New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 136939 | 52 (1.030) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 8.1% | intergenic (+35/‑161) | amiD/PP_0131 | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase/membrane‑anchored phosphodiesterase |
? | NC_002947 | = 137001 | 41 (0.860) | intergenic (+97/‑99) | amiD/PP_0131 | 1,6‑anhydro‑N‑acetylmuramyl‑L‑alanine amidase/membrane‑anchored phosphodiesterase |
CCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCGCCAAATTTTTTACCG > NC_002947/136854‑137149 | ccGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTACAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCca < 3:197568/148‑1 (MQ=255) cgcAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCAcaaggct > 7:66236‑M2/1‑141 (MQ=255) cAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGtt > 7:156074/1‑149 (MQ=255) gATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAgcg > 5:112199/1‑149 (MQ=255) ctgcAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCgt < 6:112199/148‑1 (MQ=255) tgcAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCgtgg > 8:224337/1‑149 (MQ=255) aGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCgtgggtg > 2:202536/1‑149 (MQ=255) cTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GAtt < 8:156074/148‑1 (MQ=255) aaCCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAg > 7:37742/1‑149 (MQ=255) cATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAg > 2:3310/1‑149 (MQ=255) ttGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCa > 1:116614/1‑148 (MQ=255) tCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGt < 1:3310/149‑1 (MQ=255) tCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGt > 7:20893/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGt > 4:215176/1‑147 (MQ=255) ggcgggcgGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTTACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAgg < 7:178927/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGattatt > 3:187914/1‑148 (MQ=255) gTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGAAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGattatt > 2:286727/1‑148 (MQ=255) ccTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCgtgg < 7:284905/106‑1 (MQ=255) ccTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCgtgg > 8:284905/1‑106 (MQ=255) gttgCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTcc < 2:116614/148‑1 (MQ=255) gttgCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCg > 5:248132/1‑149 (MQ=255) ttgCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCAcaaggctttgcaacaaggaccccgcccgccgtgactcaacgcatgcggttaagtacctgcagcatcgctgctgt < 1:74605‑M2/149‑75 (MQ=255) cAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGc > 4:271666/1‑149 (MQ=255) aaaGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGTAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCAcaaggctttgcaacaaggaccccgcccgccgtgactcaacgcatgcggttaagtacctgcagcatcgctgctgtctgc < 6:235092‑M2/149‑79 (MQ=255) aaaGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGTAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCAcaaggctttgcaacaaggaccccgcccgccgtgactcaacgcatgcggttaagtacctgcagcatcgctgctgtctgc > 5:235092‑M2/1‑71 (MQ=255) aaaGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGc > 8:38182/1‑148 (MQ=255) aaaGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGc > 5:288555/1‑148 (MQ=255) cgcTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTgg < 8:37742/149‑1 (MQ=255) gcTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCTCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGt < 3:252287/149‑1 (MQ=255) cTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGt > 7:274831/1‑148 (MQ=255) gagGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACt < 6:288555/149‑1 (MQ=255) ggCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTg < 8:274831/148‑1 (MQ=255) gCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCAcaaggctttgcaacaaggaccccgcccgccgtgactcaacgcatgcggttaagtacctgcagcatcgctgctgtctgcgcatccggcataccgtcgaag > 2:74605‑M2/1‑50 (MQ=255) gCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGt < 1:158622/138‑1 (MQ=255) gCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGt > 2:158622/1‑138 (MQ=255) cGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGAt < 6:248132/149‑1 (MQ=255) cGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGAt < 7:224337/149‑1 (MQ=255) gAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGattatt > 4:73773/1‑114 (MQ=255) gAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGattatt < 3:73773/114‑1 (MQ=255) ggTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATc > 6:99719/1‑134 (MQ=255) ggTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATc < 5:99719/134‑1 (MQ=255) ggTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTc < 3:215176/148‑1 (MQ=255) gTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCt < 8:20893/149‑1 (MQ=255) cTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTGACATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCt > 1:80257/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTtgct > 2:34163/1‑149 (MQ=255) aaCGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTtgct > 2:194551/1‑149 (MQ=255) aCGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTtgctg > 6:241852/1‑149 (MQ=255) caGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCGCCAAAttttt > 2:261789/1‑149 (MQ=255) gCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCGCCAAATTTTTTa < 1:194551/149‑1 (MQ=255) ccACAACGCTGTTTATACAAAGCTCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGCGAGGGCGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCTCCAAATTTTTTAc < 6:316711/149‑1 (MQ=255) cacaAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCGCCAAATTTTTTAcc > 2:68080/1‑149 (MQ=255) acaAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCGCCAAATTTTTTACCg > 5:255522/1‑149 (MQ=255) | CCGGATGCGCAGACAGCAGCGATGCTGCAGGTACTTAACCGCATGCGTTGAGTCACGGCGGGCGGGGTCCTTGTTGCAAAGCCTTGCGCTGCGAAGAGGCGAGTTGGGTCGACGCAGTTGTATCGACTTAACGGTCGCATCGCAGCCACAAGGCTGTTTCTACAAAGCGCGTGGGTG‑GATTGCAGCGAAGCGCCAAACGGTGAGGGTGATTATTGATTCCGTTGCTATACCTTGGTTATCAACTGGATGCCTTCGATGTCAGCCTTCATCGCCTTGCTGCGCCAAATTTTTTACCG > NC_002947/136854‑137149 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |