New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3849459 = | 51 (1.010) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 6.2% | coding (1224/2268 nt) | PP_3397 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3849493 = | 42 (0.860) | coding (1258/2268 nt) | PP_3397 | hypothetical protein |
TCTCGAGCAAACTCAGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTCGAGGCCGCCAACCAGCCACCGCT > NC_002947/3849353‑3849641 | cgatcaccggctccacatcactaccgccatgggcagacttgaccgtaacggtagcgggcggttgagccaaatcgttgaccgtgatgctttgcagcgtgcccgatttCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGc > 6:328328‑M1/107‑149 (MQ=255) ccggctccacatcactaccgccatgggcagacttgaccgtaacggtagcgggcggttgagccaaatcgttgaccgtgatgctttgcagcgtgcccgatttCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGaaa > 8:29094‑M1/101‑137 (MQ=255) ccggctccacatcactaccgccatgggcagacttgaccgtaacggtagcgggcggttgagccaaatcgttgaccgtgatgctttgcagcgtgcccgatttCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGaaa < 7:29094‑M1/37‑1 (MQ=255) aCTCAGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGc > 8:120073/1‑146 (MQ=255) aCTCAGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGc < 7:120073/146‑1 (MQ=255) aGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCaaa < 1:138123/145‑1 (MQ=255) aGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCaaa > 2:138123/1‑145 (MQ=255) aGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCAt > 1:134566/1‑149 (MQ=255) gTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCaa > 1:73139/1‑149 (MQ=255) gTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCACAAGGCTACGGCAGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCa > 4:18739/1‑148 (MQ=255) tCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAAc > 7:4172/1‑149 (MQ=255) gTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGAttt < 6:168973/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTg > 4:304200/1‑149 (MQ=255) cGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAAccgcc < 3:304200/149‑1 (MQ=255) gCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTgg > 4:213708/1‑138 (MQ=255) gCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTgg < 3:213708/138‑1 (MQ=255) cTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAAccgcccg < 8:4172/149‑1 (MQ=255) tATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGAGGTCCCCGACCTGCTCGACCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAAccgcccg > 5:88890/1‑148 (MQ=255) ggCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCa > 8:156650/1‑113 (MQ=255) ggCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCa < 7:156650/113‑1 (MQ=255) caacaaACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACTGCCGCATGTCGAAATCGTGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACgg < 3:18739/149‑1 (MQ=255) gTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCt > 5:309340/1‑149 (MQ=255) cTGTTGAGCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGc < 4:235661/149‑1 (MQ=255) gTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGcc > 2:195777/1‑148 (MQ=255) ttGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCa > 6:245638/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGc > 5:142132/1‑149 (MQ=255) gAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGa < 1:234358/101‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGa > 2:234358/1‑101 (MQ=255) aGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGt < 6:309340/149‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTg < 5:245638/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCACCGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGGTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGAtgg > 4:182098/1‑148 (MQ=255) cAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGAtgtg < 1:195777/148‑1 (MQ=255) cgacgaAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGc < 2:134566/149‑1 (MQ=255) acgaAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCg < 3:158501/149‑1 (MQ=255) cgaAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCgg < 1:19108/149‑1 (MQ=255) gaAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGt < 2:73139/149‑1 (MQ=255) gcccgatttcgacatgcggccgtagccttgggcgagcaggtcgAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCg > 6:328328‑M2/44‑149 (MQ=255) aGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCg > 4:44154/1‑149 (MQ=255) cGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTg < 6:203582/149‑1 (MQ=255) ggTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGTTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTgg < 3:148667/134‑1 (MQ=255) ggTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGTTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTgg > 4:148667/1‑134 (MQ=255) ggTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTgg < 6:142132/149‑1 (MQ=255) tttcgacatgcggccgtagccttgggcgagcaggtcgAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCgg < 7:29094‑M2/100‑1 (MQ=255) tttcgacatgcggccgtagccttgggcgagcaggtcgAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCgg > 8:29094‑M2/38‑137 (MQ=255) CGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCa > 2:108978‑M1/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCTGGCACGCTGCAAAGCATCACGCTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGcccc > 5:183481/1‑149 (MQ=255) cccAAGGCTACGGCCGCATGTCGAACTCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGGCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGGCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTc < 3:182098/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTc > 1:256399/1‑148 (MQ=255) ccGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTg < 3:232712/118‑1 (MQ=255) cGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAgcg > 7:117014/1‑127 (MQ=255) cGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAgcg < 8:117014/127‑1 (MQ=255) gCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTCGAGGCCGCCAACCAg > 5:114181/1‑149 (MQ=255) gAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTCGAGGCCGCCAACCAGCCACCGc > 5:270930‑M2/2‑149 (MQ=255) gAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTCGAGGCCGCCAACCAGCCACCGc > 4:183132‑M2/2‑149 (MQ=255) aaaTCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCACGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTAATGTGGAGCCCGTGAACGTGGTCGGCAGCGCCCAGGTCTAGGCCGCAAACCATCCACCGCt > 5:248673/1‑149 (MQ=255) | TCTCGAGCAAACTCAGCGACGTGGTCAAAGTCAGCACCGCACGCTATGACTGGGCCAACAAACGTCTGTTGATCGAGGCCAGCTCCAGCGACGAAGTAGCGGTCCCCGACCTGCTCGCCCAAGGCTACGGCCGCATGTCGAAATCGGGCACGCTGCAAAGCATCACGGTCAACGATTTGGCTCAACCGCCCGCTACCGTTACGGTCAAGTCTGCCCATGGCGGTAGTGATGTGGAGCCGGTGATCGTGGTCGGCAGCGCCCCGGTCGAGGCCGCCAACCAGCCACCGCT > NC_002947/3849353‑3849641 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |