New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1585631 | 58 (1.150) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 6.9% | coding (243/876 nt) | PP_1389 | oxaloacetate decarboxylase |
? | NC_002947 | = 1585659 | 53 (1.110) | coding (271/876 nt) | PP_1389 | oxaloacetate decarboxylase |
CCAATGTCGGCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGTTCGGGCGCAA > NC_002947/1585485‑1585777 | ccAATGTCGGCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTggtcgggt > 5:179742/1‑149 (MQ=255) aTGTCGGCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTcgc < 6:231641/149‑1 (MQ=255) tGTCGGCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTcgcg < 2:268995/149‑1 (MQ=255) tGTCGGCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTcgcg < 2:96288/149‑1 (MQ=255) ggCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAAc > 7:104957/1‑149 (MQ=255) gCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCACCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGcgtcggccag > 1:103246‑M1/1‑138 (MQ=255) cATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCgg < 4:49563/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGCCTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCgg > 6:271783/1‑148 (MQ=255) ccGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACt < 6:241505/148‑1 (MQ=255) ccGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTg < 6:230124/149‑1 (MQ=255) ccGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTg < 5:123481/149‑1 (MQ=255) gCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGgc < 3:308165/149‑1 (MQ=255) cAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGgcc > 8:197025/1‑149 (MQ=255) gggCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGcgtcggccagtaccggcagttgcgcgaccc > 2:203881‑M1/1‑118 (MQ=255) ggCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACGcc > 2:75451‑M2/1‑145 (MQ=255) cGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACg > 2:284352/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACgg < 3:286173/149‑1 (MQ=255) aaGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGcgtcggccagtaccggcagttgcgcgacccgaccaatgc < 1:203881‑M1/149‑40 (MQ=255) aGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCt < 5:269037/149‑1 (MQ=255) gTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGcgtcggccagtaccggcagttgcgcgacccgaccaatgcgg < 2:103246‑M1/149‑42 (MQ=255) ggTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATgg < 4:144213/149‑1 (MQ=255) ggTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACAACGGCTATgg < 8:151405/149‑1 (MQ=255) gTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGc < 7:197025/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACg > 3:286218/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCa > 4:43985/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGTTCTTCGCTCTGATGACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACgg < 6:178014/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGTACTGGCTGCTACGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGAAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACAGGCACATGTACGACAACGGCTATGGCAACCCACTGAACGTCATGCGCACgc > 1:268703/1‑148 (MQ=255) cAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACgg < 1:126093/145‑1 (MQ=255) aCTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAAc > 2:11074/1‑149 (MQ=255) gctgctCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTgg > 4:12789/1‑148 (MQ=255) gctgctCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTg < 1:11074/147‑1 (MQ=255) gctgctCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTg > 5:308362/1‑147 (MQ=255) tgctCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAgc > 2:147038/1‑149 (MQ=255) ctCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAgcgc > 4:176255/1‑149 (MQ=255) tCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACGccg < 5:220732‑M2/92‑4 (MQ=255) tCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACGccg > 6:220732‑M2/1‑89 (MQ=255) ggACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCg < 5:244563/149‑1 (MQ=255) gACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCgg > 1:174060/1‑149 (MQ=255) ttCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGTCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGgtgt > 3:7264/1‑149 (MQ=255) ttCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGgtgt > 3:90894/1‑149 (MQ=255) gCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTgg < 1:147038/148‑1 (MQ=255) gCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGc > 2:49457/1‑149 (MQ=255) tctGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCg > 3:273828/1‑149 (MQ=255) ccTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCa > 2:318504/1‑149 (MQ=255) ccTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCa > 2:151341/1‑149 (MQ=255) ccTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCa > 5:191340/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATc > 5:232775/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCt > 2:139687/1‑74 (MQ=255) cGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCt < 1:139687/74‑1 (MQ=255) ttCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGacac < 6:308362/149‑1 (MQ=255) tcgtcgAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACAcc > 2:263701/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCtgctgc < 6:232775/149‑1 (MQ=255) gCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCtgctgc < 1:151341/149‑1 (MQ=255) ggCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGctgcctg < 4:273828/149‑1 (MQ=255) ggCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGctgcctg < 3:176255/149‑1 (MQ=255) gCCACCCGCATTTGTCGGGTCGCGCAACTTCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGctgcctgc < 2:269169/149‑1 (MQ=255) gCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGTGACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGctgcctg > 1:48164/1‑149 (MQ=255) ccACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACCGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCtgcctgcc < 1:263701/149‑1 (MQ=255) cACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGccc < 2:48164/149‑1 (MQ=255) aCCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGa < 4:12739/121‑1 (MQ=255) aCCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGa > 3:12739/1‑121 (MQ=255) aCCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGACGGT‑ACAGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTCCCCa > 5:244110/1‑149 (MQ=255) ccGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACGccgaccaatgcgggtggcctgctcgacgaactcgctgagggtgatcagagcgaagtccggagcagccagtacctgcaacgaagcgaccgaaccgccgaggataccgac < 2:103246‑M2/149‑109 (MQ=255) ccGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACt > 4:267427/1‑117 (MQ=255) ccGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGt > 1:210556/1‑149 (MQ=255) gCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACGccgaccaatgcgggtggcctgctcgacgaactcgctgagggtgatcagagcgaagtccggagcagccagtacctgcaacgaagcgaccgaaccgccgaggataccgactt < 1:203881‑M2/149‑111 (MQ=255) aTTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACCGCTATGGCAACGCACTGAACGTGAAGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCAACGAGGACACACTGCTGCCTGCCCAGTTCgg > 6:228194/1‑149 (MQ=255) aTTGGTCGGGTCGCGCAACGGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGTTCgg < 6:103424/149‑1 (MQ=255) ggtcgggtcgCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGTTCGGgc < 2:210556/148‑1 (MQ=255) gtcgggtcgCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGTTCGGgcg > 1:117547/1‑148 (MQ=255) cgggtcgCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTCATGCGCACGGTCATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGGGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGTTCGGGCGCaa < 1:49457/149‑1 (MQ=255) cggcgtcggccagtaccggcagttgcgcgacccgaccaatgcgggtggcctgctcgacgaactcgctgagggtgatcagagcgaagtccgga > 6:220732‑M1/1‑3 (MQ=255) cggcgtcggccagtaccggcagttgcgcgacccgaccaatgcgggtggcctgctcgacgaactcgctgagggtgatcagagcgaagtccgga < 5:220732‑M1/92‑90 (MQ=255) gggtcgCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACGccgaccaatgcgggtggcctgctcgacgaactcgctgagggtgatcagagcgaagtccggagcagccagtacctgcaacgaagcgaccgaaccgccgaggataccgacttcgaagccc > 2:203881‑M2/1‑30 (MQ=255) ggcgtcggccagtaccggcagttgcgcgacccgaccaatgcgggtggcctgctcgacgaactcgctgagggtgatcagagcgaagtccggagcagccagtacctgcaacgaagcgaccgaaccgccgaggataccgacttcgaagcc > 2:75451‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCAATGTCGGCACGCATTGCCGCAGACCTGGGCTTCGAAGTCGGTATCCTCGGCGGTTCGGTCGCTTCGTTGCAGGTACTGGCTGCTCCGGACTTCGCTCTGATCACCCTCAGCGAGTTCGTCGAGCAGGCCACCCGCATTGGTCGGGTCGCGCAACTGCCGGT‑ACTGGCCGACG‑CCGACCACGGCTATGGCAACGCACTGAACGTGATGCGCACGGTGATCGAACTGGAGCGCGCCGGTGTGGCCGCACTGACCATCGAGGACACCCTGCTGCCTGCCCAGTTCGGGCGCAA > NC_002947/1585485‑1585777 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |