New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 291024 | 65 (1.290) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.3% | coding (85/594 nt) | ssuE | NAD(P)H‑dependent FMN reductase subunit |
? | NC_002947 | = 291076 | 44 (0.910) | coding (137/594 nt) | ssuE | NAD(P)H‑dependent FMN reductase subunit |
GGAAGCGCAGCAATGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGACCTGCTGCCCGAGC > NC_002947/290928‑291222 | ggAAGCGCAGCAATGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGa > 7:1125/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCAGCAATGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGGGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGAc > 1:226189‑M2/1‑148 (MQ=255) gAAGCGCAGCAATGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGAc < 4:196388‑M2/149‑2 (MQ=255) gAAGCGCAGCAATGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGAc > 6:35199‑M2/1‑148 (MQ=255) aaTGCTGGGCTTCTCAATCTGTTGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCTAGAGTTCGCGCCAGTGGCTTCAGGATCTCGGCGTTTAAGTTGTGACGTTCCAGGTGAGTGACTTTCCCTCCGAAGACCTGCTGCATg < 1:104804/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGc < 3:75286/149‑1 (MQ=255) gtcgtcTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGttt < 8:28931/149‑1 (MQ=255) tcgtcTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTc < 7:173181/149‑1 (MQ=255) gtcTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGa < 3:196388/149‑1 (MQ=255) gtcTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGa < 2:46964/149‑1 (MQ=255) aaTCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGTTCCTTCGCCCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACa < 1:264686/146‑1 (MQ=255) gtggtAGACCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCAGCTCCACCGTTCGCGCCAGTCGCTGAAGGATCGCGGCGTTGAAGTTGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCAGCTGCATGCACGTTTCGACAGCCCGCAt > 7:52501/1‑149 (MQ=255) tggtAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCAtg < 8:274719/149‑1 (MQ=255) ccAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAaca < 1:297431/149‑1 (MQ=255) gTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGAGTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGACCGTTTCGACAGCCCGAATGTGCAACACtt > 1:184531/1‑148 (MQ=255) gTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACttt > 7:96974/1‑149 (MQ=255) tcCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCaa > 4:176770/1‑149 (MQ=255) ccGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCaa > 1:51529/1‑148 (MQ=255) cGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCaa < 2:111377/147‑1 (MQ=255) cACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCt < 8:1125/148‑1 (MQ=255) aCGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCtgg > 5:89518/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCACGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCtggtg < 8:197690/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGGGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGc < 2:293137/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGc < 6:89518/149‑1 (MQ=255) tCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGc > 1:28013/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCtggtg > 8:218378/1‑132 (MQ=255) gAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCtggtg < 7:218378/132‑1 (MQ=255) gAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCt > 6:182591/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTc < 3:69274/119‑1 (MQ=255) gCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTc > 4:69274/1‑119 (MQ=255) gTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATc < 3:261030/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACAATTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGtct > 6:192044/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGAcctgcagccactggcgcgaacgctcgagcagcacgccggagcgtgaacggagacttgggctaccaccgattgagacgaccagca < 1:252719‑M2/149‑85 (MQ=255) gTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCAccc > 3:152311/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGgt < 5:182591/149‑1 (MQ=255) tGCAGGATTGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGAcctgcagccactggcgcgaacgctcgagcagcacgccggagcgtgaacggagacttgggctaccaccgattgagacgaccagcattgctgc < 4:36480‑M2/149‑92 (MQ=255) tGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGgtg > 5:134867/1‑149 (MQ=255) gATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACaa > 4:59909/1‑149 (MQ=255) gATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACATGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGCCCTGATCGTCTCCACCCCCGTGTAc > 7:119341/1‑147 (MQ=255) aTCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAg < 3:59909/149‑1 (MQ=255) tCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAgg > 5:118406/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGTGGTGACGGTCCAGGTTCGTTACTTTCCCGCCGAAGACCTTCTGCATGCCCGTTTCGACAGCGCGCATGTGCAAGACTTTCAACAGCTGGTGGCCCATGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCttt < 8:52501/149‑1 (MQ=255) gtgACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGAcctgcagccactggcgcgaacgctcgagcagcacgccggagcgtgaacggagacttgggctaccaccgattgagacgaccagcattgctgcgcttccttgtgttctgttggag > 3:36480‑M2/1‑35 (MQ=255) gtgACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCATCGTTTTCCGGTGc > 6:306749/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTg > 4:188782/1‑148 (MQ=255) cAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAAc < 6:134867/149‑1 (MQ=255) gCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACcttgc < 4:152311/149‑1 (MQ=255) aCTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGa < 2:28013/148‑1 (MQ=255) cTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGAcc > 8:212037/1‑149 (MQ=255) tttCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGACct > 5:160687/1‑149 (MQ=255) cgccgAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGACCtgctgc > 2:184908/1‑149 (MQ=255) gAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGATGGTGGCCCATGCTGATTGGCTGCTCGTCTACACCCCGGTGTTCAAGGCTTAGTTTTACGGTGCCCTGAAACCCATGCTTGAACTTCTTCCCGa > 1:89180/1‑149 (MQ=255) aaGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGACCTGCTGCCCGAg > 3:136891/1‑149 (MQ=255) aGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGACCTGCTGCCCGAgc < 2:51529/149‑1 (MQ=255) | GGAAGCGCAGCAATGCTGGTCGTCTCAATCGGTGGTAGCCCAAGTCTCCGTTCACGCTCCGGCGTGCTGCTCGAGCGTTCGCGCCAGTGGCTGCAGGATCGCGGCGTTGAAGTGGTGACGTTCCAGGTGCGTGACTTTCCCGCCGAAGACCTGCTGCATGCCCGTTTCGACAGCCCGCATGTGCAACACTTTCAACAGCTGGTGGCCCAGGCTGATGGCCTGATCGTCTCCACCCCGGTGTACAAGGCTTCGTTTTCCGGTGCCCTGAAAACCTTGCTTGACCTGCTGCCCGAGC > NC_002947/290928‑291222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |