New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2112063 | 49 (0.970) | 5 (0.100) | 5/246 | NT | 9.7% | coding (2223/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 2112086 | 46 (0.960) | coding (2200/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
CGGACGTTCATGCCGTTGCGGTTCTGCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGATTTCGTAG > NC_002947/2111938‑2112222 | cGGACGTTCATGCCGTTGCGGTTCTGCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGACCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGATGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGt > 8:232148/1‑149 (MQ=255) gACGGTCATGCCGTTGCGGTTCTGCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGCGCCGA‑‑TGGTgc > 6:300346‑M2/1‑147 (MQ=255) tGCCGTTGCGGTTCACCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCATCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGCTGATCGGCGTTGCCGATCGGCTCCAGTACGTAGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGc > 4:160367/1‑149 (MQ=255) cGGTTCTGCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCACCA‑‑TCGGCCCGGACGACGTGGAgcagcacaacgtactgga > 4:265776‑M2/1‑131 (MQ=255) ggTTCAGCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAg > 7:291302/1‑149 (MQ=255) gCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑tcgtcg > 6:310405/1‑149 (MQ=255) gggATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGttttt > 3:238529/1‑149 (MQ=255) ggATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGcc < 4:287116/126‑1 (MQ=255) ggATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGcc > 3:287116/1‑126 (MQ=255) cAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTAcc < 5:310405/148‑1 (MQ=255) aGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAg > 2:71993/1‑149 (MQ=255) gTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAgg < 4:238529/149‑1 (MQ=255) ccGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTa < 2:65451/125‑1 (MQ=255) ccGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTa > 1:65451/1‑125 (MQ=255) ccGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAg > 8:24857/1‑149 (MQ=255) tcGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTActgct > 4:187717/1‑149 (MQ=255) cTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAGCTCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCtt < 1:71993/149‑1 (MQ=255) cTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑tcgtcg < 8:302814/108‑1 (MQ=255) cTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑tcgtcg > 7:302814/1‑108 (MQ=255) tGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTg > 8:213247/1‑148 (MQ=255) tAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGc < 7:213247/147‑1 (MQ=255) gCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGc < 8:86863/148‑1 (MQ=255) gCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGc > 7:86863/1‑148 (MQ=255) cGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGc > 7:304254/1‑147 (MQ=255) aaTGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGt < 7:232148/149‑1 (MQ=255) gcCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCg > 8:208636/1‑145 (MQ=255) gcCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCg < 7:208636/145‑1 (MQ=255) cccgATCGGCAACGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGc < 1:299194/128‑1 (MQ=255) cccgATCGGCAACGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGc > 2:299194/4‑131 (MQ=255) gTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAg > 5:58325/1‑82 (MQ=255) gTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAg < 6:58325/82‑1 (MQ=255) tGATCGGGGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACGGCGTTTTTGTTACGAGGTGCAGGTACTGCCGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCtctc < 2:155575/149‑1 (MQ=255) gATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTcc > 6:259586/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACATCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTg > 5:178262/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTAt > 5:131112/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATcc < 8:291302/149‑1 (MQ=255) gCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGt > 5:75203/1‑149 (MQ=255) cGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTg < 2:133772/149‑1 (MQ=255) agcGGGTCCAGTAGGTTGTGGTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTTGCCCCAT‑TGTTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTTGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGcc < 7:210727/147‑1 (MQ=255) tCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCg > 7:277971/1‑149 (MQ=255) gTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACg > 7:18501/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTgcagcacaacgtactggacccgatcggcaacgccgatcaccagggcgccattcgctacagctggcgagaaggcgggagactgaaatcccgaccccaggtgcagaaccgcaacggca < 1:179656‑M2/149‑117 (MQ=255) gTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACt < 2:7456/149‑1 (MQ=255) ttGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTgcagcacaacgtactggacccgatcggcaacgccgatcaccagggcgccattcgctacagctggcgagaaggcgggagactgaaatcccgaccccaggt > 3:134292‑M2/1‑32 (MQ=255) ttGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTgcagcacaacgtactggacccgatcggcaacgccgatcaccagggcgccattcgctacagctggcgagaaggcgggagactgaaatcccgaccccaggt < 4:134292‑M2/131‑100 (MQ=255) gctgctCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACAGAGTTTTTGTTACAAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATg > 3:170968/1‑149 (MQ=255) ctgctCCACATCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATg < 6:178262/148‑1 (MQ=255) ctCGACGTCGTACGGGCCGA‑‑TTGTGCAGCTTTGCTCGCCCGAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGTTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCa < 3:160367/149‑1 (MQ=255) tCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAg > 4:130203/1‑149 (MQ=255) cACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTgcagcacaacgtactggacccgatcggcaacgccgatcaccagggcgccattcgctacagctggcgagaaggcgggagactgaaatcccgaccccaggtgcagaaccgcaacggcatgaacgtccga > 3:265776‑M2/1‑21 (MQ=255) cgtcgtCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGAtt < 6:131112/149‑1 (MQ=255) gtcgtcCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACAGGATGGCCAGGAttt > 3:54999/1‑149 (MQ=255) gtcCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGATTTCg > 5:199562/1‑148 (MQ=255) gtcCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGATTTCGt < 8:18501/149‑1 (MQ=255) a‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTTTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGATTTCGTAg < 5:168029/141‑1 (MQ=255) a‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGATTTCGTAg > 6:168029/1‑141 (MQ=255) | CGGACGTTCATGCCGTTGCGGTTCTGCACCTGGGGTCGGGATTTCAGTCTCCCGCCTTCTCGCCAGCTGTAGCGAATGGCGCCCTGGTGATCGGCGTTGCCGATCGGGTCCAGTACGTTGTGCTGCTCCACGTCGTCCGGGCCGA‑‑TGGTGCAGCATTGCTCGCCCCAG‑TCGTCGTACCGCGTTTTTGTTACCAGGTGCAGGTACTGCTGGGCTTGCAGCCAGTCGGTAACGCTCTCCTGTATCCGGTTGCCGTACGCATCGTACTGGATGGCCAGGATTTCGTAG > NC_002947/2111938‑2112222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |