New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3118247 | 62 (1.230) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.3% | coding (335/1188 nt) | cfa | cyclopropane‑fatty‑acyl‑phospholipid synthase |
? | NC_002947 | = 3118286 | 49 (1.020) | coding (296/1188 nt) | cfa | cyclopropane‑fatty‑acyl‑phospholipid synthase |
GCAGATGCGCTCCAGCTTGTGCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAGCGCCAGGTCGGGGCTGCGCCA > NC_002947/3118102‑3118395 | gCAGATGCGCTCCAGCTTGTGCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAAATGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCCGCCGCTCGAACAGGGCAATGCACAGGGCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCggg > 2:242911/1‑149 (MQ=255) gcTCCAGCTTGTGCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCgcgc > 8:197394/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTGTGCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTg > 6:118053/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGTGAAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGt > 5:262175/1‑149 (MQ=255) gtgCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGACTTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGTGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGtt < 1:242911/147‑1 (MQ=255) gtgCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGtt > 8:61805/1‑147 (MQ=255) gtgCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTg < 5:118053/148‑1 (MQ=255) tgCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGc < 2:17124/148‑1 (MQ=255) cAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGt < 3:137016/149‑1 (MQ=255) aaCTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGtt > 5:329543/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCACTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCtgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcg < 4:76680‑M1/149‑32 (MQ=255) cTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTgc < 8:278813/148‑1 (MQ=255) tCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTgcag > 3:22274/1‑149 (MQ=255) cAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTgcagc < 5:161287/148‑1 (MQ=255) cAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTgcag < 4:22274/147‑1 (MQ=255) cAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTgcag > 3:294458/1‑147 (MQ=255) aGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAg < 5:327969‑M2/149‑2 (MQ=255) gtgtTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAgg > 6:327969‑M2/1‑147 (MQ=255) gtTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGt > 5:296426/1‑130 (MQ=255) gtTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGt < 6:296426/130‑1 (MQ=255) ccccGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCgcagg < 7:76176/148‑1 (MQ=255) ccccGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCgcagg < 4:294458/148‑1 (MQ=255) cccGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCgcagggc < 4:32894/149‑1 (MQ=255) cccGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCgcaggg > 8:139782/1‑148 (MQ=255) tgtTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGggcg < 1:316571/149‑1 (MQ=255) gtTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCACTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGc > 5:268423/1‑114 (MQ=255) gtTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCACTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGc < 6:268423/114‑1 (MQ=255) cgcAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCggg < 5:136112/149‑1 (MQ=255) gcAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGggc < 6:329543/149‑1 (MQ=255) ccGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGGCGCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGc < 1:67154/108‑1 (MQ=255) ccGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGc > 2:67154/1‑107 (MQ=255) gAATACATCATGGTCGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGggccaggcc > 7:121540/1‑149 (MQ=255) aTACATCATGTTGGGGGACAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAc < 4:239835/149‑1 (MQ=255) aTACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCtgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaac < 2:168367‑M1/121‑48 (MQ=255) aTACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCtgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaac > 1:168367‑M1/1‑74 (MQ=255) atcatGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTc > 2:140403/1‑149 (MQ=255) atcatGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTc > 6:166291/1‑149 (MQ=255) tcatGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAgg < 3:236359‑M2/110‑3 (MQ=255) tcatGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAgg > 4:236359‑M2/1‑108 (MQ=255) catGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTc > 3:184440/1‑147 (MQ=255) gtggGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGACAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAgcgc > 6:262548/1‑149 (MQ=255) tggGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAccc < 2:226165/140‑1 (MQ=255) tggGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAccc > 1:226165/1‑140 (MQ=255) gggTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTc < 5:166291/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTc > 3:17109/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGa < 4:17109/149‑1 (MQ=255) tCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAg > 7:224019/1‑149 (MQ=255) cagcagCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAcc < 6:3513/132‑1 (MQ=255) cagcagCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAcc > 5:3513/1‑132 (MQ=255) cGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGggccaggcc < 4:267218/122‑1 (MQ=255) cGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGggccaggcc > 3:267218/1‑122 (MQ=255) gCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCTGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGGCGAGCACTTCAAgg > 5:223857/1‑149 (MQ=255) gCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAggcgca < 8:217949‑M2/93‑7 (MQ=255) gCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAggcgca > 7:217949‑M2/1‑87 (MQ=255) gAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTgg > 7:239279/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTc > 4:37647/1‑131 (MQ=255) aaCAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTc < 3:37647/131‑1 (MQ=255) aaCAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGc > 5:131301/1‑149 (MQ=255) ggCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGcgacg > 3:37612/1‑148 (MQ=255) ggCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGcgacg > 8:290782/1‑148 (MQ=255) cccAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGc < 8:121540/148‑1 (MQ=255) cccAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAAGGATGCGCCGGGCGCCGCGCGTGTCGTGGCGGTTGCGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGGCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCg < 6:253294/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCgg < 7:197394/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCggg > 2:36185/1‑149 (MQ=255) aGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGt < 7:139782/149‑1 (MQ=255) tAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAg < 4:184440/149‑1 (MQ=255) ccAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAcc < 5:18439/91‑1 (MQ=255) ccAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCAcc > 6:18439/1‑91 (MQ=255) cAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCgg > 4:27167/1‑133 (MQ=255) cAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCgg < 3:27167/133‑1 (MQ=255) cAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAGCGCCAGGt > 8:162867/1‑149 (MQ=255) aaTGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAGCGCCAGGTCgg < 4:37612/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagcggctgctggaccccaccatgatgtat > 1:168367‑M2/1‑47 (MQ=255) gTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagcggctgctggaccccaccatgatgtat < 2:168367‑M2/121‑75 (MQ=255) tGCGCCtgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagc > 7:217949‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCGCCtgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagc < 8:217949‑M1/93‑88 (MQ=255) gcgcCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAGCGCCAGGTCGGGGCTgc > 2:236961/1‑149 (MQ=255) cctgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagcggctgctggaccccaccatgatgtattcggctgcgcaattcgaacacccggggcaaacac > 6:327969‑M1/1‑2 (MQ=255) cctgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagcggctgctggaccccaccatga < 3:236359‑M1/110‑109 (MQ=255) cctgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagcggctgctggaccccaccatga > 4:236359‑M1/1‑2 (MQ=255) ctgctgcaccggctcaaccgcaacgacaagcgcggcgcccggcgcaacattctggcccactacgacctgggcaatgccctgttcgagcggctgctggaccccaccatgatgtattcggctgcgcaattcgaacacccggggcaaacact < 5:327969‑M1/149‑149 (MQ=255) cGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAGCGCCAGGTCGGGGCTgc < 8:171120/145‑1 (MQ=255) cGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACACGCGGGTCACCAGCGCCAGGTCGGGGCTgc > 7:171120/1‑145 (MQ=255) | GCAGATGCGCTCCAGCTTGTGCAACTGGGCCTGCTCCAGTGTTTGCCCCGGGTGTTCGAATTGCGCAGCCGAATACATCATGGTGGGGTCCAGCAGCCGCTCGAACAGGGCATTGCCCAGGTCGTAGTGG‑GCCAGAATGTTGCGCCGGGCGCCGCGCTTGTCGTTGCGGTTGAGCCGGTGCAGCAGGCGCAGGGCAGGGCGGCCCAGGCGGGCCAGGCCACCCTCGAGCGCGTCGAGCACTTCAAGGTTGGCGACGAACAGGCGGGTCACCAGCGCCAGGTCGGGGCTGCGCCA > NC_002947/3118102‑3118395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |