New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1558468 = | 53 (1.050) | 5 (0.110) | 5/242 | NT | 10.0% | coding (433/732 nt) | PP_1369 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1558538 = | 40 (0.850) | coding (363/732 nt) | PP_1369 | hypothetical protein |
TCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGAAGTAGTCGACGGGGCTGCGCGGTACGGGGCCTTCGTC > NC_002947/1558390‑1558684 | ttctacagccttgatgagaacgaagcgcttacccggctacaggagggcctggcactgttcgaggaccaagggtggcctGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCcaca > 5:275398‑M1/79‑149 (MQ=255) ctacagccttgatgagaacgaagcgcttacccggctacaggagggcctggcactgttcgaggaccaagggtggcctGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAg > 8:59172‑M1/77‑148 (MQ=255) cAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCAcc < 6:199216/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTg < 7:304998/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTg < 5:108490/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTg < 3:93711/149‑1 (MQ=255) cgcATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCt < 4:17115/149‑1 (MQ=255) cAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGaa > 6:148542/1‑148 (MQ=255) aaTCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGGTTACTGGTGTATTTCTGTGGCCGGCGGCACAGCGGTTGCCGCGTGCCCGGGATCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAAc < 1:88403/148‑1 (MQ=255) aTCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAg > 2:42878/1‑149 (MQ=255) tCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGt > 4:272019/1‑149 (MQ=255) tAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGAAGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAgg > 6:98755/1‑149 (MQ=255) tCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCcctc < 1:42878/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAg < 4:58276/149‑1 (MQ=255) aGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTacc > 5:5352/1‑147 (MQ=255) gCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGcc < 5:148542/149‑1 (MQ=255) tACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTc < 1:273351/116‑1 (MQ=255) tACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTc > 2:273351/1‑116 (MQ=255) aGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAg > 8:266171/1‑149 (MQ=255) cTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCt > 8:91099/1‑148 (MQ=255) aGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTg < 8:68651/116‑1 (MQ=255) aGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTg > 7:68651/1‑116 (MQ=255) gtgtACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTtc > 8:45173/1‑149 (MQ=255) gtACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTtct > 2:248832/1‑148 (MQ=255) tACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTtctc < 4:280105/148‑1 (MQ=255) tACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTtctc < 3:272019/148‑1 (MQ=255) cTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCtcat < 1:323651/148‑1 (MQ=255) tttCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAg < 5:60150/105‑1 (MQ=255) tttCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAg > 6:60150/1‑105 (MQ=255) ctgtggcagggtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccacAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAg > 8:59172‑M2/73‑148 (MQ=255) tgtggcagggtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccacAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGaa > 5:275398‑M2/72‑149 (MQ=255) gtggcagggtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccacAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTtctc > 7:299300‑M2/71‑133 (MQ=255) gtggcagggtttgtcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccacAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTtctc < 8:299300‑M2/63‑1 (MQ=255) GCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTc > 7:91099‑M1/1‑148 (MQ=255) CAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGc > 5:98755‑M1/1‑149 (MQ=255) ggcACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCa > 2:307406/1‑149 (MQ=255) acaGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATgg < 7:266171/149‑1 (MQ=255) tcgcaccggcctggctcatgagccagggcacgcggcaagcgctgtgccgcctgccacAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATgg < 6:275398‑M2/91‑1 (MQ=255) cgcTTGCCGCGTGCCCTGGCTCACGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGta > 6:187476/1‑148 (MQ=255) gcgTGCCCTGGCTCATGAGCAAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTAATGTAGCCGCGTAAGAGCTTCGTACTCATCAAGCCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATgagc > 4:128457/1‑149 (MQ=255) tGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGcgccgc < 1:307406/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGTTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCa > 8:124868/1‑149 (MQ=255) cTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGa < 7:45173/149‑1 (MQ=255) cTGGCTCATGAGCAAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATg > 4:78795/1‑148 (MQ=255) tGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATg > 5:142404/1‑147 (MQ=255) gCTCACGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGaa < 5:187476/147‑1 (MQ=255) cATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGAagtagt > 5:28817/1‑149 (MQ=255) aggcAGGCCGGTGCGACAATCCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTGCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGGCGCATGAAGTAGTCGa < 6:5352/145‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGAAGTAGTCGACg > 6:283026/1‑149 (MQ=255) aaaCCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGAAGTAGTCGACGGGGCTGCGCGGTACgg < 7:124868/149‑1 (MQ=255) acAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGAAGTAGTCGACGGGGCTGCGCGGTACGGGGCCTTCGTc < 1:248832‑M2/147‑1 (MQ=255) | TCCAGACCAGGCCTGGCGCATCAATCGCCGTAAAGTCTGGCAAGCGGTACAGATGCTGAGGTGTACTGGTGTATTTCAGTGGCAGGCGGCACAGCGCTTGCCGCGTGCCCTGGCTCATGAGCCAGGCCGGTGCGACAAACCCTGCCACAGGCCACCCTTGGTCCTCGAACAGTGCCAGGCCCTCCTGTAGCCGGGTAAGCGCTTCGTTCTCATCAAGGCTGTAGAACTCGCCTTCATGGGTATAAATGCGCCGCATGAAGTAGTCGACGGGGCTGCGCGGTACGGGGCCTTCGTC > NC_002947/1558390‑1558684 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |