New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4891009 = | 54 (1.090) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.9% | coding (171/1275 nt) | ttuD | hydroxypyruvate reductase |
? | NC_002947 | 4891070 = | 44 (0.940) | coding (232/1275 nt) | ttuD | hydroxypyruvate reductase |
TACCTGCCCGCCGATCGCAGCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTGGCTCGGCGTTGCTGGC > NC_002947/4890923‑4891215 | ttgctgaccagttccagcacgcgcttggccacagccaggccggcagcgtccgggaccgggtgggcggcttcgaccacctcgatcttCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCagaa > 5:173768‑M1/87‑149 (MQ=255) ccTGCCCGCCGATCGCAGCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCagaa < 6:243025/147‑1 (MQ=255) ctgaccagttccagcacgcgcttggccacagccaggccggcagcgtccgggaccgggtgggcggcttcgaccacctcgatcttCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCagaaga > 7:27410‑M1/84‑148 (MQ=255) gCCCGCCGATCGCAGCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATc > 8:298325/1‑148 (MQ=255) gCCCGCCGATCGCAGCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATc > 3:290205/1‑148 (MQ=255) gCAGCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGaa < 4:290205/149‑1 (MQ=255) gCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAgcc < 8:54898/149‑1 (MQ=255) ttATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCg > 2:209125/1‑149 (MQ=255) tATCGTCATCGGCGCCTGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTTGTCTAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCGACGGCGCCAACTGCCAGAAGATGGAGTTGGTCTAAGCCGCCCAacct < 2:301426/148‑2 (MQ=255) tCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTc < 1:209125/149‑1 (MQ=255) tCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTc > 5:277353/1‑149 (MQ=255) tCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCg > 7:61011/1‑149 (MQ=255) gcATCGGCGCCGGCAAGGCCGCATCTGCCATGGCCGAAGATGTCGAGAAAATCTGGGATGGTTCATGCTCCGGCCTTGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCg < 2:102829/148‑1 (MQ=255) ggCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCgg < 6:69288/149‑1 (MQ=255) aaGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCt > 3:12307/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTg < 6:211527/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGc < 7:155802/149‑1 (MQ=255) gCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCtgt < 4:235363/149‑1 (MQ=255) gCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCtgt > 2:314686/1‑149 (MQ=255) cTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCt < 8:13542/139‑1 (MQ=255) cTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCt > 7:13542/1‑139 (MQ=255) ccGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTg > 6:219892/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTg > 5:320910/1‑149 (MQ=255) cGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGTGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGc < 2:112170/149‑1 (MQ=255) cGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGc > 6:216209/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAAc > 3:6548/1‑149 (MQ=255) gTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCtgtg < 7:137936/129‑1 (MQ=255) gTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCtgtg > 8:137936/1‑129 (MQ=255) gTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACt > 6:115079/1‑149 (MQ=255) tCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTg < 6:277353/149‑1 (MQ=255) gagaAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGt < 2:38408/149‑1 (MQ=255) gaAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGt > 8:97338/1‑147 (MQ=255) gaAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCa < 5:219892/149‑1 (MQ=255) gaAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCa < 8:61011/149‑1 (MQ=255) gaAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCa < 7:298325/149‑1 (MQ=255) tcttctggcagttggcgccgtggccgtaacgggtcacgaccaggccggagacttcaccctgccagAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAg > 7:27410‑M2/66‑148 (MQ=255) aaGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCa < 3:151244/149‑1 (MQ=255) ttctggcagttggcgccgtggccgtaacgggtcacgaccaggccggagacttcaccctgccagAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCaa > 5:173768‑M2/64‑149 (MQ=255) gCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAAc < 2:236709/149‑1 (MQ=255) tGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACgaag < 5:281184/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGTAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACcgcg > 4:55621/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACcgc < 6:320910/148‑1 (MQ=255) ggCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGt < 4:6548/149‑1 (MQ=255) cgtaacgggtcacgaccaggccggagacttcaccctgccagAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTc < 8:27410‑M2/108‑1 (MQ=255) tCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTc < 5:216209/149‑1 (MQ=255) ccGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCa > 4:45767/1‑110 (MQ=255) ccGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCa < 3:45767/110‑1 (MQ=255) gTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCt > 3:92550/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTgg < 4:92550/148‑1 (MQ=255) cACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTgg > 6:231689/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTGGCTCGGCGtt < 4:12307/149‑1 (MQ=255) ccagAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTGgctcggcgaacaaag > 1:113467‑M2/5‑142 (MQ=255) ccagAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCAACCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCACCCTCAACGAAGCAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTGGCtaggcgtgtctgt > 7:294676‑M2/5‑143 (MQ=255) cagAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTGGCTCGGCGTTGCTGGc > 3:170279‑M2/4‑149 (MQ=255) | TACCTGCCCGCCGATCGCAGCGGCCGGGTTATCGTCATCGGCGCCGGCAAGGCCGCAGCTGCCATGGCCGAAGTGGTCGAGAAAAGCTGGCAGGGTGAAGTCTCCGGCCTGGTCGTGACCCGTTACGGCCACGGCGCCAACTGCCAGAAGATCGAGGTGGTCGAAGCCGCCCACCCGGTCCCGGACGCTGCCGGCCTGGCTGTGGCCAAGCGCGTGCTGGAACTGGTCAGCAACCTCAACGAAGAAGACCGCGTCATCTTCCTGCTGTCTGGCGGTGGCTCGGCGTTGCTGGC > NC_002947/4890923‑4891215 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |