New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4093994 | 54 (1.070) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.5% | coding (991/1581 nt) | PP_3602 | 2,5‑dioxovalerate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4094016 | 53 (1.120) | coding (1013/1581 nt) | PP_3602 | 2,5‑dioxovalerate dehydrogenase |
TGGCGAGGCCATTGCCCGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGC > NC_002947/4093846‑4094140 | tGGCGAGGCCATTGCCCGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCG > 2:199769‑M1/1‑149 (MQ=255) gAGGCCATTGCCCGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGc > 1:310386/1‑148 (MQ=255) gCCATTGCCCGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCaaa < 7:282695/148‑1 (MQ=255) cATTGCCCGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCa > 1:78283/1‑149 (MQ=255) cccGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCt < 8:190905/148‑1 (MQ=255) ccGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCACCCCTGGGCTGGGGATTGGCTTGCAGGCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCCTGCTc > 6:269250/1‑148 (MQ=255) ccGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTc > 2:71219/1‑148 (MQ=255) gTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTg < 6:144150/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTgg > 6:27859/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTgg < 5:109164/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTg < 2:268723/148‑1 (MQ=255) gCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGcg > 5:131353‑M2/1‑146 (MQ=255) ggggTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCa > 6:22566/1‑126 (MQ=255) ggggTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCa < 5:22566/126‑1 (MQ=255) ggTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGcggcttg > 1:71219‑M2/1‑142 (MQ=255) tCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGccagcattgagcatggtttgcccggcttgct < 1:199769‑M1/149‑32 (MQ=255) tCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGca < 5:216433/149‑1 (MQ=255) cgagtgCAAGGCTGCCGGGCAGTTATGCACGAACCCATGGCTGGAGATTGGCTTCCAGTCGCCACAGTAAAGCCAACTGCACGAAGACCTACGCCACTACCTGCACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTCGCGGCTTGcaca > 2:165681/4‑149 (MQ=255) gtgtGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGccagcattgagcatggtttgcccggcttg > 3:106322‑M1/1‑115 (MQ=255) gtgtGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGccagcattgagcatggtttgcccggcttg < 4:106322‑M1/144‑30 (MQ=255) cATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTAc < 2:8677/148‑1 (MQ=255) aTGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGt > 8:152813/1‑149 (MQ=255) aTGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGt < 8:139590/149‑1 (MQ=255) aTGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGt > 6:60042/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTcggcg < 2:310386/149‑1 (MQ=255) cGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGcc < 5:322133/149‑1 (MQ=255) gggCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTcggc < 5:174801/144‑1 (MQ=255) gggCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTcggc > 6:174801/1‑144 (MQ=255) gggCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCt < 2:254799/149‑1 (MQ=255) ggCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCtt < 2:78283/149‑1 (MQ=255) aGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGaa < 6:63512/149‑1 (MQ=255) gTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAac < 5:27859/149‑1 (MQ=255) tGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTg < 7:105779/142‑1 (MQ=255) tGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTg > 8:105779/1‑142 (MQ=255) gCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCggcggc > 7:50209/1‑137 (MQ=255) gCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCggcggc < 8:50209/137‑1 (MQ=255) ccAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGcat > 6:202210/1‑149 (MQ=255) ccAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGcat > 4:173951/1‑149 (MQ=255) gcccAGGGTTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGcat < 6:332031/145‑1 (MQ=255) gcccAGGGTTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGcat > 5:332031/2‑146 (MQ=255) gCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCg > 8:123341/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATc > 5:309513/1‑147 (MQ=255) aGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTggcc < 7:152813/149‑1 (MQ=255) tCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTggccgg > 2:214873/1‑149 (MQ=255) gCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTggccggcc < 5:202210/149‑1 (MQ=255) cacaGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAg < 5:60042/149‑1 (MQ=255) cAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAg > 4:52273/1‑148 (MQ=255) gcgaCTGCAAGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAg < 8:249259/146‑1 (MQ=255) cAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGGCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAgg < 6:193193/149‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAAc > 3:61158/1‑149 (MQ=255) tCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGa > 1:151259/1‑88 (MQ=255) tCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGa < 2:151259/88‑1 (MQ=255) cGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAgg > 7:58200/1‑149 (MQ=255) gCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCa < 2:61329/116‑1 (MQ=255) gCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCa > 1:61329/1‑116 (MQ=255) aCCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGACCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGgcgcgc > 2:184181/1‑149 (MQ=255) ccAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGc > 7:271503/1‑149 (MQ=255) tACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGtt < 6:309513/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCTATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGc < 3:52273/148‑1 (MQ=255) aGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGcggcttgctggtccaggtactggccaaggtcggcgagcagttggctgtactgtggcgactgcaagccaatcaccagcccagggttggtgcagaactgcccggcacccatgcacacgga < 1:199769‑M2/149‑119 (MQ=255) aGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCa < 3:69269/91‑1 (MQ=255) aGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCa > 4:69269/1‑91 (MQ=255) gCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATg > 4:274648/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGccagcattgagcatggtttgcccggcttgctggtccaggtactggccaaggtcggcgagcagttggctgtactgtggcgactgcaagccaatcaccagcccagggttggtgcagaactgcccggcacccatgcacacggacc > 1:71219‑M1/1‑7 (MQ=255) cAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGcggcttgctggtccaggtactggccaaggtcggcgagcagttggctgtactgtggcgactgcaagccaatcaccagcccagggttggtgcagaactgcccggcacccatgcacac < 4:106322‑M2/144‑116 (MQ=255) cAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGcggcttgctggtccaggtactggccaaggtcggcgagcagttggctgtactgtggcgactgcaagccaatcaccagcccagggttggtgcagaactgcccggcacccatgcacac > 3:106322‑M2/1‑29 (MQ=255) cAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGc < 3:173951/149‑1 (MQ=255) aGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCAc < 8:271503/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACg > 3:65908/1‑149 (MQ=255) ccGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAGGGCCGAGGCACGc > 8:107493/1‑149 (MQ=255) ccGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGc < 3:274648/149‑1 (MQ=255) cgccagcattgagcatggtttgcccggcttgctggtccaggtactggccaaggtcggcgagcagttggctgtactgtggcgactgcaagccaatcaccagcccagggttggtgcagaactgcccggcacccatgcacacggaccccgc > 5:131353‑M1/1‑2 (MQ=255) | TGGCGAGGCCATTGCCCGCGAGTTGGCGGGGTCCGTGTGCATGGGTGCCGGGCAGTTCTGCACCAACCCTGGGCTGGTGATTGGCTTGCAGTCGCCACAGTACAGCCAACTGCTCGCCGACCTTGGCCAGTACCTGGACCAGCAAGCCGGGCAAACCATGCTCAATGCTGGCGGCTTGCACAGCTACGTCGGCGGCCTTGAACACTTGCATGCCCATGCCGGTATCGAGCATGTGGCCGGCCAGGTGCAGGAAGGCAACCAGGCGCGCGCTCAGCTGTTCAAGGCCGATGCACGC > NC_002947/4093846‑4094140 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |