| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 390955 | 41 (0.810) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.5% | coding (1229/3015 nt) | soxA | sarcosine oxidase subunit alpha |
| ? | NC_002947 | = 391024 | 48 (1.010) | coding (1298/3015 nt) | soxA | sarcosine oxidase subunit alpha | |||||
GAGGCCAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAGGCGGCGTCCGCGCA > NC_002947/390876‑391172 | gAGGCCAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCa < 6:46540/149‑1 (MQ=255) ccAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctg < 6:192500‑M2/149‑5 (MQ=255) ccAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctg > 5:207258‑M2/1‑145 (MQ=255) cAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgg > 4:42721‑M2/1‑144 (MQ=255) cAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgg < 6:177706‑M2/149‑6 (MQ=255) aCGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgg > 8:248724‑M2/1‑130 (MQ=255) aCGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGAGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGAACGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgg < 7:248724‑M2/135‑6 (MQ=255) cGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTAt < 4:147026/149‑1 (MQ=255) gTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATg < 6:155188/149‑1 (MQ=255) gTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATg > 5:155188/1‑149 (MQ=255) cACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑CCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGc < 5:197593/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGt < 6:170167/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGt < 6:78780/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGt > 6:326976/1‑148 (MQ=255) ggCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTga < 5:192500/149‑1 (MQ=255) gcggcgATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTgg < 7:124211/149‑1 (MQ=255) gatcgatGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcct < 5:10881‑M2/108‑4 (MQ=255) gatcgatGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcct > 6:10881‑M2/1‑105 (MQ=255) gatcgatGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCg < 5:177706/149‑1 (MQ=255) atcgatGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGt < 1:230178/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGc > 5:268513/1‑148 (MQ=255) gcACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATgcgc < 6:48136/149‑1 (MQ=255) aaaGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGcgccg > 2:20041/1‑147 (MQ=255) ccAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgggctggtgactttgtgcgcctgcacatcgatcgccgccacacgggcgccggtgacgtgcttgctgc < 7:27324‑M2/149‑71 (MQ=255) cAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGt > 6:148058/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgggctggtgactttgtgcgcctgcacatcgatcgccgccacacgggcgccggtgacgtgcttgctgcctt < 5:173094‑M2/149‑74 (MQ=255) cAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGTGGCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTg > 1:88326/1‑149 (MQ=255) aGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCg < 6:268513/149‑1 (MQ=255) gAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCgg > 2:279250/1‑149 (MQ=255) tCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAc < 3:117537‑M2/65‑2 (MQ=255) tCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAc > 4:117537‑M2/1‑64 (MQ=255) cTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTAt > 3:86505/1‑149 (MQ=255) cTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTAt > 1:273552/1‑149 (MQ=255) ttGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGt > 2:105014/1‑106 (MQ=255) ttGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGt < 1:105014/106‑1 (MQ=255) cGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGc < 2:88326/148‑1 (MQ=255) aCCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGAt < 8:92775/107‑1 (MQ=255) aCCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGAt > 7:92775/1‑107 (MQ=255) cTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGc > 7:293312/1‑118 (MQ=255) cTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGc < 8:293312/118‑1 (MQ=255) tGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTAt > 4:185945/1‑149 (MQ=255) cctcctCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACg < 1:24035/135‑1 (MQ=255) cctcctCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACg > 2:24035/1‑135 (MQ=255) ctcctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTgg < 7:256666/149‑1 (MQ=255) ctcctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTgg > 6:6084/1‑149 (MQ=255) tcctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTggg > 8:177946/1‑149 (MQ=255) tcctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTgg > 4:200423/1‑148 (MQ=255) gatcGGGCTGTAACCGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGc > 2:209947/3‑149 (MQ=255) ctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTggg < 1:20041/147‑1 (MQ=255) ctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTgg < 3:200423/146‑1 (MQ=255) ctcGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGc > 6:300050/1‑148 (MQ=255) gggCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGAt < 2:273552/148‑1 (MQ=255) gggCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGAt < 3:185945/148‑1 (MQ=255) ggTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCAcctgggctggtgactttgtgcgcctgcacatcgatcgccgccacacgggcgccggtgacgtgcttgctgcctttggcctcgatcacggcgctggaggtgagtatgcgaatgcctttg > 8:27324‑M2/1‑32 (MQ=255) ttACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTg < 5:6084/149‑1 (MQ=255) cAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGcc > 8:229085/1‑148 (MQ=255) aGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGa > 7:91989/1‑149 (MQ=255) cccGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATg > 8:155879/1‑149 (MQ=255) cACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAgg < 1:279250/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCgt < 3:101730/109‑1 (MQ=255) aCCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCgt > 4:101730/1‑109 (MQ=255) ccTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAggcg > 2:116267/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGTGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAGGCGGCGTCcgcg > 3:295521/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAggc > 2:156622/1‑139 (MQ=255) gCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAggc < 1:156622/139‑1 (MQ=255) aCCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAGGCGGCGTCCGCGCa < 5:148058/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAGGCGGCGTCCGCGCa < 3:309406/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAGGCGGCGTCCGCGCa < 1:116267/149‑1 (MQ=255) | GAGGCCAAAGGCAGCAAGCACGTCACCGGCGCCCGTGTGGCGGCGATCGATGTGCAGGCGCACAAAGTCACCAGCCCAGGCGAAGTCCTTGAGTGCGACCTGATCGCCTCCTCGGGCGGTTACAGCCCGATCGT‑GCACCTGGCTTCGCACCTGGGCGGTCGCCCGGTATGGCGTGACGACATCCTTGGCTTCGTGCCGGGCGATGCGCCGCAGAAGCGTGAGTGCGTCGGTGGTATCAACGGCGTGTATGCCTTGGGCGATGTCATTGCCGATGGCTTCGAAGGCGGCGTCCGCGCA > NC_002947/390876‑391172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |