New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 100459 | 31 (0.620) | 5 (0.110) | 5/224 | NT | 13.9% | intergenic (‑51/+71) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 100507 | 35 (0.800) | intergenic (‑99/+23) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
GGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCG > NC_002947/100360‑100648 | ggtcggtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGg < 4:126362‑M2/149‑2 (MQ=255) gtcAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggc > 4:103766‑M2/1‑143 (MQ=255) gggccGTCGAGGTCGACGAGGATGTTTGGCTGGTGCATGTCCAGGGTTCCACTTGATTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgccc > 4:205221‑M2/3‑137 (MQ=255) aGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCg > 4:94714/1‑149 (MQ=255) tCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGt > 2:125269/1‑148 (MQ=255) gATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCACCCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGt > 2:165309/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAg > 2:194685/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCATGTACAGGGTGCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTa < 2:57490/148‑1 (MQ=255) gTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCt > 3:208227/1‑149 (MQ=255) tACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGc > 2:118460/1‑147 (MQ=255) aGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGt > 6:182476/1‑149 (MQ=255) ggTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCACCCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGc < 3:46211/149‑1 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTg < 5:324745/149‑1 (MQ=255) cACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGtt > 3:43215/1‑148 (MQ=255) aGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 1:118460/148‑1 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCt > 4:69470/1‑149 (MQ=255) ccTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt < 1:125269/149‑1 (MQ=255) ccTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt < 3:94714/149‑1 (MQ=255) ccTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt > 1:85782/1‑149 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg > 3:60528/1‑149 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg < 3:126362/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctctt > 6:295643‑M2/1‑63 (MQ=255) cgcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctctt < 5:295643‑M2/137‑75 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcgc > 1:252178/1‑149 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGgcg < 4:208227/148‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgacc < 3:80796‑M2/149‑97 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgaactcgacggcacccttaccga < 4:185942‑M2/149‑99 (MQ=255) ccACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGTAGGGGCGAGTCTACCTGGGGGGGCGGGCATGGCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgc < 4:60528/149‑1 (MQ=255) ccACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgc < 2:85782/149‑1 (MQ=255) cacaGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgcg > 8:184472/1‑149 (MQ=255) cacaGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTAATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATgcg < 2:33647/149‑1 (MQ=255) gTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTc < 5:182476/149‑1 (MQ=255) aaaGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTCGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTcc > 1:241979/1‑149 (MQ=255) gcAGGCCATGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCg > 4:91443/1‑149 (MQ=255) ggggCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCgg < 3:69470/149‑1 (MQ=255) ccACTCAACCTGCGGGGgcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacggcaccctgaccgacccacgcctgggcatcactcgctcgatccagtac > 4:80796‑M2/1‑17 (MQ=255) cACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCg > 7:123169/1‑132 (MQ=255) cACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCg > 7:127471/1‑132 (MQ=255) cACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCg < 8:123169/132‑1 (MQ=255) cACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCg < 8:127471/132‑1 (MQ=255) aCTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGt > 4:240754/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGc < 5:153220/138‑1 (MQ=255) cTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGc > 6:153220/1‑138 (MQ=255) cTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCg < 1:165309/149‑1 (MQ=255) | GGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCC‑GCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCG > NC_002947/100360‑100648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |