| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6048398 = | 81 (1.610) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 4.1% | coding (873/1050 nt) | PP_5300 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 6048434 = | 63 (1.310) | coding (909/1050 nt) | PP_5300 | LysR family transcriptional regulator | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTGCCGTGGATCGCACCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTGTTCG > NC_002947/6048255‑6048537 | ctcagagcatcgcgtcacgcaaccgcggggtcagctcttcgaacaaggtctgcaccgagcgcaacgcccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGgcagc < 4:60414‑M1/6‑1 (MQ=255)ctcagagcatcgcgtcacgcaaccgcggggtcagctcttcgaacaaggtctgcaccgagcgcaacgcccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGgcagc < 3:70604‑M1/6‑1 (MQ=255)ctcagagcatcgcgtcacgcaaccgcggggtcagctcttcgaacaaggtctgcaccgagcgcaacgcccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGgcagc > 7:52757‑M1/144‑149 (MQ=255) tGCCGTGGATCGCACCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGgcagca < 5:264601/149‑1 (MQ=255) gtcacgcaaccgcggggtcagctcttcgaacaaggtctgcaccgagcgcaacgcccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGgc < 5:130345‑M1/3‑1 (MQ=255) gtcacgcaaccgcggggtcagctcttcgaacaaggtctgcaccgagcgcaacgcccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGgc > 6:130345‑M1/131‑133 (MQ=255) cACCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTa > 7:167566/1‑148 (MQ=255) aCCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACa < 2:60377/149‑1 (MQ=255) aCCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACa < 2:64947/149‑1 (MQ=255) aCCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACa < 6:158777/149‑1 (MQ=255) aGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑g < 2:59213/139‑1 (MQ=255) aGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑g > 1:59213/1‑139 (MQ=255) gacgacTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGt > 6:212535/1‑149 (MQ=255) gacTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCa > 8:277398/1‑149 (MQ=255) cTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATg > 8:119650/1‑149 (MQ=255) gttGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATgcg < 3:216701/146‑1 (MQ=255) aTGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCt < 8:167566/149‑1 (MQ=255) cagACCACCGTAGGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGccc > 6:147956/3‑149 (MQ=255) cagACCACCGTAGGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGccc > 6:122944/3‑149 (MQ=255) ggACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCg < 4:300887/149‑1 (MQ=255) agctcttcgaacaaggtctgcaccgagcgcaacgcccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCg > 1:14981‑M1/112‑149 (MQ=255) accaccCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCggg < 1:299081/149‑1 (MQ=255) ccTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGa > 1:74919/1‑149 (MQ=255) tCTGGCGCAACCAAGAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTg > 7:273763/1‑137 (MQ=255) tCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTg < 8:273763/137‑1 (MQ=255) tCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGc > 3:83795/1‑149 (MQ=255) gcgcAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGcc > 8:219198/1‑149 (MQ=255) cgcAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGccc < 4:83795/149‑1 (MQ=255) gcAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGcccc > 6:280794/1‑149 (MQ=255) gcAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGcccc < 2:74919/149‑1 (MQ=255) gcAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGcccc > 2:114933/1‑149 (MQ=255) gcAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACAATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGcccc > 4:127896/1‑149 (MQ=255) ccaacAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGc < 5:280794/149‑1 (MQ=255) caacaaCACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGcc > 6:48197/1‑149 (MQ=255) aacaacCCCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCTGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGccc < 2:272810/149‑1 (MQ=255) aacaacACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGCTGCACTCAGCGGCCCCCTGccc > 8:302121/1‑149 (MQ=255) aacaacACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGAt < 7:75313/128‑1 (MQ=255) aacaacACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGAt > 8:75313/1‑128 (MQ=255) aacaacACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGccc > 2:207289/1‑149 (MQ=255) aacaacACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGccc > 3:261240/1‑149 (MQ=255) aacaacACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGccc > 5:235430/1‑149 (MQ=255) acaacaCCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACt > 8:290780/1‑98 (MQ=255) acaacaCCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACt < 7:290780/98‑1 (MQ=255) acaacaCCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCg > 2:314411/1‑149 (MQ=255) aacaCCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGc > 2:278105/1‑149 (MQ=255) acacCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCt < 5:48197/149‑1 (MQ=255) cacCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCggg < 2:69183/117‑1 (MQ=255) cacCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCggg > 1:69183/1‑117 (MQ=255) ccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATgcg < 8:189206‑M1/31‑1 (MQ=255) ccggcaatccggccgggtcagcaaccacaactgagtgtcgcagccgggcagggggccgctgagtgcatccaccccgGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATgcg > 7:189206‑M1/77‑107 (MQ=255) acCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGc < 5:78349/149‑1 (MQ=255) cccGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCg < 7:219198/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACt > 3:140483/1‑147 (MQ=255) gAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCg < 5:21285/104‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCg > 6:21285/1‑104 (MQ=255) gAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGt < 7:119650/149‑1 (MQ=255) gAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGt > 5:77516/1‑149 (MQ=255) aGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAg < 7:277398/147‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAg < 1:278105/147‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAg < 5:212535/147‑1 (MQ=255) cTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGc < 5:122944/149‑1 (MQ=255) cAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGAc > 3:133093/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGAccc > 6:154140/1‑149 (MQ=255) agcagcaTGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACccggcc > 6:291329/1‑149 (MQ=255) gcagcaTGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACccggccg > 3:61452/1‑149 (MQ=255) gTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCACGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGcc > 2:305654/1‑149 (MQ=255) tCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCg > 3:88217/1‑149 (MQ=255) tCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCg < 5:154140/149‑1 (MQ=255) gACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCCGGGAGTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCgg > 1:75710/1‑149 (MQ=255) gACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCggg > 3:142783/1‑149 (MQ=255) gACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCggg < 7:140988/149‑1 (MQ=255) gACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCgg < 6:77516/148‑1 (MQ=255) gACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCgg < 5:291329/148‑1 (MQ=255) cATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGt > 3:90864/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTgcg < 1:305654/149‑1 (MQ=255) aGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCg > 2:91583/1‑149 (MQ=255) gTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGa > 7:53753/1‑129 (MQ=255) gTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGa < 8:53753/129‑1 (MQ=255) gTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCgg < 1:207289/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGAc > 4:110748/1‑149 (MQ=255) aTGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGAc < 4:140483/149‑1 (MQ=255) gccggccTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGTGTTGCGCTCGGTGCAGACCt < 4:88217/148‑1 (MQ=255) ccggccTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTg > 2:31449/1‑149 (MQ=255) ggccTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTGtt < 1:114933/149‑1 (MQ=255) gccTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCTGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTGTTc < 4:61452/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTGTTCg < 6:235430/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTGTTCg < 4:261240/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTgg < 1:233532/96‑1 (MQ=255) cTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTgg > 2:233532/1‑96 (MQ=255) | GTGCCGTGGATCGCACCAGACGACTCGATGCAGGACCACCCTACGGTGGTCTGGCGCAACCAACAACACCCGGGCCTGAGCCCGCGCTACCAGTGCAGCAGCATGTCGACCATCGCCCAGTTGGTAATGGCCGGCCTGGGCGTGGCAGCACTGCC‑GGACTACATGGTGCATGCGCTGCCCGGGGTGGATGCACTCAGCGGCCCCCTGCCCGGCTGCGACACTCAGTTGTGGTTGCTGACCCGGCCGGATTGCCGGGCGTTGCGCTCGGTGCAGACCTTGTTCG > NC_002947/6048255‑6048537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |