New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 100459 | 31 (0.620) | 5 (0.110) | 5/224 | NT | 13.9% | intergenic (‑51/+71) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 100507 | 35 (0.800) | intergenic (‑99/+23) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
CCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAA > NC_002947/100312‑100607 | ccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCt < 7:100423/149‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTcc > 3:255496/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCcac < 8:2877/147‑1 (MQ=255) gCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGGCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAg < 7:167563/148‑1 (MQ=255) cAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 1:26371/1‑143 (MQ=255) cAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCca < 2:26371/143‑1 (MQ=255) cAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGt > 4:46211/1‑148 (MQ=255) aGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTa > 6:324745/1‑148 (MQ=255) gTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtgg > 4:80796‑M1/1‑132 (MQ=255) agTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc > 3:51851/1‑149 (MQ=255) aTGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCAc < 4:51851/148‑1 (MQ=255) cccAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCaa < 4:255496/149‑1 (MQ=255) ggtcggtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGg < 4:126362‑M2/149‑2 (MQ=255) tcggtaAGGGTGCCGTCGAGTTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcg < 4:185942‑M1/149‑52 (MQ=255) ggtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcggg < 3:80796‑M1/149‑54 (MQ=255) gtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggc > 4:103766‑M2/1‑143 (MQ=255) gggccGTCGAGGTCGACGAGGATGTTTGGCTGGTGCATGTCCAGGGTTCCACTTGATTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgccc > 4:205221‑M2/3‑137 (MQ=255) tCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc > 1:62798/1‑115 (MQ=255) tCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGc < 2:62798/115‑1 (MQ=255) aGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCg > 4:94714/1‑149 (MQ=255) tCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGt > 2:125269/1‑148 (MQ=255) aaGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcg > 6:295643‑M1/1‑74 (MQ=255) aaGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcg < 5:295643‑M1/137‑64 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCACCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGt > 2:165309/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAg > 2:194685/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCATGTACAGGGTGCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑GCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTa < 2:57490/148‑1 (MQ=255) tGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgggg > 1:224174/1‑91 (MQ=255) tGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAgggg < 2:224174/90‑1 (MQ=255) gTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCt > 3:208227/1‑149 (MQ=255) tACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGc > 2:118460/1‑147 (MQ=255) aGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGt > 6:182476/1‑149 (MQ=255) ggTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCACCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGc < 3:46211/149‑1 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTg < 5:324745/149‑1 (MQ=255) cACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGtt > 3:43215/1‑148 (MQ=255) aGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 1:118460/148‑1 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCt > 4:69470/1‑149 (MQ=255) ccTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt < 1:125269/149‑1 (MQ=255) ccTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt < 3:94714/149‑1 (MQ=255) ccTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt > 1:85782/1‑149 (MQ=255) t‑tcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg > 3:60528/1‑149 (MQ=255) t‑tcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg < 3:126362/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctctt < 5:295643‑M2/137‑75 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctctt > 6:295643‑M2/1‑63 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcgc > 1:252178/1‑149 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcg < 4:208227/148‑1 (MQ=255) gggCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcaatcaagtggaaccctggacatgcaccagccaaacatcctcgtcgacctcgacggccc > 4:205221‑M1/1‑12 (MQ=255) gcccgcccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgac > 4:103766‑M1/1‑6 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgacc < 3:80796‑M2/149‑97 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgaactcgacggcacccttaccga < 4:185942‑M2/149‑99 (MQ=255) cccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgaccgacc < 4:126362‑M1/149‑149 (MQ=255) | CCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCT‑TCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAA > NC_002947/100312‑100607 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |