New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6078715 | 55 (1.110) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.7% | coding (511/1290 nt) | PP_5330 | MFS transporter |
? | NC_002947 | = 6078761 | 47 (1.010) | coding (465/1290 nt) | PP_5330 | MFS transporter |
CGCCAAGCAGGAACGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCATACGTCGGCAGCAGGCCCATGATCAGG > NC_002947/6078613‑6078905 | cGCCAAGCAGGAACGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGa < 3:47042/149‑1 (MQ=255) aGGAACGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCAc < 4:225641/149‑1 (MQ=255) aaCGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACgtg < 1:110768/149‑1 (MQ=255) cGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGtt < 7:119819/149‑1 (MQ=255) cGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGtt > 1:296452/1‑149 (MQ=255) cGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGCCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGtt < 8:90050/149‑1 (MQ=255) ggATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCa < 3:168737/149‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCaga < 2:296452/149‑1 (MQ=255) ttCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCagag < 5:37301/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAgccgg > 4:263158‑M2/1‑128 (MQ=255) gCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAgccgg < 3:263158‑M2/133‑6 (MQ=255) ggCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCGGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAaca > 3:86507/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCAt < 6:206123/148‑1 (MQ=255) gTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCAt < 2:170922/148‑1 (MQ=255) tCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATgc > 1:243324/1‑149 (MQ=255) ccACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGccc < 4:221380/149‑1 (MQ=255) cACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCg > 3:228732/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTcgcc > 8:291586/1‑149 (MQ=255) cgcTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTcgccg > 3:245787/1‑149 (MQ=255) cTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCTCTACCAGCGAGCCCATCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGAGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGAACTTc < 3:242699/143‑1 (MQ=255) cTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTCTTCAGAGACGAACACCCATCCGCCCGGTACTTcgagat > 4:242699/1‑144 (MQ=255) tACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGa < 2:76315/148‑1 (MQ=255) gCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCcg > 8:222319/1‑149 (MQ=255) gCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCcg > 7:257966/1‑149 (MQ=255) aTCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCGGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTg < 4:86507/149‑1 (MQ=255) aTCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTg > 2:292002/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGCTACCAGCGAGCCGAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGAt > 7:66793/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGAt < 1:251178/148‑1 (MQ=255) aGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGAt > 2:251178/1‑148 (MQ=255) gCTACCAGCGAGCCTAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCAcgc < 8:66793/148‑1 (MQ=255) tACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACgcgc > 1:111712/1‑148 (MQ=255) ccAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCa < 8:257966/147‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCa < 2:111712/149‑1 (MQ=255) cccAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGCCGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAAcag > 7:22872/1‑149 (MQ=255) agAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGAt > 7:288854/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCTGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAgccggaattctgctggtctcgctggtagcgaccttgatcaacagcgagtacagcgaggaagaagtggctgagtacgcctggcgaaacccgttcc < 3:167883‑M2/149‑95 (MQ=255) ccggcggtcaggccggcggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAgccggcattctgctgggctcgctggtagcgaccttgatcaacagcgtgtacagcgcggaagaagtggctgactacgcctggcgaatcccgttcctgct < 2:149772‑M2/149‑99 (MQ=255) ggcggtcaggccggcggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGccc < 4:245787/149‑1 (MQ=255) gcggtcaggccggcggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCca > 2:111609/1‑149 (MQ=255) gtcaggccggcggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACAt < 7:291586/149‑1 (MQ=255) aggccggcggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAgccggcattctgctgggctcgctggtagcgaccttgatcaacagcgtgtacagcgcggaagaagtggctgactacgcctggcgaatcccgttcctgcttggcggtgt > 1:149772‑M2/1‑42 (MQ=255) tgccggcggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCAGGTGTTTCGAGCCGGCACGTTTTCAGAGACTAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGACGCATATTGCCGAGCCTTTGATCACGCGCATCa < 6:320464/119‑1 (MQ=255) ggccggcggtcaggGTGCCGAAGGCATAGCCGGTGTTGAGATACGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGACGCGCCTTGGATCACGCGCATCa > 5:320464/1‑120 (MQ=255) cggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTgc < 1:111609/149‑1 (MQ=255) cggtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTgc < 2:243324/149‑1 (MQ=255) gtcaggGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTgcgc < 1:292002/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCAt > 4:49105/1‑146 (MQ=255) ggTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCAt < 3:49105/146‑1 (MQ=255) gCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAAcagca > 4:212268/1‑106 (MQ=255) gCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAAcagca < 3:212268/106‑1 (MQ=255) gCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCATACGTCGGcagcag > 7:122968/1‑149 (MQ=255) ccGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCATACGTCGGCAGCAGGCCCAt < 7:222319/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTACCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCATACGTCGGCAGCAGGCCCATGa > 2:306301/1‑149 (MQ=255) gtgtTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCt > 2:71871/1‑121 (MQ=255) gtgtTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCt < 1:71871/121‑1 (MQ=255) gcgccaGCCGGCCCGCGTGCAGAGACGACCACCCCTCCGCCCCGCACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTCGATCACGCGCATCAGCAACCGCAGGATCGGTGCCCACATCCCGATCTGCGCATACGGCGGCAGCAGGCCCATGATCAg < 8:288854/144‑1 (MQ=255) tGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCGCACATGCCGATCTGCGCATACGTCGGCAGCAGGCCCATGATCAgg > 5:43182/1‑149 (MQ=255) | CGCCAAGCAGGAACGGGATTCGCCAGGCGTAGTCAGCCACTTCTTCCGCGCTGTACACGCTGTTGATCAAGGTCGCTACCAGCGAGCCCAGCAGAATGCCGGCGGTCAGGCCGGCGGTCAGGGTGCCGCAGGCATAGCCGGTGTTGCGAGCCGGCACGTGTTCAGAGACGAACACCCATGCGCCCGGTACTTCGCCGCCGATTGCCGCGCCTTGGATCACGCGCATCAGCAACAGCAGGATCGGTGCCCACATGCCGATCTGCGCATACGTCGGCAGCAGGCCCATGATCAGG > NC_002947/6078613‑6078905 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |