New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4782678 = | 47 (0.950) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.3% | coding (4636/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4782724 = | 43 (0.900) | coding (4590/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
TGCATCAGATAGATGCCCGAACCCGGTTCGAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAGGTCCAGTCCAGGCGCAGCTC > NC_002947/4782578‑4782870 | gaccatcgagcaactcgccagccggtatcagcaggcgttgcgcgaggtcatcgagcactgcgtggaacctgaggcgcaaggcattacgccaagcgacttcCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGaa > 4:92076‑M1/101‑149 (MQ=255) gatagatGCCCGAACCCGGTTCGAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCtt > 6:270701/1‑149 (MQ=255) cccGGTTCGAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTg < 3:127254/149‑1 (MQ=255) cGGTTCGAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTgcg < 1:282897/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAg < 4:205104/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAg < 4:201105/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGt > 8:82196/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGt < 5:72210/149‑1 (MQ=255) aaGGGGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTc < 8:114456/149‑1 (MQ=255) aGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTcc < 8:214382/149‑1 (MQ=255) ggTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCCATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCa > 1:100702/1‑149 (MQ=255) agcagcCCTTCCTGCATCAGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTc > 5:126712/1‑149 (MQ=255) cagcCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGcc < 2:301774/127‑1 (MQ=255) cagcCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGcc > 1:301774/1‑127 (MQ=255) cagcCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGa < 5:202704/149‑1 (MQ=255) cTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTcgc > 8:30063/1‑149 (MQ=255) tGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTcgcg > 6:311093/1‑149 (MQ=255) tgcgtggaacctgaggcgcaaggcattacgccaagcgacttcCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCtt > 6:178198‑M1/43‑98 (MQ=255) tgcgtggaacctgaggcgcaaggcattacgccaagcgacttcCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCtt < 5:178198‑M1/56‑1 (MQ=255) gCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGcc > 2:52553/1‑149 (MQ=255) gACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCctg < 5:270701/149‑1 (MQ=255) aCAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCctgc < 7:30063/149‑1 (MQ=255) aTGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCt > 4:96872/1‑149 (MQ=255) cTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGc > 2:21704/1‑148 (MQ=255) ttCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCctgc < 1:293385/133‑1 (MQ=255) ttCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCctgc > 2:293385/1‑133 (MQ=255) ttCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCctg < 3:263215/132‑1 (MQ=255) ttCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCctg > 4:263215/1‑132 (MQ=255) gATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGtt < 2:100702/149‑1 (MQ=255) aagcgacttcccactggccgggctgagccagcagcaactggatcgcctgccggtggGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCa > 6:178198‑M2/57‑98 (MQ=255) aagcgacttcccactggccgggctgagccagcagcaactggatcgcctgccggtggGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCa < 5:178198‑M2/42‑1 (MQ=255) gcgcgcgGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTcgc > 4:221974/1‑113 (MQ=255) gcgcgcgGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTcgc < 3:221974/113‑1 (MQ=255) ttcccactggccgggctgagccagcagcaactggatcgcctgccggtggGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTc > 4:92076‑M2/50‑149 (MQ=255) gCGATGCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGa > 7:282516/1‑122 (MQ=255) gCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGa < 8:282516/122‑1 (MQ=255) aTCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGt > 4:265774/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTcg > 1:132155/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTg > 2:213761/1‑136 (MQ=255) gTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTg < 1:213761/136‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATg < 4:151922/143‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATg > 3:151922/1‑143 (MQ=255) gTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCgg > 5:75772/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGt < 3:265774/149‑1 (MQ=255) ctgGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGTTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAg < 1:52553/148‑1 (MQ=255) ctgGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAg < 7:82196/148‑1 (MQ=255) tCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAGgtccag > 5:129917/1‑149 (MQ=255) ccGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAg < 7:7134/138‑1 (MQ=255) ccGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAg > 8:7134/1‑138 (MQ=255) gCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATg < 7:85553/105‑1 (MQ=255) gCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATg > 8:85553/1‑105 (MQ=255) cAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAGGTCCAGTCCAGgcg > 8:271190/1‑147 (MQ=255) gGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAGGTCCAGTCCAGGCGCAGCTc < 1:21704‑M2/147‑1 (MQ=255) | TGCATCAGATAGATGCCCGAACCCGGTTCGAGCAAGGTGTGCATCAGCAGCCCTTCCTGCATCGGCGACAACGGATAGATGTCTTCGATATCGCGCGCGGCCACCGGCAGGCGATCCAGTTGCTGCTGGCTCAGCCCGGCCAGTGGGAAGTCGCTTGGCGTAATGCCTTGCGCCTCAGGTTCCACGCAGTGCTCGATGACCTCGCGCAACGCCTGCTGATACCGGCTGGCGAGTTGCTCGATGGTCGCCTCGTGGAACATGTCGCGGCTGTAGGTCCAGTCCAGGCGCAGCTC > NC_002947/4782578‑4782870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |