8:177101‑M2/149‑7 (MQ=255) tGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTa < 7:177101/149‑1 (MQ=255) cccTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACt < 2:188894/149‑1 (MQ=255) cTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTgg > 8:103310/1‑149 (MQ=255) ttCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTggg > 7:93059/1‑149 (MQ=255) cGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTggg < 2:24397/147‑1 (MQ=255) cGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCa > 5:270722/1‑149 (MQ=255) gAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCAc > 8:215399/1‑149 (MQ=255) aCTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCAcc > 1:317365/1‑148 (MQ=255) cGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAg > 8:253916/1‑148 (MQ=255) tAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCt > 2:7464/1‑148 (MQ=255) gAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCa < 4:88476/148‑1 (MQ=255) ccccTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTc > 7:282197/1‑149 (MQ=255) cccTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTcc < 8:93059/149‑1 (MQ=255) ccTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGTCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGTCCATGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTTGGAACCAACAAgacatcgc > 5:66789/1‑139 (MQ=255) ccTTACCCTCCTCATCCTGGAGCTGGTCGACTTGGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCAGGACCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACcaacaa < 6:66789/138‑1 (MQ=255) cTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCAc < 7:253916/149‑1 (MQ=255) cTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCAc > 3:206433/1‑149 (MQ=255) cccTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTtc < 7:103310/149‑1 (MQ=255) cctcctCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTtcg > 2:27152/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTtcggctcgg < 1:112481/148‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGTATTCATCGAAGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCAc < 5:319481/149‑1 (MQ=255) gtagCCTTCGTCGCTGGATTCATCTCCGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGTACCTGCTCACTCCCGGAATGAATCAGAACCAGGAACTGGGCACAAACAAGCTCAGATCCACCTACTCCTCGGCAACAGCAGGatt > 2:267984/4‑149 (MQ=255) gCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCAc < 2:52586/149‑1 (MQ=255) gcgtcgATGAATCCAGCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACctac > 7:83604/2‑149 (MQ=255) cgtcgCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTTGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACcta < 1:7464/147‑1 (MQ=255) cgtcgCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACcta < 8:181196/147‑1 (MQ=255) gATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACg > 8:71176/1‑148 (MQ=255) ttCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAAc < 5:61093/145‑1 (MQ=255) ttCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAAc > 6:61093/1‑145 (MQ=255) cATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCaaa < 1:27152/148‑1 (MQ=255) aTCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAAc < 8:171481/148‑1 (MQ=255) aTCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACt > 1:887/1‑149 (MQ=255) gACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGtt < 4:206433/149‑1 (MQ=255) gACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGt < 6:270722/148‑1 (MQ=255) aCGCCTTCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCTGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAACTCAGTTCCTCCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTc < 3:265056/149‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTcc < 2:317365/149‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCa > 6:250564/1‑149 (MQ=255) cATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAgg > 7:75238/1‑117 (MQ=255) cATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAgg < 8:75238/117‑1 (MQ=255) cgatctggtggcggCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccgccgccacgggcgatggcgtcgatgaatccagcgacgaaggcgaccagcgccaggatgaggagggtaaggggttctacggtgagttcgaaggg > 1:53169‑M2/7‑53 (MQ=255) ccGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGgcg > 5:159952/1‑149 (MQ=255) gTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccgccgccaccggcgatggcgtcgatgaatccagcgacgaaggcgaccagcgccagcatgaggaggctaaggggatctacgctgagatcgaagggcagatag < 2:53169‑M2/149‑104 (MQ=255) gcggcggcCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTg < 7:215399/148‑1 (MQ=255) cggcggcCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccgccgccaccggcgatggcgtcgatgaatccagcgacgaaggcgaccagcgccaggatgagg > 1:130246‑M2/1‑42 (MQ=255) cggcggcCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATgccgccgccaccggcgatggcgtcgatgaatccagcgacgaaggcgaccagcgccaggatgagg < 2:130246‑M2/106‑65 (MQ=255) gcggcCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGgcgc < 8:282197/149‑1 (MQ=255) cacTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCg > 1:170990/1‑149 (MQ=255) cGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCAcc < 7:71176/149‑1 (MQ=255) cTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAAc < 8:174245/100‑1 (MQ=255) cTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAAc > 7:174245/1‑100 (MQ=255) aCTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCggg < 8:535/147‑1 (MQ=255) cGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCa > 1:291262/1‑131 (MQ=255) cGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCa > 1:286695/1‑131 (MQ=255) cGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCa < 2:291262/131‑1 (MQ=255) cGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCa < 2:286695/131‑1 (MQ=255) | CCTGAAGCCTCCCATGCCCTTCGAACTCACCGTAGAACCCCTTACCCTCCTCATCCTGGCGCTGGTCGCCTTCGTCGCTGGATTCATCGACGCCATCGCCGGTGGCGGCGGCCTGCTCACCACTCCGGCCCTGCTCACTGCCGGCATGCCGCCGCACCTGGTACTGGGCACCAACAAGCTCAGTTCCACCTTCGGCTCGGCCACTGCAGGTTTCACCTACTACAAACGCAAACTGTTCCATCCGGCGCAGTGGCGCCCGGCATTGTTCGCCACCCTGACCGGG > NC_002947/4535566‑4535848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |