New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6079905 | 44 (0.870) | 5 (0.100) | 5/248 | NT | 10.6% | coding (319/399 nt) | PP_5331 | acyl‑CoA thioesterase |
? | NC_002947 | = 6079927 | 42 (0.870) | coding (341/399 nt) | PP_5331 | acyl‑CoA thioesterase |
GCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGA > NC_002947/6079767‑6080051 | gCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGt > 6:96282/1‑149 (MQ=255) cGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATg < 1:207760/135‑1 (MQ=255) cGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATg > 2:207760/1‑135 (MQ=255) ccGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAg < 7:68838/149‑1 (MQ=255) gCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATaccgcttcggtgaccttgcg > 7:166520‑M1/1‑129 (MQ=255) cATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCgg < 3:165883/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCgg > 6:50975/1‑148 (MQ=255) ggCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGt > 4:54794/1‑147 (MQ=255) ggCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGt < 3:54794/147‑1 (MQ=255) cTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcg < 5:18224‑M1/149‑28 (MQ=255) ttCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcg < 5:185608‑M2/148‑6 (MQ=255) cTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctg < 8:166520‑M1/148‑31 (MQ=255) cTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTAttcgtctt < 6:86888/149‑1 (MQ=255) ggTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTAttcgtcttcg > 1:302345/1‑149 (MQ=255) gTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTAttcgtcttcgt > 4:25259/1‑149 (MQ=255) ccGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGc > 7:285666/1‑148 (MQ=255) tcgGTCGGCTCACAGATGTCTTTCTATACCCAGCCGCTGTAATTCCGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGGCCAGCGAATGGCGCACGGTCACCGAATCGGTATTCGTCTTCGTCGCTATCgt < 2:247911/148‑2 (MQ=255) cgGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGgcg < 7:52217/109‑1 (MQ=255) cgGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGgcg > 8:52217/1‑109 (MQ=255) gTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACgg < 5:96282/149‑1 (MQ=255) ggCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCa < 6:185608/148‑1 (MQ=255) ggCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCa < 7:152156/148‑1 (MQ=255) cacaGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGt < 2:302345/149‑1 (MQ=255) aGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAg > 1:129240/1‑142 (MQ=255) gTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctggacag > 2:133387‑M1/1‑89 (MQ=255) gTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctggacag < 1:133387‑M1/124‑36 (MQ=255) tttCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCt > 5:195087/1‑149 (MQ=255) ataCCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTg > 5:184357/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCtc < 4:38285/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCtc > 7:235096/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCAATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCtc > 3:201926/1‑149 (MQ=255) ccTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCt < 5:50975/149‑1 (MQ=255) cGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGc > 8:214940/1‑144 (MQ=255) cGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGc < 7:214940/144‑1 (MQ=255) ccGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTgg < 8:285666/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGACACGCTGGCgg > 7:61443/1‑149 (MQ=255) cTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTa > 3:311502/1‑148 (MQ=255) gatgGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATc > 6:265968/1‑149 (MQ=255) gAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCgg > 7:63914/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCTATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGt < 4:201926/149‑1 (MQ=255) gCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGcc > 5:149664/1‑149 (MQ=255) gacgacCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCa > 6:208723/1‑149 (MQ=255) gacCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTg < 5:208723/149‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGt > 4:122527/1‑64 (MQ=255) gCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGt < 3:122527/64‑1 (MQ=255) cTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagac > 2:133387‑M2/1‑35 (MQ=255) cTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagac < 1:133387‑M2/124‑90 (MQ=255) tCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 2:59734/1‑149 (MQ=255) ccAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 7:212035/1‑148 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccag < 8:166520‑M2/148‑119 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAgg > 8:94687/1‑131 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAgg < 7:94687/131‑1 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 6:325130/1‑147 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCAt > 6:121848/1‑109 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCAt < 5:121848/109‑1 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 5:330445/1‑146 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATgag < 6:330445/149‑1 (MQ=255) cGAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccaggaa < 5:185608‑M1/148‑144 (MQ=255) cGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccaggaag < 5:18224‑M2/149‑123 (MQ=255) aaTGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGagaaga < 5:265968/149‑1 (MQ=255) | GCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGA > NC_002947/6079767‑6080051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |