New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1907210 = | 42 (0.830) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.7% | coding (529/951 nt) | PP_1707 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | 1907243 = | 43 (0.890) | coding (496/951 nt) | PP_1707 | D‑isomer specific 2‑hydroxyacid dehydrogenase family protein |
GCGCCTCGCCCTTGTCAGCCGCCGCTGCGAGGATCAGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCG > NC_002947/1907096‑1907376 | gcgcCTCGCCCTTGTCAGCCGCCGCTGCGAGGATCAGCTCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTACGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCtgt < 6:25062/149‑1 (MQ=255) ccggccgttgggccaccagcaccacgccgctggcaccgctgccactggcccggcaggtgtcgggcatgcgcgtgggcatcgtcggcatgggccgggtcgggcgggcggtagcacAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCtgt > 5:248858‑M1/115‑149 (MQ=255) tCGCCCTTGTCAGCCGCCGCTGCGAGGATCAGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTAc > 2:228290/1‑149 (MQ=255) ccgcTGCGAGGATCAGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCgg < 2:215854/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCcga > 4:151859/1‑149 (MQ=255) tCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCCCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCAc < 1:228290/149‑1 (MQ=255) cGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGAcc > 4:199794/1‑125 (MQ=255) cGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGAcc < 3:199794/125‑1 (MQ=255) cGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCAcg > 7:162039/1‑149 (MQ=255) ggCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGAGCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGcc < 7:210245/147‑1 (MQ=255) agcagATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCg > 4:313846/1‑149 (MQ=255) cagATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCggg > 4:185014/1‑149 (MQ=255) cTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGt > 8:11610/1‑149 (MQ=255) tGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTg > 8:243549/1‑149 (MQ=255) tGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTg > 3:209129/1‑149 (MQ=255) ccTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGt < 8:162039/146‑1 (MQ=255) aaCCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAACTGGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCg > 1:84621/1‑149 (MQ=255) ccGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGc > 5:158184/1‑149 (MQ=255) gTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGt < 2:93745/136‑1 (MQ=255) gTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGt > 1:93745/1‑136 (MQ=255) ggCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAgcgg > 4:211278/1‑149 (MQ=255) caTCCAGTGCCTGTAGATCGGTGAAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtg < 5:79448/149‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtgg > 6:4647/1‑149 (MQ=255) ccTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCtggt < 5:4647/148‑1 (MQ=255) ccTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCCGCCCATGCCGACGATGCCCCCGCGCATGCCCGCCCCCAGCCGGGCCCGTGGCAGCGGTGCCCGCGGGGTGGTGCtggtg > 1:292495/1‑149 (MQ=255) cTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCtggtgg < 3:185014/149‑1 (MQ=255) tAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGcc > 2:274291/1‑148 (MQ=255) aTCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAAc > 5:57945/1‑149 (MQ=255) cGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCa < 5:238099/114‑1 (MQ=255) cGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCa > 6:238099/1‑114 (MQ=255) ggTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACCCCAGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAAcggc > 2:279537/1‑149 (MQ=255) tgtAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtg < 5:105497/128‑1 (MQ=255) tgtAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgtg > 6:105497/1‑128 (MQ=255) acagcgggcggcagccttcggttgcccgatccgctGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAAcggccgg > 5:248858‑M2/36‑149 (MQ=255) CGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGcgcg > 2:84621‑M1/1‑149 (MQ=255) cgggcggcagccttcggttgcccgatccgctGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgt < 2:124473‑M2/91‑1 (MQ=255) cgggcggcagccttcggttgcccgatccgctGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCgt > 1:124473‑M2/32‑122 (MQ=255) aTCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCAAGCCGACGATGCCCACACGGATGCCCCACACCAGCCGGGCCAGAGGCAGCCGTGCCACCGGCCTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGcgaac > 2:278768/1‑149 (MQ=255) ggCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAg < 1:274291/149‑1 (MQ=255) cAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCg > 6:26869/1‑149 (MQ=255) aC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGt < 6:108539/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGCCGATGCCCACGCGCCTGCCCGCCACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGGGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGCAGCGGTCa > 5:30367/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCAc < 7:243549/149‑1 (MQ=255) gAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCAc < 3:313846/149‑1 (MQ=255) gAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCAc < 3:151859/149‑1 (MQ=255) aaGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCTCGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTg < 1:28498/88‑1 (MQ=255) aaGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTg > 2:28498/1‑88 (MQ=255) aGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCg < 7:11610/149‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCg < 5:26869/149‑1 (MQ=255) | GCGCCTCGCCCTTGTCAGCCGCCGCTGCGAGGATCAGCGCATCGCTGTCCTTGGCCAACTGCAGCAGATCTGCCTCGAACCCGTAGGGCACATCCAGTGCCTGTAGATCGGTGTAGCGGATCGGGCAAC‑CGAAGGCTGCCGCCCGCTGTGCTACCGCCCGCCCGACCCGGCCCATGCCGACGATGCCCACGCGCATGCCCGACACCTGCCGGGCCAGTGGCAGCGGTGCCAGCGGCGTGGTGCTGGTGGCCCAACGGCCGGCGCGAACGAAGCGGTCACCG > NC_002947/1907096‑1907376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |