New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3859566 = | 44 (0.870) | 5 (0.110) | 5/242 | NT | 10.6% | coding (400/753 nt) | cobM | precorrin‑4 C(11)‑methyltransferase |
? | NC_002947 | 3859608 = | 43 (0.910) | coding (442/753 nt) | cobM | precorrin‑4 C(11)‑methyltransferase |
TACGGCGCCATCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTG > NC_002947/3859422‑3859714 | tACGGCGCCATCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCAc > 8:104062/1‑149 (MQ=255) gcCATCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATcc > 1:316913/1‑139 (MQ=255) gcCATCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATcc < 2:316913/139‑1 (MQ=255) tCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGc < 4:149366/149‑1 (MQ=255) tggcccgatgcaccaccgcaaccgggcagtgcgcgccgtagtgcggcatcaactcagcgacaatgcgcgacaggtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgCTCACCCGCTATGGc < 6:206690‑M1/15‑1 (MQ=255) ggTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGa < 5:329785/149‑1 (MQ=255) tGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACa < 2:49003/149‑1 (MQ=255) aTTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGcc < 5:23863/149‑1 (MQ=255) tCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCa > 4:241855/1‑149 (MQ=255) gCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCAt < 7:104062/148‑1 (MQ=255) gCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATg < 6:293843/149‑1 (MQ=255) cACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATgcc < 7:132341/149‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATgccgc > 5:177497/1‑149 (MQ=255) cagtgcgcgccgtagtgcggcatcaactcagcgacaatgcgcgacaggtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAg > 5:294415‑M1/108‑149 (MQ=255) ccTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGc < 6:189307/148‑1 (MQ=255) gtgcgcgccgtagtgcggcatcaactcagcgacaatgcgcgacaggtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCa > 5:206690‑M1/106‑149 (MQ=255) ggCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGt < 2:210067/148‑1 (MQ=255) gCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTg > 4:45124/1‑149 (MQ=255) cATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGccc > 3:8815/1‑127 (MQ=255) cATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGccc < 4:8815/127‑1 (MQ=255) cATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTgg > 5:199839/1‑149 (MQ=255) cATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTgg > 8:221467/1‑149 (MQ=255) tCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGt < 3:45124/149‑1 (MQ=255) ccAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTgg > 7:49993/1‑149 (MQ=255) atcCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGcc < 8:240686/148‑1 (MQ=255) aactcagcgacaatgcgcgacaggtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGt < 4:139353‑M1/51‑1 (MQ=255) aactcagcgacaatgcgcgacaggtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGt > 3:139353‑M1/84‑134 (MQ=255) cccGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATgg < 6:199839/149‑1 (MQ=255) cccGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATgg < 3:241855/149‑1 (MQ=255) cGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGgcgcgc < 6:44985/142‑1 (MQ=255) cGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGgcgcgc > 5:44985/1‑142 (MQ=255) cGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATgg > 2:17466/1‑147 (MQ=255) gTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCAc < 8:49993/149‑1 (MQ=255) gTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCAc > 6:132525/1‑149 (MQ=255) gTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCAc < 2:50087/149‑1 (MQ=255) ccACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCGCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTgg > 5:51729/1‑117 (MQ=255) ccACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTgg < 6:51729/117‑1 (MQ=255) ccACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGc > 2:262928/1‑148 (MQ=255) cACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCaa < 8:181462/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTc < 5:94263/149‑1 (MQ=255) gtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgc < 2:21171‑M1/1‑1 (MQ=255) gtgcttgacccccagatgaattgccagggtgctgccatggcgcgccaggtcacccaactgc > 1:21171‑M1/61‑61 (MQ=255) gcgcCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCTGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTgggg < 3:303913/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTgggg < 1:126156/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTgggg < 1:262928/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAAtt > 6:300126/1‑133 (MQ=255) ccTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAAtt < 5:300126/133‑1 (MQ=255) cTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCa > 8:304959/1‑149 (MQ=255) tGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTcgcg > 3:175753/1‑149 (MQ=255) gCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTg > 7:158203/1‑149 (MQ=255) aCGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGc > 7:123450/1‑149 (MQ=255) ccTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGt < 7:304959/148‑1 (MQ=255) gcAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCAc > 1:105925/1‑148 (MQ=255) aCCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACgg < 4:175753/149‑1 (MQ=255) tGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGgcgcg < 3:282673/149‑1 (MQ=255) CTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTg < 7:21234‑M1/149‑1 (MQ=255) CTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGGTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTg < 5:331555‑M1/149‑1 (MQ=255) | TACGGCGCCATCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCAGACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTG > NC_002947/3859422‑3859714 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |