New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2795464 = | 34 (0.680) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 10.8% | coding (824/1284 nt) | puuB | gamma‑glutamylputrescine oxidase |
? | NC_002947 | 2795529 = | 34 (0.710) | coding (759/1284 nt) | puuB | gamma‑glutamylputrescine oxidase |
CCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCGGGGTTTGCTCAT > NC_002947/2795386‑2795677 | ccACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgcatggcat > 1:249879/1‑149 (MQ=255) aaaaTCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACtt < 3:205671/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgcatggcatg > 8:237196/1‑136 (MQ=255) gcgcTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCgcatggcatg < 7:237196/136‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGt < 8:279316/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGTTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGAGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCTCCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCa < 1:226528/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCAACTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGACAGCTCGGGTAc > 2:226528/1‑146 (MQ=255) tCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTggcg > 6:117683/1‑131 (MQ=255) tCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTggcg < 5:117683/131‑1 (MQ=255) gCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCGTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCa > 1:30393/1‑143 (MQ=255) gCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCa < 2:30393/143‑1 (MQ=255) gTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCgg > 6:93844/1‑149 (MQ=255) gTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCgg < 3:122052/149‑1 (MQ=255) gTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCgg > 4:122052/1‑149 (MQ=255) aGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGccc < 7:125663/125‑1 (MQ=255) aGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGccc > 8:125663/1‑125 (MQ=255) cTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGatgatg > 7:270838/1‑148 (MQ=255) tCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTAc < 4:284500/110‑1 (MQ=255) tCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTAc > 3:284500/1‑110 (MQ=255) cGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTg < 5:93844/149‑1 (MQ=255) tCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGAc > 7:103095/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCt > 6:178061/1‑149 (MQ=255) tgcggcacgcaggtgatcaccaccgagccactgggcgaagaactggcacgcaccctgctgccgcaTGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGAcc < 5:106088‑M2/82‑1 (MQ=255) tgcggcacgcaggtgatcaccaccgagccactgggcgaagaactggcacgcaccctgctgccgcaTGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGAcc > 6:106088‑M2/66‑147 (MQ=255) ggcacgcaggtgatcaccaccgagccactgggcgaagaactggcacgcaccctgctgccgcaTGGCATGGAGTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGcc > 8:18605‑M2/63‑149 (MQ=255) aggtgatcaccaccgagccactgggcgaagaactggcacgcaccctgctgccgcaTGGCATGGAGTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCggg < 7:18605‑M2/94‑1 (MQ=255) gcCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCAc > 7:156428/1‑149 (MQ=255) cAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGAGGATGACCTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGa > 8:52596/1‑149 (MQ=255) tcGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCggg < 4:167099/132‑1 (MQ=255) tcGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCggg > 3:167099/1‑132 (MQ=255) cGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCggg < 5:178061/146‑1 (MQ=255) cGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGtt < 8:103095/148‑1 (MQ=255) cGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCATGCGGGGTATGCACGACCGGGTTg > 4:258720/1‑149 (MQ=255) aGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCAcc < 3:258720/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGAAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTc > 3:27210/1‑149 (MQ=255) tgATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACGAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGTACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATgcgc < 2:249879/149‑1 (MQ=255) gATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCa > 4:254452/1‑149 (MQ=255) cACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACgg > 6:250878/1‑149 (MQ=255) cTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCAGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCg > 8:98984/1‑149 (MQ=255) cGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCggg < 7:98984/148‑1 (MQ=255) cGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGAAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCggg < 4:27210/148‑1 (MQ=255) ccgcaTGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCGGGGttt < 3:254452‑M2/143‑1 (MQ=255) tggcatggACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCGGGGTTTGCTCAt < 5:250878/149‑1 (MQ=255) | CCACCGAAAATCAGGCGCTTGTCGCTGGTCAGGCGGTAGTAGTCGAGCAGGTAGTTGCAGTCCTCGACGCAGTAGTCCTGCGGCAGCAGGGTGCGTGCCAGTTCTTCGCCCAGTGGCTCGGTGGTGATCACCTGCGTGCCGCATGGCATGGACTTGGCGGCCAGCTCGGGTACCAGGTTGCCCAGGTAGGCGTTGCCGGCAACGATGATGAACTTGGCGCGGACCTTGCCCTGCGGGGTATGCACGACCGGGTTGGCACCGCGTTCGATGCGCACGGCCGGGGTTTGCTCAT > NC_002947/2795386‑2795677 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |