New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 136939 | 52 (1.030) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 8.1% | intergenic (+35/‑161) | amiD/PP_0131 | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase/membrane‑anchored phosphodiesterase |
? | NC_002947 | = 137001 | 41 (0.860) | intergenic (+97/‑99) | amiD/PP_0131 | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase/membrane‑anchored phosphodiesterase |
TCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/136789‑136939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccttgTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTGCGTCGACCCAACTCGCCTCTTCGCAGCGCAAGGCTTTGCAACAAGGACCCCGCCCGCCGTGACTCAACGCATGCGGTTAAGTACCTGCAGCATCGCTGCTGTCTGCG < NC_002947/137001‑136861 TCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCC < 3:145394/148‑1 GCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG > 3:261327/1‑149 GCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG < 4:84780/149‑1 GCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG > 5:188724/1‑149 GCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG < 7:86974/149‑1 CGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTT > 1:149587/1‑142 CGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTT < 2:149587/142‑1 CTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTGCGTCGACCCAACTCGC > 2:74605/1‑149 GCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTACGTCGACCCAACTCGCCTCTTCGCAGCGCAAGGCTTT > 5:235092/1‑149 GCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTACGTCGACCCAACTCGCCTCTTCGCAGCGCAAGGCTTT < 6:235092/149‑1 ACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTGCGTCGACCCAACTCGCCTCTTCGCAGCGCAAGGCTTTGCAA < 1:74605/149‑1 AGCCTTGTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTGCGTCGACCCAACTCGCCTCTTCGCAGCGCAAGGCTTTGCAACAAGGACCCCGCCCGCCGTGACTCAACGCATGCGGTTAAGTACCTGCAGCATCGCTGCTGTCTGCG > 7:66236/1‑148 TCGCCACACGTCATGTGGTCGCCGCCTTCCAGATGCGCTTCCGCCCGCAGCGCTTCGACGGTATGCCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/136789‑136939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agccttgTGGCTGCGATGCGACCGTTAAGTCGATACAACTGCGTCGACCCAACTCGCCTCTTCGCAGCGCAAGGCTTTGCAACAAGGACCCCGCCCGCCGTGACTCAACGCATGCGGTTAAGTACCTGCAGCATCGCTGCTGTCTGCG < NC_002947/137001‑136861 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |