| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1695804 | 72 (1.430) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 5.4% | coding (481/648 nt) | PP_1491 | CheW domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | = 1695829 | 72 (1.490) | coding (506/648 nt) | PP_1491 | CheW domain‑containing protein | |||||
GCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTACTGTCTGCCG > NC_002947/1695656‑1695951 | gcACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGA > 3:232742‑M1/1‑149 (MQ=255) gTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGt < 8:30494/149‑1 (MQ=255) cAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGTGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCTGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAgg < 1:262614/149‑1 (MQ=255) cAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGatt > 3:292756/1‑147 (MQ=255) cAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGatt > 2:12718/1‑147 (MQ=255) cAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAg > 8:110225/1‑148 (MQ=255) tACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATc > 4:14622/1‑149 (MQ=255) gcgGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGAc < 2:84422/149‑1 (MQ=255) cgGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACg < 5:100341/149‑1 (MQ=255) cGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATgg > 4:153921/1‑126 (MQ=255) cGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATgg < 3:153921/126‑1 (MQ=255) gTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATtc > 1:51466‑M2/1‑147 (MQ=255) ggTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGAtggctgtcgatttcctcgacagccatcac < 1:12718‑M1/148‑30 (MQ=255) gtgccgtgccTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGAataccgtcgatttcctcgacagccatcacca > 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6:239033/149‑1 (MQ=255) cgAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATc < 4:223452/149‑1 (MQ=255) cgAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATc < 2:149792/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATc > 1:59804/1‑148 (MQ=255) gCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAGTCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAacac < 8:97350/149‑1 (MQ=255) gggCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTgg > 6:40408/1‑136 (MQ=255) gggCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTgg < 5:40408/136‑1 (MQ=255) ggCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTa < 3:31719/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATtcaccaccggcccgccttcggcggccagaatcagcatacgtggcatcgcccgtgcgctgcgttgctcggtggagccggcctgcaccccgagcaagtcagccagggacaggcac < 5:283184‑M2/149‑114 (MQ=255) ggtggtGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTACTGt < 8:124945/149‑1 (MQ=255) ggtggtGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTACTGt < 8:178552/149‑1 (MQ=255) gtggtgATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATtcaccaccggcccgccttcggcggccagaatcagcatacgtggcatcgcccgtgcgctgcgttgctcggtggagccggcctgcaccccgagcaagtcagccagggacaggcacggca < 1:137185‑M2/149‑118 (MQ=255) tggtgATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATtcaccaccggcccgccttcggcggccagaatcagcatacgtggcatcgcccgtgcgctgcgttgctcggtggagccggcctgcaccccgagcaagtcagccagggacaggcacggcac > 6:283184‑M2/1‑31 (MQ=255) gtgATGGCTGTCGAGGAAATCGACAGCCAtcaccaccggcccgccttcggcggccagaatcagcatacgtggcatcgcccgtgcgctgcgttgctcggtggagccggcctgcaccccgagcaagtcagccagggacaggcacggcacc < 1:12718‑M2/148‑120 (MQ=255) tgATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTACTGTCTGcc < 4:80308/149‑1 (MQ=255) gAataccgtcgatttcctcgacagccatcaccaccggcccgccttcggcggccagaatcagcatacgtggcatcgcccgtgcgctgcgttgctcggtggagccggcctgcaccccgagcaagtcagccagggacaggcacggcaccaac > 1:51466‑M1/1‑2 (MQ=255) aTGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGTCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCTCCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTACTGTCTGCCg < 7:233665/148‑1 (MQ=255) | GCACGGGGTTGCCAATGTACGCGGTGCGTTGGTGCCGTGCCTGTCCCTGGCTGACTTGCTCGGGGTGCAGGCCGGCTCCACCGAGCAACGCAGCGCACGGGCGATGCCACGTATGCTGATTCTGGCCGCCGAAGGCGGGCCGGTGGTGATGGCTGTCGAGGAAATCGACGGTATTCACCGGCTCGACCCGCAGTTGCTGGGCAGTGGCCGGGACGCCACACGCTTCACCGCCGCAGTCCTGCAGTGGCGCGGCCGCAGCGTGCGGGTTCTGGACGATCAACACTTACTGTCTGCCG > NC_002947/1695656‑1695951 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |