New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4024969 = | 64 (1.270) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 7.1% | coding (730/1194 nt) | emrA | multidrug transporter membrane fusion protein |
? | NC_002947 | 4025047 = | 45 (0.950) | coding (652/1194 nt) | emrA | multidrug transporter membrane fusion protein |
CAAGGCTGTCGACCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTG > NC_002947/4024822‑4025113 | cAAGGCTGTCGACCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATg > 6:204123/1‑149 (MQ=255) cAAGGCTGTCGACCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATg > 5:137388/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGACCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTcg > 1:213789/1‑149 (MQ=255) caggctgccgtcaacagcgcgcggcaacagctcagcaccagcagcgcgctggtcgacgacaccgtggtgtcctcgcaccccgatgtcatggctgcagctgccgacctgcgccaggcctacctcgaccacgcccgcaccacgtTGGTcgc > 6:313086‑M1/143‑149 (MQ=255) gtcgtcCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCgg > 8:199362/1‑149 (MQ=255) tCGACCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTcgcg < 5:204123/147‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCgg < 6:137388/149‑1 (MQ=255) ccGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTg < 8:136479/149‑1 (MQ=255) gCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTg > 8:172696/1‑147 (MQ=255) tACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGgc < 8:222563/148‑1 (MQ=255) cTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCt > 1:286656/1‑149 (MQ=255) ttGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTg > 8:101271/1‑149 (MQ=255) ggcaacagctcagcaccagcagcgcgctggtcgacgacaccgtggtgtcctcgcaccccgatgtcatggctgcagctgccgacctgcgccaggcctacctcgaccacgcccgcaccacgtTGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTgg < 2:157220‑M1/29‑1 (MQ=255) cTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGccc > 3:27446/1‑148 (MQ=255) cTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGccc > 8:2756/1‑148 (MQ=255) cTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTCGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGccc > 6:140356/1‑148 (MQ=255) cACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGGTGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGcc < 4:22027/145‑1 (MQ=255) cACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGGTGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGcc > 3:22027/1‑145 (MQ=255) ccGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAc < 2:213789/149‑1 (MQ=255) acaTCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGACCAA‑CTGGAC‑GGTACg > 2:265300/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCt > 6:50706/1‑149 (MQ=255) aGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGGTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTg < 1:141331/148‑1 (MQ=255) gCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGc < 7:101271/149‑1 (MQ=255) gTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGAc > 6:159176/1‑149 (MQ=255) ttCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGc > 5:102448/1‑149 (MQ=255) cgacgacaccgtggtgtcctcgcaccccgatgtcatggctgcagctgccgacctgcgccaggcctacctcgaccacgcccgcaccacgtTGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGc < 2:137762‑M1/60‑1 (MQ=255) cACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTgg > 2:209943/1‑115 (MQ=255) cACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTgg < 1:209943/115‑1 (MQ=255) cACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCg < 3:57734/148‑1 (MQ=255) cACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCGGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCg < 1:205086/148‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTg < 7:199362/149‑1 (MQ=255) tGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCAt < 3:203245/80‑1 (MQ=255) tGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCAt > 4:203245/1‑80 (MQ=255) gCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACCCCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCgg < 2:286656/147‑1 (MQ=255) gCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGgcg > 5:113557/1‑149 (MQ=255) aTGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGTGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGAc > 4:106272/1‑149 (MQ=255) cgcATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCaa < 7:2756/149‑1 (MQ=255) cgcATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCa < 7:172696/148‑1 (MQ=255) gcaccccgatgtcatggctgcagctgccgacctgcgccaggcctacctcgaccacgcccgcaccacgtTGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCaa > 1:137762‑M1/69‑147 (MQ=255) gcaccccgatgtcatggctgcagctgccgacctgcgccaggcctacctcgaccacgcccgcaccacgtTGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACg > 1:157220‑M1/69‑149 (MQ=255) aTCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACgt > 3:286926/1‑149 (MQ=255) ctctcGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGt < 5:195600/108‑1 (MQ=255) ctctcGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGt > 6:195600/1‑108 (MQ=255) gCAGCTGGTTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCgg < 4:110151/149‑1 (MQ=255) gCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGgc > 2:193361/1‑131 (MQ=255) gCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGgc < 1:193361/131‑1 (MQ=255) aGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTa < 1:94266/102‑1 (MQ=255) aGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTa > 2:94266/1‑102 (MQ=255) ggTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGt < 5:140356/149‑1 (MQ=255) cTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGgcgc < 5:129211/120‑1 (MQ=255) cTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGgcgc > 6:129211/1‑120 (MQ=255) cTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGGCCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAgg > 4:53934/1‑148 (MQ=255) cTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCgg < 1:95478/136‑1 (MQ=255) cTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCgg > 2:95478/1‑136 (MQ=255) cTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAgg > 7:194196/1‑148 (MQ=255) ggCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTgg < 2:83895/148‑1 (MQ=255) aTCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGgcg > 7:122491/1‑147 (MQ=255) aTCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGgcg > 7:98044/1‑147 (MQ=255) aTCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTc < 4:286926/149‑1 (MQ=255) cacCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAg < 5:50706/149‑1 (MQ=255) cacCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAg < 4:27446/149‑1 (MQ=255) acCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGcc > 4:268827/1‑132 (MQ=255) acCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGcc < 3:268827/132‑1 (MQ=255) ccTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCTAAGGTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGc > 1:92777/1‑149 (MQ=255) ccTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCt > 6:197817/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCa < 5:159176/148‑1 (MQ=255) aTCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAg < 6:102448/149‑1 (MQ=255) cAGTGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCa < 3:106272/149‑1 (MQ=255) aGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCAt > 7:94837/1‑149 (MQ=255) aGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCAt > 7:53018/1‑149 (MQ=255) gCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCAt > 5:102566/1‑148 (MQ=255) gggATGACCGCCATTGGCGGGGTGCCCGGGTGGAGGGGCTTGCCCAATCCACCCGGGTACGCTTGGCGACGTAGCCAGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCAt < 1:265300/148‑1 (MQ=255) ccGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCgggg > 2:244833/1‑149 (MQ=255) gCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTg < 8:94837/149‑1 (MQ=255) | CAAGGCTGTCGACCGTGCCGCTGTACTTGACCTCACTGCCGTACACATCAGCGGTGATTTCCACCGGCTGGCCGATGCGCATCTCTCGCAGCTGGGTTTCCTTGAAGTTGGCATCGATCCACACCTGATCCAGCGGGATGACCGCCATGGTCGCGGTGCCCGGCTGCAGGCGCTGGCCCAA‑CTGGAC‑GGTACGCTTGGCGACGTAGCCGGTGACCGGCGCGACCAACGTGGTGCGGGCGTGGTCGAGGTAGGCCTGGCGCAGGTCGGCAGCTGCAGCCATGACATCGGGGTG > NC_002947/4024822‑4025113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |