New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 159100 | 60 (1.190) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.4% | coding (1289/1956 nt) | PP_0149 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 159166 | 49 (1.030) | coding (1223/1956 nt) | PP_0149 | hypothetical protein |
GCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGGTGTATTCGTCGATCACCTG > NC_002947/159018‑159311 | gcgcgGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAgttgt > 4:227935/1‑149 (MQ=255) gcacgGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAgttgt < 4:276971/146‑1 (MQ=255) cgcgGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCATGGCACAGTTGTt > 1:196305‑M2/1‑148 (MQ=255) cgcgGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTt > 3:227935‑M2/1‑148 (MQ=255) cgcgGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGGGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTC‑ACGGCACAGTTGTtg > 6:277002‑M2/1‑147 (MQ=255) gcgGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtg < 8:246028‑M2/149‑3 (MQ=255) gggTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtgga > 7:298885‑M2/1‑145 (MQ=255) gTTATCAAGCAAGCTGGTATCTGCAAGTCCCATGCACTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTGGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtggaca > 6:210605‑M2/1‑143 (MQ=255) aaGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAAc < 7:28246/148‑1 (MQ=255) aaGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAAc < 5:201431/148‑1 (MQ=255) aaGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAAc < 1:42974/148‑1 (MQ=255) aGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGGAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAAc > 5:281206/1‑147 (MQ=255) cACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCagt > 3:161681/1‑149 (MQ=255) cACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCag > 3:103209/1‑148 (MQ=255) gCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCagtagt > 5:53033/1‑149 (MQ=255) tGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTg > 3:152870/1‑149 (MQ=255) tATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCg > 8:273689/1‑149 (MQ=255) ccAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAg < 6:281206/149‑1 (MQ=255) aGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCag < 6:104880/132‑1 (MQ=255) aGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCag > 5:104880/1‑132 (MQ=255) ccTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGt < 3:153608/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGt > 3:112332/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGt < 2:220845/149‑1 (MQ=255) cccTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCa < 7:246028/148‑1 (MQ=255) ccTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCAtc > 4:212377/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtggacag < 3:157116‑M2/114‑8 (MQ=255) cTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtggacag > 4:157116‑M2/1‑107 (MQ=255) gAGCACGGCCAGCAAACCGTTTGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTcg < 1:5504/148‑1 (MQ=255) aGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTcgg < 1:164276/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAAc < 8:298819/109‑1 (MQ=255) ggCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAAc > 7:298819/1‑109 (MQ=255) ggCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGtt < 3:186298/117‑1 (MQ=255) ggCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGtt > 4:186298/1‑117 (MQ=255) ggCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCt > 8:25541/1‑149 (MQ=255) ggCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTtctc > 1:211676/1‑149 (MQ=255) cATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGa < 4:152870/149‑1 (MQ=255) gatgCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtggacagcatcatgcccaacggtttgctggccgtgctcaagggcaggggactggcagataccagcgtgcttg < 7:71285‑M2/149‑73 (MQ=255) atgCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGTATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGAttt < 5:209477/148‑1 (MQ=255) atgCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGTATAGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACACCACGGCACACTTGTTGGACAGGAACAAGTAGTTGCAGACATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGcc > 2:252535/1‑126 (MQ=255) atgCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGGGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGcc < 1:252535/126‑1 (MQ=255) atgCTGTCCAGGTCGATGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTACGCAGCAGCATCAACGACTCCACGGCACAGTTGTAGGACAGCAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCAGGCGCACAAGGATCAGGAtt > 2:288372/1‑147 (MQ=255) gTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtggacagcatcatgcccaacggtttgctggccgtgctcaagggcagg < 2:29554‑M2/118‑48 (MQ=255) gTCCAGGTCGTTGAGGCGGGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTtggacagcatcatgcccaaacggtttgctggccgtgctcaagggcagg > 1:29554‑M2/1‑71 (MQ=255) cAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGt > 4:305398/1‑149 (MQ=255) aGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGtt < 6:53033/149‑1 (MQ=255) gTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCTCCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGc < 1:243318/148‑1 (MQ=255) gTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCt > 4:137883/1‑149 (MQ=255) gCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGGTGAGCTTCAAgg > 8:301607/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCg > 1:178473/1‑145 (MQ=255) gCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCg < 2:178473/145‑1 (MQ=255) ggTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCa < 7:25541/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGAGCACCGAGGCCAgg < 7:273689/149‑1 (MQ=255) cGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTg > 1:123979/1‑149 (MQ=255) cGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTg > 3:168864/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTgc > 2:119136/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTgcg > 7:69152/1‑148 (MQ=255) cgcAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTgcgc < 4:161681/147‑1 (MQ=255) cgaatcagcTTAAACGACTCCAAGGCACATTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCATGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTgcgc < 4:103209/142‑1 (MQ=255) gcagcTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGCAACCAGAAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTAGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTgcgaaccacg > 1:210413/1‑142 (MQ=255) cTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCt < 3:305398/149‑1 (MQ=255) ttCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCtt > 7:280003/1‑149 (MQ=255) cAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTg < 2:211676/148‑1 (MQ=255) aaCGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGgt < 3:212377/149‑1 (MQ=255) aaCGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGgt > 4:207942/1‑149 (MQ=255) aCGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGgtg < 1:119136/149‑1 (MQ=255) cACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGGTGTATtcgt > 1:322625/1‑149 (MQ=255) cacaGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCCAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGGTGTATTCGTCGAt > 5:279494/1‑148 (MQ=255) caGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGGTGTATTCGTCGATCa > 1:125058/1‑148 (MQ=255) ttgttgGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGGTGTATTCGTCGATCACCTg > 4:92050/1‑149 (MQ=255) | GCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTTCAACGACTCCACGGCACAGTTGTTGGACAGGAACCAGTAGTTGCCGTCATAGCTCCAGTGCATCTCGGCGGCCTGGCGCACCAGGTTCTCGATTTCGTCGCGGTTGAGCTTCAAGGGCACCGAGGCCAGGCTGCGCAGCTCGGTCTTGGTGTATTCGTCGATCACCTG > NC_002947/159018‑159311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |