New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1818173 = | 41 (0.810) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 8.0% | coding (315/789 nt) | PP_1622 | M23B subfamily metallopeptidase |
? | NC_002947 | 1818241 = | 53 (1.100) | coding (383/789 nt) | PP_1622 | M23B subfamily metallopeptidase |
AGCTGGCTGCACGCAACGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACGGTGTACTGATTGG > NC_002947/1818028‑1818316 | aGCTGGCTGCACGCAACGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGgc < 5:155128/149‑1 (MQ=255) ctggctgCACGCAACGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGgcag > 2:257084/1‑149 (MQ=255) tgCACGCAACGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGC‑GCCTGTGGGCAGCACAGc > 5:235836/1‑149 (MQ=255) cccaaatcaccggcgatatcaatgcctttattcaaactaccgtttgaagcgaattttccaatcagtacaccgttggcaggccaggtccacccacctaccgcgcgctctgcggctggtacggtagcaaccacagGGGCAGCACAGCCACg < 5:84585‑M1/16‑1 (MQ=255) aaCGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTggg < 2:319674/134‑1 (MQ=255) aaCGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTggg > 1:319674/1‑134 (MQ=255) aaCGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGgc > 2:233826/1‑149 (MQ=255) ggCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGcc > 2:296390/1‑149 (MQ=255) cgcCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTACAGCAGCGGTTCCAGAAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCACGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACCCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGccagcac > 7:255438/1‑148 (MQ=255) cATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGgcagca < 4:104742/116‑1 (MQ=255) cATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGgcagca > 3:104742/1‑116 (MQ=255) ccGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGC‑GCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCg < 6:235836/149‑1 (MQ=255) cAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGcc < 5:287899/120‑1 (MQ=255) cAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGcc > 6:287899/1‑120 (MQ=255) cGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTcc < 1:233826/149‑1 (MQ=255) tttCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctg > 1:63476/1‑149 (MQ=255) attttccaatcagtacaccgttggcaggccaggtccacccacctaccgcgcgctctgcggctggtacggtagcaaccacagGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgccc > 6:84585‑M1/82‑149 (MQ=255) gcagcGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgcccct > 6:122324/1‑149 (MQ=255) gcagcGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgcccct > 3:11288/1‑149 (MQ=255) gcGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCtgtg < 1:257084/149‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGt < 1:296390/149‑1 (MQ=255) gcagcagcagCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTGCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGc < 8:255438/147‑1 (MQ=255) gtacaccgttggcaggccaggtccacccacctaccgcgcgctctgcggctggtacggtagcaaccacagGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCtgtg > 8:151144‑M1/70‑142 (MQ=255) gtacaccgttggcaggccaggtccacccacctaccgcgcgctctgcggctggtacggtagcaaccacagGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCtgtg < 7:151144‑M1/73‑1 (MQ=255) agcagcCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTAc < 2:63476/149‑1 (MQ=255) gcagcCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGccagc < 3:185150/95‑1 (MQ=255) gcagcCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGccagc > 4:185150/1‑95 (MQ=255) cagcCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgc > 7:207341/1‑132 (MQ=255) cagcCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgc < 8:207341/132‑1 (MQ=255) gCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCAc > 6:320460/1‑106 (MQ=255) gCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCAc < 5:320460/106‑1 (MQ=255) gtggtgTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCaga < 5:122324/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAgcgcgc > 6:288210/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGcgcgcg < 4:11288/148‑1 (MQ=255) tCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAggtgggtg > 4:150105/1‑149 (MQ=255) tCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAggtgggtg > 2:256170/1‑149 (MQ=255) cGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgc > 2:317311/1‑100 (MQ=255) cGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCgcccctgc < 1:317311/100‑1 (MQ=255) gCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTa > 4:287756/1‑113 (MQ=255) gCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTa < 3:287756/113‑1 (MQ=255) gCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTgg > 6:205157/1‑149 (MQ=255) gCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCt > 5:243744/1‑149 (MQ=255) cacGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGcc > 1:32152/1‑148 (MQ=255) cGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAAc < 2:32152/149‑1 (MQ=255) ggTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACg > 5:107570/1‑149 (MQ=255) gcggcgGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGc > 6:187130/1‑134 (MQ=255) gcggcgGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGc < 5:187130/134‑1 (MQ=255) gcggcgGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACGGTGTAc > 2:215597/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACGGTGTACTGATTgg > 6:180080/1‑148 (MQ=255) cTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACGGTGTACTGATTg < 7:69961/147‑1 (MQ=255) cTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACGGTGTACTGATTg > 8:69961/1‑147 (MQ=255) tgGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTgg > 4:169079/1‑75 (MQ=255) tgGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTgg < 3:169079/75‑1 (MQ=255) | AGCTGGCTGCACGCAACGGCATTCAGGCGCCTTATACCATCCGCCCGGGCCAAGCGATTCGTTTCAGCAGCGGTTCCAGCAGCCGCACCACGGTGGTGTCCAGCCCGTCCTCGTCAAGCCGCACCACGGTCACGCGGCGGCCTGTGGGCAGCACAGCCACGGCGCCTGCCAGCACCAGCAAACCGGCCACGTCGGCGCCTTCCGCCCCTGCCCCTGTGGTTGCTACCGTACCAGCCGCAGAGCGCGCGGTAGGTGGGTGGACCTGGCCTGCCAACGGTGTACTGATTGG > NC_002947/1818028‑1818316 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |