New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5345057 = | 48 (0.950) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 8.1% | coding (455/1935 nt) | acsA‑II | acetyl‑CoA synthetase |
? | NC_002947 | 5345106 = | 45 (0.940) | coding (504/1935 nt) | acsA‑II | acetyl‑CoA synthetase |
CAAGGCCATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAACAGAACGTCGAC > NC_002947/5344911‑5345205 | cAAGGCCATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCa > 5:235195/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCa > 2:313437/1‑149 (MQ=255) aaGGCCATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCAt > 2:278032/1‑149 (MQ=255) accaccaacacgctactgaccgctgggcagctggccagggccttgtcgacgttctgtttcagcgggatgcgtttgccgccacgcacgccttcatcggcggtgatcacggtgcggcagtcggcatcgagaatgcggtctcgcaagGCATc > 4:307083‑M1/145‑149 (MQ=255) cctccaacacgctactgaccgctggggagcttgccagggccttgtcgacgttctgtttcagcgggatgcgtttgccgccacgcacgccttcatcggcggtgatcacggtgctgcagtcggcatcgagaatgcggtctcgcaagGCATCg > 7:254177‑M1/144‑149 (MQ=255) cATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGc < 6:312419/142‑1 (MQ=255) cATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGc > 5:312419/1‑142 (MQ=255) cTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATc > 4:75288/1‑148 (MQ=255) ccGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCa < 6:235195/147‑1 (MQ=255) aaCTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCggtg < 1:278032/149‑1 (MQ=255) aCTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCggtg < 4:98848/148‑1 (MQ=255) ggcagctggccagggccttgtcgacgttctgtttcagcgggatgcgtttgccgccacgcacgccttcatcggcggtgatcacggtgcggcagtcggcatcgagaatgcggtctcgcaagGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTcg < 5:168907‑M1/30‑1 (MQ=255) aGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGt < 8:263237/149‑1 (MQ=255) ccgccTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTccc > 4:180479/1‑149 (MQ=255) cgccTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTtctc < 3:249967/146‑1 (MQ=255) cgccTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTtctc > 4:249967/1‑146 (MQ=255) gCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGAt < 7:234228/147‑1 (MQ=255) gCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCAACTCGGTGGTCTTCGGCGGTTTCTCCCACGATGc > 2:305391/1‑149 (MQ=255) tcgacgttctgtttcagcgggatgcgtttgccgccacgcacgccttcatcggcggtgaacacggtgcggcagtcggcatcgagaatgcggtctcgcaagGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGc > 1:84349‑M1/100‑148 (MQ=255) ccAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGcc > 2:99679/1‑149 (MQ=255) gacgttctgtttcagcgggatgcgtttgccgccacgcacgccttcatcggcggtgatcacggtgcggcagtcggcatcgagaatgcggtctcgcaagGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCtt > 5:296690‑M1/98‑149 (MQ=255) tgcaatgAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCGGATGCCtt < 4:316453/147‑1 (MQ=255) tgcaatgAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCtt > 3:316453/1‑147 (MQ=255) tgcaatgAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGc < 1:99679/149‑1 (MQ=255) aatgAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGc > 3:304999/1‑146 (MQ=255) tgAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGAc < 3:75288/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATtct > 8:263347/1‑149 (MQ=255) gcgGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATtctc < 4:304999/149‑1 (MQ=255) ggatgcgtttgccgccacgcacgccttcatcggcggtgatcacggtgcggcagtcggcatcgagaatgcggtctcgcaagGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCg > 6:168907‑M1/81‑149 (MQ=255) ggTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGa < 3:208127/149‑1 (MQ=255) tgAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCTGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGAc > 8:87523/1‑134 (MQ=255) tgAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCTGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGAc < 7:87523/134‑1 (MQ=255) aagaaAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCggtg < 2:117143/96‑1 (MQ=255) aagaaAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGa > 8:249234/1‑149 (MQ=255) aaaGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTg > 6:207865/1‑149 (MQ=255) aaGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGc < 8:190993/149‑1 (MQ=255) cGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCa > 6:233507/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCAcc < 5:296892/149‑1 (MQ=255) gTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGAt < 1:305391/149‑1 (MQ=255) cATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGc > 3:64548/1‑126 (MQ=255) cATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGc < 4:64548/126‑1 (MQ=255) aTCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCAccgc > 7:189498/1‑149 (MQ=255) cTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCCCTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCAccgccg > 4:49037/1‑149 (MQ=255) cATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGAt > 7:186299/1‑148 (MQ=255) tGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGa < 3:83922/145‑1 (MQ=255) tGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGa > 4:83922/1‑145 (MQ=255) tGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGaa < 5:207865/149‑1 (MQ=255) aaTGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGc > 6:329840/1‑114 (MQ=255) aaTGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGc < 5:329840/114‑1 (MQ=255) aaTGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGgcg > 6:176140/1‑149 (MQ=255) aTGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCAGCTGCCTTGCGAGACAGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGgcgt > 2:261941/1‑149 (MQ=255) cGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTggcg < 3:180479/149‑1 (MQ=255) gAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTggcgg > 4:21170/1‑149 (MQ=255) gccTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCaa > 6:325335/1‑146 (MQ=255) gccTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCaa < 5:325335/146‑1 (MQ=255) ccATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGgcgt > 6:273377/1‑127 (MQ=255) cTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGa < 1:313437/148‑1 (MQ=255) gCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAAc < 8:189498/148‑1 (MQ=255) ccTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAACAg < 5:176140/149‑1 (MQ=255) ccGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAACAGAACGTc > 7:282513/1‑148 (MQ=255) ccGCATCGGCGCCATCCACTAGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAACAGAACGTc > 2:273286/1‑148 (MQ=255) GCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAACAGAACGTCGAc > 1:273286‑M1/1‑149 (MQ=255) | CAAGGCCATCACCTACCGCGAACTGCACCGTCAGGTCTGCCGCCTGGCCAATGCAATGAAAGCGCGCGGTGTGAAGAAAGGCGACCGGGTAAGCATCTACATGCCAATGATTCCCGAGGCCGCCTTCGCCATGCTCGCCTGCACCCGCATCGGCGCCATCCACTCGGTGGTGTTCGGCGGTTTCTCCCCCGATGCCTTGCGAGACCGCATTCTCGATGCCGACTGCCGCACCGTGATCACCGCCGATGAAGGCGTGCGTGGCGGCAAACGCATCCCGCTGAAACAGAACGTCGAC > NC_002947/5344911‑5345205 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |