| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1465754 | 67 (1.330) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 6.6% | coding (1437/1560 nt) | algG | poly(beta‑D‑mannuronate) C5 epimerase |
| ? | NC_002947 | = 1465798 | 49 (1.030) | coding (1393/1560 nt) | algG | poly(beta‑D‑mannuronate) C5 epimerase | |||||
CGACCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGAC > NC_002947/1465657‑1465945 | cGACCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGAcagcgg > 8:278974‑M2/1‑142 (MQ=255) gACCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGAcagcggc > 3:112822‑M2/1‑141 (MQ=255) aCCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGa < 7:84345/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGTACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAg > 5:194633/1‑149 (MQ=255) ccGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAg > 8:26433/1‑149 (MQ=255) gggTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtc > 3:304300/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcga > 6:168960/1‑149 (MQ=255) gATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgatc < 2:202694/148‑1 (MQ=255) gATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTACTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtagatc > 4:50379/1‑148 (MQ=255) cAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgatcga > 5:268701/1‑147 (MQ=255) cAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgatcga > 5:264136/1‑147 (MQ=255) caGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATTGACAGCggg < 6:194633/149‑1 (MQ=255) ccTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCg < 5:178437/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGc > 5:163698/1‑149 (MQ=255) tgctgGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGcc > 4:219739/1‑149 (MQ=255) ctgGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCg < 5:55521/137‑1 (MQ=255) ctgGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCg > 6:55521/1‑137 (MQ=255) ctgGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGc < 3:217549/146‑1 (MQ=255) gCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGtt < 2:254039/147‑1 (MQ=255) gCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGtt < 2:41270/147‑1 (MQ=255) cGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGc < 2:36701/149‑1 (MQ=255) gcagGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTcgaccga < 3:221362/103‑1 (MQ=255) gcagGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTcgaccga > 4:221362/1‑103 (MQ=255) agGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTc < 8:300119/149‑1 (MQ=255) cGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGcca < 6:264136/149‑1 (MQ=255) gAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGcca < 6:268701/148‑1 (MQ=255) aGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACa > 8:4186/1‑139 (MQ=255) aGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACa < 7:4186/139‑1 (MQ=255) cGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCcaccac < 6:163698/148‑1 (MQ=255) gTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgat < 4:257835/102‑1 (MQ=255) gTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGtcgat > 3:257835/1‑102 (MQ=255) tCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGAt < 3:219739/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGAt > 7:79745/1‑147 (MQ=255) cTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGaca < 7:26433/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCt > 7:172973/1‑149 (MQ=255) ccAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTg > 4:20304/1‑149 (MQ=255) cacaCCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCAAGgtgt > 1:65088/1‑149 (MQ=255) acCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCAAGGTGTCgc < 2:65088/149‑2 (MQ=255) gCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTc > 1:103129/1‑147 (MQ=255) tGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACccacca > 5:187528/1‑114 (MQ=255) tGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACccacca < 6:187528/114‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTg > 4:56869/1‑91 (MQ=255) gATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTg < 3:56869/91‑1 (MQ=255) aTGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGAcagcggcatcagcctcaatggtgtgctgggcgagcgccaggacgaaatcctcgacctgctggtacgccagcagaaggctgtgctgatcgacccggt < 4:265909‑M2/149‑97 (MQ=255) gCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCg < 8:172973/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGAcagcggcatcagcctcaatggtgtgctgggcgagcgccaggacgaaatcctcgacctgctggtacgccagcagaaggctgtgctgatcgccccggtc < 2:153801‑M2/147‑98 (MQ=255) ccGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGCCACCAAGGTGTCgctg > 5:213176/1‑132 (MQ=255) ccGCGGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGAcagcggcatcagcctcaatggtgtgctgggcgagcgccaggacgaaatcctcgacctgctggtacgccagcagaaggctgtgctgatcgccccggtc > 1:153801‑M2/1‑50 (MQ=255) cGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACGTTGTACAGCTCGACCGACTGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATg < 3:50379/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATc < 2:36827/103‑1 (MQ=255) gcgcGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATc > 1:36827/1‑103 (MQ=255) aGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGGGGTCGGTGTCGGACAg > 7:236531/1‑149 (MQ=255) aGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAg < 5:73623/149‑1 (MQ=255) cATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGt < 5:168960/149‑1 (MQ=255) gACACCTTGTACAGCTCGACCGAcagcggcatcagcctcaatggtgtgctgggcgagcgccaggacgaaatcctcgacctgctggtacgccagcagaaggctgtgctgatcgacccggtcgaacgccagaccgaaatgatcgattaag > 3:265909‑M2/1‑23 (MQ=255) gACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCtt < 7:127830/148‑1 (MQ=255) gACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCAGACAGGTCttt < 3:20304/149‑1 (MQ=255) acacCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCttt > 8:257900/1‑148 (MQ=255) acCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACAcc < 7:172118/93‑1 (MQ=255) acCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACAcc > 8:172118/1‑93 (MQ=255) gCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGta > 8:245192/1‑148 (MQ=255) gacAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGAc < 7:245192/149‑1 (MQ=255) | CGACCGGGTCGATCAGCACAGCCTTCTGCTGGCGTACCAGCAGGTCGAGGATTTCGTCCTGGCGCTCGCCCAGCACACCATTGAGGCTGATGCCGCTGGCCTTGCGCGGGGCGAGCATGGACACCTTGTACAGCTCGACCGACAGCGGCGAGTCGATCGACAGCGGGCCGGAGCCGTTGGCCGACAGCTCGCCACCCACCACGATCAGCGACACCTTGGTGTCGAACGGGTCGAGGGCGATGTCGCGGTCGGTGTCGGACAGGTCTTTGATGTGGCCGTATACGCCGAC > NC_002947/1465657‑1465945 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |