| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3568272 | 44 (0.870) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.3% | coding (829/1998 nt) | PP_3150 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 3568302 | 48 (1.010) | coding (859/1998 nt) | PP_3150 | hypothetical protein | |||||
CGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTGGGCCGGGCCTGGCACCT > NC_002947/3568156‑3568449 | cgcgGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtg > 7:173664‑M2/1‑147 (MQ=255) cgGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggt > 7:136795‑M2/1‑145 (MQ=255) aaGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcagct < 5:249856‑M2/149‑11 (MQ=255) aaGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctg > 4:53064/1‑149 (MQ=255) aaGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctg < 7:291956/149‑1 (MQ=255) aGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCgctgg < 5:32392/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGt < 8:66055/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGt < 8:269116/149‑1 (MQ=255) ccgccTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAACCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATc < 3:177753/149‑1 (MQ=255) ataCCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGa > 3:45619/1‑148 (MQ=255) taCCTCTCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGa < 1:243022/147‑1 (MQ=255) taCCGCGCTGACCTTCGGCCACCTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGGGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGat < 2:76998/148‑1 (MQ=255) cgcTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCTCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGatat < 7:204476/145‑1 (MQ=255) cgcTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGatat > 8:204476/1‑145 (MQ=255) cTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGc > 2:294531/1‑142 (MQ=255) cTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGc < 1:294531/142‑1 (MQ=255) tGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGAt > 1:303683/1‑149 (MQ=255) gCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGAtgt > 7:181989/1‑149 (MQ=255) aCGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTgg < 1:307999/147‑1 (MQ=255) tCAACCGTGACCTCACCTGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTTCCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGAtgtg < 7:122880/137‑1 (MQ=255) tCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGAtgtg > 8:122880/1‑137 (MQ=255) ccGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtgt > 2:305439/1‑143 (MQ=255) ccGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTtgt < 1:305439/143‑1 (MQ=255) cGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCcg > 6:36680/1‑149 (MQ=255) cGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCcg > 6:127473/1‑149 (MQ=255) gTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCcgc < 5:36680/149‑1 (MQ=255) gTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCcgc < 5:127473/149‑1 (MQ=255) aCCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGcc > 8:61510/1‑149 (MQ=255) cAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCAGCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGGGATGTGGTTGCCTTGGTTATCCGCGCCGTgcgcc > 8:232861/1‑148 (MQ=255) ggCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTg < 7:280202/149‑1 (MQ=255) tGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTTTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCca > 1:198517/1‑149 (MQ=255) tGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCt < 1:127143/145‑1 (MQ=255) gCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCcaca < 8:181989/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGc < 7:61510/149‑1 (MQ=255) cgcgATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCg > 4:8377/1‑148 (MQ=255) gcgATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGa > 5:34336/1‑148 (MQ=255) aTCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATAcc < 8:39422/149‑1 (MQ=255) tCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaag > 2:207567‑M2/1‑44 (MQ=255) tCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaag < 1:207567‑M2/124‑81 (MQ=255) cGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAg > 1:315942/1‑149 (MQ=255) tACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGtggtgcggtacggatcgcgcaatcgccagccgttgctggtgaggtcacggttgagcagctcgtcagccagttggccgaaggtcagcgcggtataggcggcagcgtcctt < 6:102245‑M2/149‑110 (MQ=255) tACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCt < 4:45619/149‑1 (MQ=255) ccGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTc < 3:8377/149‑1 (MQ=255) cACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGc > 3:212205/1‑132 (MQ=255) cACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGc < 4:212205/132‑1 (MQ=255) aCCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCt < 1:17093/149‑1 (MQ=255) aCCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCt > 2:17093/1‑149 (MQ=255) aGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGcac < 2:303683/149‑1 (MQ=255) gTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACt > 6:137786/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACtt > 2:321070/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGc > 6:166074/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGcc > 2:140409/1‑149 (MQ=255) cccAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTgggcc > 5:127662/1‑149 (MQ=255) aGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTgggccggg < 3:53064/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTgggccgggcc > 4:78611/1‑149 (MQ=255) aaGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTGGGCCGGGCCt > 7:167643/1‑149 (MQ=255) cgcAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTGGGCCGGGCCTGGc < 7:232861/149‑1 (MQ=255) aaGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTGGGCCGGGCCTGGCAcc > 4:77114/1‑149 (MQ=255) aGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTGGGCCGGGCCTGGCACCt > 5:204535/1‑149 (MQ=255) | CGCGGGTCAAGGACGCTGCCGCCTATACCGCGCTGACCTTCGGCCAACTGGCTGACGAGCTGCTCAACCGTGACCTCACCAGCAACGGCTGGCGATTGCGCGATCCGTACCGCACCAAGCTGTCCTGGCGCCCCCAGGAAGCGCAAGTGGTGCGCTGGCTGTCCATCCCAGATATCGGCCCGCTCGCAGCGCGTGATGTGGTTGCCTTGTGTATCCGCGCCGTGCGCACGTTCTGCCACAGTGCCGATACCCAGCTTCAGCTGCACCACTTGCCCTGGGCCGGGCCTGGCACCT > NC_002947/3568156‑3568449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |