New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3577425 = | 20 (0.400) | 3 (0.070) | 3/230 | NT | 11.4% | intergenic (+19/‑161) | PP_3157/PP_3158 | inositol monophosphatase family protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3577480 = | 29 (0.650) | intergenic (+74/‑106) | PP_3157/PP_3158 | inositol monophosphatase family protein/hypothetical protein |
GGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGC > NC_002947/3577335‑3577624 | gggTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCca > 6:268213/1‑149 (MQ=255) tggtggCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGtt‑t < 1:52048/149‑1 (MQ=255) aCCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCTAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGc < 1:298892/136‑1 (MQ=255) aCCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGc > 2:298892/1‑136 (MQ=255) ccTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCAc > 6:49849/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTACTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTcc > 1:102877/1‑149 (MQ=255) gaggtggcgcCAGGCAATTGGACCGGGGTTCTTCGCGCGTGGCCTCTGCGCGGGCCAGTCCCTGCTTGGGCGCGCGGGTTACCCGCTAACTGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGctct < 8:115239/143‑1 (MQ=255) gccacgccaTGTGATGCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTgg > 7:77457/1‑149 (MQ=255) gccaTGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGc > 7:2656/1‑95 (MQ=255) gccaTGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGc < 8:2656/95‑1 (MQ=255) aTGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCcg > 2:9566/1‑149 (MQ=255) gATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCgcgc < 5:268213/148‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTg > 3:253821/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa > 3:285748/1‑148 (MQ=255) cGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACt > 8:20863/1‑149 (MQ=255) gggTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTc > 1:121488/1‑149 (MQ=255) ttcGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa > 2:22737/1‑140 (MQ=255) ttcGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa < 1:22737/140‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAgccgcc > 8:222585/1‑149 (MQ=255) GGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAgccgcc < 7:109277‑M1/148‑1 (MQ=255) tcttcgcgggtaacccgctcccacaagaagggactcgcccgcgaagaggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa > 8:139584‑M2/52‑127 (MQ=255) tcttcgcgggtaacccgctcccacaagaagggactcgcccgcgaagaggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa < 7:139584‑M2/76‑1 (MQ=255) cttcgcgggtaacccgctcccacaagaagggactcgcccgcgaagaggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAatat > 1:142879‑M2/51‑149 (MQ=255) CGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATc > 2:102877‑M1/1‑147 (MQ=255) CGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCt > 8:277154‑M1/1‑119 (MQ=255) CGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCt < 7:277154‑M1/119‑1 (MQ=255) gAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTg > 4:296127/1‑149 (MQ=255) gAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTg < 4:253821/149‑1 (MQ=255) tCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGcc > 6:320098/1‑148 (MQ=255) ccTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATc > 6:252948/1‑135 (MQ=255) ccTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATc < 5:252948/135‑1 (MQ=255) tcttGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTGTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa > 1:62235/1‑109 (MQ=255) tcttGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa < 2:62235/108‑1 (MQ=255) aGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTa < 8:109277/149‑1 (MQ=255) gCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa > 6:132105/1‑98 (MQ=255) gCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGa < 5:132105/98‑1 (MQ=255) gggTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTAcgc < 3:296127/149‑1 (MQ=255) ggTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTAcgc > 2:856/1‑148 (MQ=255) ccgcgaagaggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTtc > 5:251390‑M2/14‑149 (MQ=255) gaggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTccccc > 3:24725‑M2/7‑149 (MQ=255) ggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGc > 6:289547‑M2/5‑149 (MQ=255) ggccGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGc < 1:9566‑M2/145‑1 (MQ=255) | GGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTT‑TGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGC > NC_002947/3577335‑3577624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |