New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3274590 | 46 (0.910) | 5 (0.100) | 5/246 | NT | 10.9% | coding (348/885 nt) | eamA | O‑acetylserine/cysteine export transporter |
? | NC_002947 | = 3274661 | 38 (0.790) | coding (419/885 nt) | eamA | O‑acetylserine/cysteine export transporter |
CATTTCACTGGGCCAGTTCGCGTTCCTGTTTCAGGCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGG > NC_002947/3274443‑3274733 | cATTTCACTGGGCCAGTTCGCGTTCCTGTTTCAGGCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGTCAGCg > 5:190347/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTTCGCGTTCCTGTTTCAGGCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCatgggcacatg > 7:226317‑M1/1‑138 (MQ=255) ggCCAGTTCGCGTTCCTGTTTCAGGCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTgggg < 8:230600/147‑1 (MQ=255) gcgTTCCTGTTTCAGGCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGATTCGTTGATCCTGCATTCGCAAGCATTCTTCACCGTCGTTTTTGCTGCGTCGTTTCTCGTTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTggc < 1:79867/149‑1 (MQ=255) ggCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg < 8:27980/149‑1 (MQ=255) ggCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg < 4:237995/149‑1 (MQ=255) ggCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg > 3:237995/1‑149 (MQ=255) ggCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg < 3:193212/149‑1 (MQ=255) gCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGTCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg < 6:190347/148‑1 (MQ=255) aGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCgg > 4:99506/1‑149 (MQ=255) cATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCg < 7:53349/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCg > 2:182119/1‑148 (MQ=255) tGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATc < 6:34066/140‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATc > 5:34066/1‑140 (MQ=255) ccgccAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGa < 1:182119/149‑1 (MQ=255) cgccAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAg < 7:125407/142‑1 (MQ=255) cgccAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAg > 8:125407/1‑142 (MQ=255) cgccAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGAc > 7:200451/1‑149 (MQ=255) gggTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGAcggcgg > 4:252016/1‑149 (MQ=255) ttCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCatgggcacatggccgccgtcttcgctgccgatcagtgccaggccgccggccgccaccagcagcccca > 4:276060‑M1/1‑82 (MQ=255) ttGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCTGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGc > 3:140871/1‑145 (MQ=255) ttGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCTGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGc < 4:140871/145‑1 (MQ=255) cTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCatgggcacatggccgccgtcttcgctgccgatcagtgccaggccgccggccgccaccagcagccccagcacgctggc < 8:226317‑M1/149‑78 (MQ=255) cAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCatgggcacatggccgccgtcttcgctgccgatcagtgccaggccgccggccgccaccagcagccccagcacgctggccag < 2:237634‑M1/149‑81 (MQ=255) aGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCatgggcacatggccgccgtcttcgctgccgatcagtgccaggccgccggccgccaccagcagccccagcacgctggccagg < 3:276060‑M1/149‑82 (MQ=255) tCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTCATGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGt > 5:10019/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGc > 1:174991/1‑149 (MQ=255) ccTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGAcc < 3:99506/149‑1 (MQ=255) cACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCtgt < 3:252016/146‑1 (MQ=255) aCCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTgg > 6:303699/1‑149 (MQ=255) ccTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg < 6:244884/83‑1 (MQ=255) ccTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTgg > 5:244884/1‑83 (MQ=255) cTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCgg > 3:136627/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCAc > 8:184677/1‑84 (MQ=255) tCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCAc < 7:184677/84‑1 (MQ=255) gTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGc > 3:37157/1‑148 (MQ=255) ctgcGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTgg > 1:264589/1‑149 (MQ=255) tgcGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTggg > 3:268635/1‑149 (MQ=255) gcGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCAtgt > 8:230249/1‑101 (MQ=255) gcGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCAtgt < 7:230249/101‑1 (MQ=255) gcGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGAtgtg < 2:257014/146‑1 (MQ=255) gcGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCAGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGAtgtg > 1:257014/1‑146 (MQ=255) cGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCTGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGGTGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGc < 4:274253/149‑1 (MQ=255) cGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTgggg < 1:86908/148‑1 (MQ=255) gttTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTg < 4:37157/148‑1 (MQ=255) gttTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTCTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTgg > 5:49602/1‑149 (MQ=255) tttCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCg < 6:64263/135‑1 (MQ=255) tttCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCg > 5:64263/1‑135 (MQ=255) ggTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCaa < 2:264589/146‑1 (MQ=255) ggTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAAcat < 4:136627/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATgctggccaggcgcagccgctcaccgagaaacaacgcagcaaaaccgagggtgaagaaggcttgcgact < 3:276060‑M2/149‑69 (MQ=255) cTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATgctggccaggcgcagccgctcaccgagaaacaacgcagcaaaaccgagggtgaagaaggcttgcgactg < 2:237634‑M2/149‑70 (MQ=255) cTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGtt > 2:250924/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATgctggccaggcgcagccgctcaccgagaaacaacgcagcaaaaccgagggtgaagaaggcttgcgactgcag < 8:226317‑M2/149‑73 (MQ=255) gCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCgg > 1:307805/1‑149 (MQ=255) | CATTTCACTGGGCCAGTTCGCGTTCCTGTTTCAGGCCATGTACAGCGGCATGCCGCCAGGGTTGGCTTCGTTGATCCTGCAGTCGCAAGCCTTCTTCACCCTCGGTTTTGCTGCGTTGTTTCTCGGTGAGCGGCTGCGCCTGGCCAGCGTGCTGGGGCTGCTGGTGGCGGCCGGCGGCCTGGCACTGATCGGCAGCGAAGACGGCGGCCATGTGCCCATGCTGGCGTTGGTGCTGACCCTGTGTGGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGG > NC_002947/3274443‑3274733 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |