New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2795464 = | 34 (0.680) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 10.8% | coding (824/1284 nt) | puuB | gamma‑glutamylputrescine oxidase |
? | NC_002947 | 2795529 = | 34 (0.710) | coding (759/1284 nt) | puuB | gamma‑glutamylputrescine oxidase |
GGCCTTGAGCATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCT > NC_002947/2795316‑2795611 | ggCCTTGAGCATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCt < 5:31942/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGc < 1:99419/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCTCCGATAATGAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCg < 8:172760/149‑1 (MQ=255) aaaccccggccgtgcgcatcgaacgcggtgccaacccggtcgtgcataccccgcagggcaaggtccgcgccaagttcatcatcgttgccggcaacgcctacctgggcaacctggtacccgagctggccgccaagtccatgccaTGCgg < 3:254452‑M1/5‑1 (MQ=255) gAGCATTTTCGGGCGGATGATCTCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCgg < 1:244831/147‑1 (MQ=255) gAGCATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCgg > 2:110139/1‑147 (MQ=255) cATTTTCGGGCGTATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCTAAAATCAGGCGCTTGTCTCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTATTTGAAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTTCGgcagca < 2:231870/149‑1 (MQ=255) cATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGgcagca < 6:185173/149‑1 (MQ=255) ttCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGgt > 8:143634/1‑149 (MQ=255) gggCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGgtgcg > 6:79962/1‑149 (MQ=255) ggCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCTGCCGCAggactact < 3:272649/149‑7 (MQ=255) ggCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGgtgcgt > 2:279432/1‑149 (MQ=255) gatgatCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGgtgc < 4:217366/143‑1 (MQ=255) gatgatCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCa < 1:110139/149‑1 (MQ=255) gatgatCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGAAGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGgtccgaga > 3:217366/1‑144 (MQ=255) tGTTGGCCGGGGCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGt < 7:143634/149‑1 (MQ=255) gTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCggtgg < 1:279432/149‑1 (MQ=255) gcCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCt < 5:79962/149‑1 (MQ=255) cccgcagggcaaggtccgcgccaagttcatcatcgttgccggcaacgcctacctgggcaacctggtacccgagctggccgccaactccatgccaTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCt < 7:18605‑M1/55‑1 (MQ=255) ggcaaggtccgcgccaagttcatcatcgttgccggcaacgcctacctgggcaacctggtacccgagctggccgccaactccatgccaTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGcc > 8:18605‑M1/88‑149 (MQ=255) accacGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGcc > 4:205671/1‑149 (MQ=255) cacGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgc < 7:125845/149‑1 (MQ=255) ggtccgcgccaagttcatcatcgttgccggcaacgcctacctgggcaacctggtacccgagctggccgccaagtccatgccaTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgca < 5:106088‑M1/65‑1 (MQ=255) ggtccgcgccaagttcatcatcgttgccggcaacgcctacctgggcaacctggtacccgagctggccgccaagtccatgccaTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgca > 6:106088‑M1/83‑147 (MQ=255) ccACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgcatggcat > 1:249879/1‑149 (MQ=255) aaaaTCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACtt < 3:205671/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgcatggcatg < 7:237196/136‑1 (MQ=255) gcgcTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgcatggcatg > 8:237196/1‑136 (MQ=255) gCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGt < 8:279316/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGTTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGAGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCTCCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCa < 1:226528/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCAACTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGACAGCTCGGGTAc > 2:226528/1‑146 (MQ=255) tCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTggcg > 6:117683/1‑131 (MQ=255) tCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTggcg < 5:117683/131‑1 (MQ=255) gCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCGTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCa > 1:30393/1‑143 (MQ=255) gCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCa < 2:30393/143‑1 (MQ=255) gTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCgg > 6:93844/1‑149 (MQ=255) gTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCgg > 4:122052/1‑149 (MQ=255) gTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCgg < 3:122052/149‑1 (MQ=255) aGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGccc < 7:125663/125‑1 (MQ=255) aGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGccc > 8:125663/1‑125 (MQ=255) cTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGatgatg > 7:270838/1‑148 (MQ=255) tCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTAc < 4:284500/110‑1 (MQ=255) tCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTAc > 3:284500/1‑110 (MQ=255) cGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTg < 5:93844/149‑1 (MQ=255) tCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGAc > 7:103095/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCt > 6:178061/1‑149 (MQ=255) | GGCCTTGAGCATTTTCGGGCGGATGATCGCCTCGATGTTGGCCGGGTCACGCGCGCCGTACACCACGCCGCCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCT > NC_002947/2795316‑2795611 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |