New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4073100 = | 53 (1.050) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 7.1% | coding (363/1308 nt) | mdtA | multidrug transporter membrane fusion protein |
? | NC_002947 | 4073133 = | 55 (1.150) | coding (330/1308 nt) | mdtA | multidrug transporter membrane fusion protein |
CCAGTGTTTGCTTGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAGGGGGAAGTCGCCTATC > NC_002947/4072952‑4073244 | cagcgacccggtacccgtacgcgtcgtgccggtgcggataggcgacttccccctctactacaaagccttgggcacggttaccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaag < 5:213707‑M1/1‑1 (MQ=255) gcgacccggtacccgtacgcgtcgtgccggtgcggataggcgacttccccctctactacaaagccttgggcacggttaccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaaGGc < 5:258522‑M1/3‑1 (MQ=255) cTTGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑gg < 7:74594/148‑1 (MQ=255) ttGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTc > 1:208900/1‑149 (MQ=255) ttGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTc > 5:260181/1‑149 (MQ=255) ttGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTc > 4:307140/1‑149 (MQ=255) ttGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTc > 2:79801/1‑149 (MQ=255) gCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAAATTTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGACTGCTTCAGGGCTATGCTATAAGTGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGcc < 8:167888/148‑1 (MQ=255) ttCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGAc < 7:14647/147‑1 (MQ=255) ttCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGAc > 8:14647/1‑147 (MQ=255) gCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTg > 7:139944/1‑149 (MQ=255) aCAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGcct > 2:167429/1‑149 (MQ=255) aGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttc > 4:159422/1‑149 (MQ=255) taggcgacttccccctctactacaaagccttgggcacggttaccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaag < 6:191846‑M1/1‑1 (MQ=255) taggcgacttccccctctactacaaagccttgggcacggttaccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaag > 5:191846‑M1/111‑111 (MQ=255) cTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTg < 6:260181/149‑1 (MQ=255) cTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTg < 2:208900/149‑1 (MQ=255) taGCGGGCCAGGTCGACCTGAGGGTTCTACAACTGTGACTGGTTCTGCGACAAGGTGCGTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGACGATTTCGGGCAGCA‑GGTCGCCAGCGTTGACGCGCTGGCGTTCATTGaatt > 7:202824/1‑146 (MQ=255) gCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTgg < 1:167429/148‑1 (MQ=255) gCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTgg < 8:202824/148‑1 (MQ=255) cccctctactacaaagccttgggcacggttaccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccccttcaaggaaGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttcc < 2:277579‑M1/37‑1 (MQ=255) cccctctactacaaagccttgggcacggttaccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaaGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttcc > 1:277579‑M1/100‑136 (MQ=255) gTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCa < 3:307140/149‑1 (MQ=255) cTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttcctt > 6:248949/1‑126 (MQ=255) cTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttcctt < 5:248949/126‑1 (MQ=255) aGCGTTCTTCAACTGTGCCTTGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAATGGCGCGGGTCGTTTTCGGCCAGCATGTTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCgcc < 1:79801/148‑1 (MQ=255) cGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCAc > 4:18373/1‑136 (MQ=255) cGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCAc < 3:18373/136‑1 (MQ=255) cGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCgccagcc > 2:297892/1‑149 (MQ=255) cttcAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCAcgc > 1:310297/1‑149 (MQ=255) ttcAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCAcgcg > 6:307385/1‑149 (MQ=255) tgCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTgcgc < 6:329038/148‑1 (MQ=255) tgCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTgcgc < 3:159422/148‑1 (MQ=255) ccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaaGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttcct > 6:149494‑M1/69‑106 (MQ=255) ccgcgaccaatacggtcaatgtgcgcagccgcgtggctggcgaactggtgaaaatccacttcaaggaaGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGccttcct < 5:149494‑M1/38‑1 (MQ=255) ccTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGcaca < 2:311446/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGcaca > 1:311446/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGcaca > 2:66686/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGAtt > 6:72344/1‑115 (MQ=255) cTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGAtt < 5:72344/115‑1 (MQ=255) cTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACAt > 6:2603/1‑149 (MQ=255) gTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGa > 6:258522/1‑149 (MQ=255) cAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTgg > 6:188070/1‑149 (MQ=255) ggTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACTCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTcg < 2:310297/149‑1 (MQ=255) gTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTcgc < 5:307385/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTCGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTcgc < 7:54144/145‑1 (MQ=255) cTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTAGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTcgc > 8:54144/1‑145 (MQ=255) cGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTc < 4:20409/103‑1 (MQ=255) cGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTc > 3:20409/1‑103 (MQ=255) ccTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTg < 1:297892/149‑1 (MQ=255) tgcAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGccc > 8:305125/1‑147 (MQ=255) tgcAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGccc > 8:212202/1‑147 (MQ=255) cAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCaa < 7:305125/147‑1 (MQ=255) gggCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCt < 7:212202/149‑1 (MQ=255) cgatgcgatAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTg < 1:66686/149‑1 (MQ=255) atAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTgtagta > 2:236203/1‑147 (MQ=255) atAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTgtagta > 6:194991/1‑147 (MQ=255) aGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAgg < 5:2603/148‑1 (MQ=255) gggCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAgg > 6:247505/1‑147 (MQ=255) gggCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAgg < 5:247505/147‑1 (MQ=255) ggCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAgggg > 3:29228/1‑148 (MQ=255) tttCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAGGGGGAAGTCGCCTATc > 6:188034/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTg > 5:188939/1‑86 (MQ=255) cGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTg < 6:188939/86‑1 (MQ=255) cGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAg < 7:253890/116‑1 (MQ=255) cGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACAAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAg > 8:253890/1‑116 (MQ=255) | CCAGTGTTTGCTTGGCGATGCTGTCTTCAGCGTACAGGCCTTTATAGCGGGCCAGGTCGACCTGAGCGTTCTTCAACTGTGCCTGGTTCTGCGCCAAGGTGCCTTCGGCCTGCTGCAGGGCGATGCGATAAGGGCGCGGGTCGATTTCGGCCAGCA‑GGTCGCCAGCCTTGACGCGCTGGCCTTCCTTGAAGTGGATTTTCACCAGTTCGCCAGCCACGCGGCTGCGCACATTGACCGTATTGGTCGCGGTAACCGTGCCCAAGGCTTTGTAGTAGAGGGGGAAGTCGCCTATC > NC_002947/4072952‑4073244 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |