| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2727129 = | 62 (1.230) | 6 (0.130) | 6/242 | NT | 9.7% | coding (193/627 nt) | PP_2388 | LysE family transporter |
| ? | NC_002947 | 2727174 = | 53 (1.120) | coding (148/627 nt) | PP_2388 | LysE family transporter | |||||
CCGCCGCGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGATC > NC_002947/2726984‑2727274 | aataccgcactcaccgccacctacgccctcaccgtgctgctactgatcgccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACt > 7:294012‑M1/146‑149 (MQ=255) taccgcactcaccgccacctacgccctcaccgtgctgctactgatcgccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTgg > 1:302221‑M1/144‑149 (MQ=255) gccgcGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTgg < 6:233635/149‑1 (MQ=255) ccgcGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGt > 5:27481/1‑149 (MQ=255) ccgcactcaccgccacctacgccctcaccgtgctgctactgatcgccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTg < 8:34670‑M1/8‑1 (MQ=255) ccgcactcaccgccacctacgccctcaccgtgctgctactgatcgccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTg < 7:288660‑M1/8‑1 (MQ=255) gcgcCCAGCCTTGGGAGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGt > 3:106362/1‑147 (MQ=255) cccAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGga < 7:138621/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGgat > 2:183649/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGGGAGgat > 7:104054/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGgatg < 8:267148/149‑1 (MQ=255) ccTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATc > 7:56864/1‑149 (MQ=255) ggcgCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACg < 4:106362/145‑1 (MQ=255) tcgctcgcTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCc‑g‑c > 2:136603/1‑149 (MQ=255) gctcgctGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGt < 5:141534/126‑1 (MQ=255) gctcgctGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGt > 6:141534/1‑126 (MQ=255) gctcgctGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑g‑cgc > 1:317811/1‑149 (MQ=255) cctcaccgtgctgctactgatcgccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTg < 2:38954‑M1/5‑1 (MQ=255) ctcaccgtgctgctactgatcgccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaacagggcatCACTGGTGAGGATGATCCACACTGCC‑G‑CGcc < 5:264956‑M1/31‑1 (MQ=255) 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ccactcccggcccggtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGt < 4:80030‑M1/44‑1 (MQ=255) ccaccaccgggccgggagtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTg > 3:192891‑M1/97‑104 (MQ=255) ccaccaccgggccgggagtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTg < 4:192891‑M1/8‑1 (MQ=255) cTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGt > 2:156656/1‑149 (MQ=255) tGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCT‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGtt > 7:214392/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTg < 8:56864/148‑1 (MQ=255) ggCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGc > 4:183971/1‑149 (MQ=255) ccTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCGGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGAcgg > 6:21158/1‑149 (MQ=255) gtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTGC‑‑‑TGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAg > 1:309145‑M1/83‑116 (MQ=255) gtggtggcactgatcgtcaacactgcggccgcctccggctcgcgcaaggccatgttcaccgccgtcggcaccaactgggcatCACTGGTGC‑‑‑TGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAg < 2:309145‑M1/34‑1 (MQ=255) cTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATc < 8:179133/117‑1 (MQ=255) cTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATc > 7:179133/1‑117 (MQ=255) 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gCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCg > 8:169243/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCg > 7:34670/1‑148 (MQ=255) cAGCCAAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGAAGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTTATGCCCAGGTGGTGCCGAAGGCGGTGCACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGc > 7:146849/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCg < 6:206121/147‑1 (MQ=255) aGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCg > 5:206121/1‑147 (MQ=255) 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tCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGG‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCAccgggccggg > 1:53195/1‑147 (MQ=255) tCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGt < 1:156656/149‑1 (MQ=255) gATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTgg > 4:289859/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCg < 3:183971/149‑1 (MQ=255) gcggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACTCCCGGCCCGGTGGTGGcac < 1:136603/148‑3 (MQ=255) gcggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGAt < 3:105644/149‑1 (MQ=255) cggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCT‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGATc < 8:214392/149‑1 (MQ=255) ggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑GTCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGt > 1:24059/1‑142 (MQ=255) ggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGt < 2:24059/141‑1 (MQ=255) | CCGCCGCGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCC‑G‑CGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGTGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGATC > NC_002947/2726984‑2727274 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |