| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 974820 = | 56 (1.110) | 4 (0.090) | 4/234 | NT | 8.4% | coding (212/543 nt) | ycfJ | flagella biosyntheis regulator |
| ? | NC_002947 | 974890 = | 36 (0.790) | coding (282/543 nt) | ycfJ | flagella biosyntheis regulator | |||||
GACCTACAGCTTGGTGAACAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCAGGAAGGCATGCAGGAGCG > NC_002947/974677‑974964 | tagcccaccaccttctcactgatgtcgttgaccgtgttgcagcgggtttgcgtggttgtgtaggtatcacgctcctgcatgccttcctgcaccttgttacccgcataaccaccaccgaccgcaccggccaccgtggcaatcttcTTGcc > 2:94942‑M1/145‑149 (MQ=255) aCAGCTTGGTGAACGAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTAcc > 7:272428/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGGTGAACAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTAcc < 4:60353/148‑1 (MQ=255) cTTGGTGAACAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTgg < 7:119475/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGAACAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTgg < 6:227010/149‑1 (MQ=255) ggTGAACAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCg > 3:192854/1‑149 (MQ=255) aaCAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGc > 6:331392/1‑149 (MQ=255) aGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGTGGCAGCCGATCAAGCAGAAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTg > 1:196643/1‑149 (MQ=255) aGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTgg > 5:91988/1‑149 (MQ=255) ggCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTgg > 4:160098/1‑148 (MQ=255) ccGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAggt > 8:90082/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGtt < 6:79885/149‑1 (MQ=255) gTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAAGCGCGCGTGAAGTCTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTaa < 4:194000/149‑1 (MQ=255) tgactgacGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAAc > 3:123384/1‑149 (MQ=255) gactgacGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAAcc < 7:141152/149‑1 (MQ=255) tgacGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGt < 1:129042/142‑1 (MQ=255) t‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCTGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATtggt < 8:272428/149‑1 (MQ=255) gCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATtggtg > 4:196640/1‑149 (MQ=255) aGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTTCGTTGGCAGGTGGTATGTTGGGTAACCAGATTGGTGGc < 5:331392/149‑1 (MQ=255) aGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGc < 2:196643/149‑1 (MQ=255) aGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGAGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGCTCTGTTGGGTAACCAGAATGGTGGc > 4:313720/1‑149 (MQ=255) gCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAg < 8:150848/119‑1 (MQ=255) gCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAg > 7:150848/1‑119 (MQ=255) gATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTa > 4:276190/1‑149 (MQ=255) tCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGACGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTAcc > 1:206574/1‑149 (MQ=255) aaGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCgg < 7:90082/149‑1 (MQ=255) agcagcAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGc < 3:276190/149‑1 (MQ=255) cgctcctgcatgccttcctgcaccttgttacccgcataaccaccaccgaccgcaccggccaccgtggcaatcttcTTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCgg < 6:226359‑M1/67‑1 (MQ=255) cgctcctgcatgccttcctgcaccttgttacccgcataaccaccaccgaccgcaccggccaccgtggcaatcttcTTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCgg > 5:226359‑M1/76‑142 (MQ=255) gTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGAt > 8:68341/1‑149 (MQ=255) aaaaCCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGc > 3:113583/1‑149 (MQ=255) aaCCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCg > 3:128474/1‑128 (MQ=255) aaCCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCg < 4:128474/128‑1 (MQ=255) ccccGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGc < 5:118524/145‑1 (MQ=255) ccccGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGc > 6:118524/1‑145 (MQ=255) ccGCGTGAAGTTTGCAAGGACGGGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACAACAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGt < 2:153008/149‑1 (MQ=255) cgcgTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTg > 4:83577/1‑149 (MQ=255) gTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGc > 5:138491/1‑64 (MQ=255) gTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGc < 6:138491/64‑1 (MQ=255) aggttGCATGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTg < 4:192854/146‑1 (MQ=255) aGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTg < 3:83577/149‑1 (MQ=255) gTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGc > 5:191254/1‑149 (MQ=255) cAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCaa < 6:16581/120‑1 (MQ=255) cAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCaa > 5:11880/1‑120 (MQ=255) cAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCaa < 6:11880/120‑1 (MQ=255) cAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCaa > 5:16581/1‑120 (MQ=255) aaGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCCGTACCGGCAACAAGATTGCCAAGGTTGCAGGTCcagtcgg > 8:77372/1‑149 (MQ=255) aGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGcggtcggt < 6:91988/149‑1 (MQ=255) tacccgcataaccaccaccgaccgcaccggccaccgtggcaatcttcTTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCaa > 2:230183‑M1/48‑117 (MQ=255) tacccgcataaccaccaccgaccgcaccggccaccgtggcaatcttcTTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCaa < 1:230183‑M1/70‑1 (MQ=255) aCGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCggtggt < 3:160098/149‑1 (MQ=255) aCGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCggtggt < 7:68341/149‑1 (MQ=255) aCGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCggtggt < 3:196640/149‑1 (MQ=255) cTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTAt < 2:206574/149‑1 (MQ=255) gACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCgg > 4:163433/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAAc > 8:238313/1‑147 (MQ=255) ccGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGcggtc > 1:38878/1‑120 (MQ=255) ccGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGcggtc < 2:38878/120‑1 (MQ=255) ccGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCAGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCa < 7:77372/149‑1 (MQ=255) gacAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTCGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCAGTTGGGTAACCAGATTGGTGGAGGTACCCGCAAGAAGATTGACAACGTGGCCGCTCCGGTCGGTGGTGGGTATGCGGGTATCAAGGTGCAgg > 4:100875/3‑148 (MQ=255) gTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCAgg > 6:174378/1‑148 (MQ=255) acacCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCAGGAAGGCATGCAgg < 7:238313/149‑1 (MQ=255) cacCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCCGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCAGCAAGGCATGCAg > 7:141366/1‑147 (MQ=255) cAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCAGGAAGGCATGCAGGAGCg > 5:130293/1‑149 (MQ=255) | GACCTACAGCTTGGTGAACAAAGGCCCCGAAGTCGCCCAGGTGACTGACGT‑GCAGCCGATCAAGCAGCAGGTGAAAACCCCGCGTGAAGTTTGCAAGGACGTGACTGTGACGCGCCAGGCGCCGGTCAAGGATCAACACCAGATTGCCGGTACCGTGGTCGGTGCGTTGGCAGGTGGTCTGTTGGGTAACCAGATTGGTGGCGGTACCGGCAAGAAGATTGCCACGGTGGCCGGTGCGGTCGGTGGTGGTTATGCGGGTAACAAGGTGCAGGAAGGCATGCAGGAGCG > NC_002947/974677‑974964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |