New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4086293 = | 64 (1.270) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.3% | coding (992/1245 nt) | amaD | D‑lysine oxidase |
? | NC_002947 | 4086405 = | 46 (0.970) | coding (1104/1245 nt) | amaD | D‑lysine oxidase |
CTGGCAACCAGATCCAGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGACTGAAC > NC_002947/4086257‑4086548 | tgatgggcatggccgaagttgaaccacagccctgggTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCAc > 8:135817‑M1/37‑149 (MQ=255) gCAACCAGATCCAGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCAccc < 6:9989/148‑1 (MQ=255) ggcatggccgaagttgaaccactgccctgggTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAg > 8:1938‑M1/32‑148 (MQ=255) atccAGATCCAGTTGGGCAGCTGCTAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAgg < 6:97814/147‑1 (MQ=255) aCCAGATCCAGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAggg < 7:220143/149‑1 (MQ=255) aGATCCAGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAACTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCtg > 1:58565/1‑149 (MQ=255) cAGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGtt > 8:176610/1‑149 (MQ=255) aGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGtt > 6:160968/1‑148 (MQ=255) ggCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACtt > 3:92933/1‑149 (MQ=255) gCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGc > 8:118971/1‑149 (MQ=255) cTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGcc < 6:13808/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCa < 1:97828/149‑1 (MQ=255) ctgggtggcgcggcgccggcccgatcaccgggcgcatgtccggcaggcaggggcggcggcccagccatggcgtgtcgtccagacgatcgccgagggccgggaacagcttgcgcgccaCCCAGGGCAGTGGTTCAACTTCGGCCATGcc > 8:1938‑M2/118‑148 (MQ=255) gtggcgcggcgccggcccgatcaccgggcgcatgtccggcaggcaggggcggcggcccagccatggcgtgtcgtccagacgatcgccgagggccgggaacagcttgcgcgccaCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCa > 8:135817‑M2/114‑149 (MQ=255) CGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGc > 3:263533‑M1/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGccc > 2:247500/1‑130 (MQ=255) ttCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGccc < 1:247500/130‑1 (MQ=255) ttCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTg < 5:160968/147‑1 (MQ=255) gcccgatcaccgggcgcatgtccggcaggcaggggcggcggcccagccatggcgtgtcgtccagacgatcgccgagggccgggaacagcttgcgcgccaCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTgg < 7:135817‑M2/50‑1 (MQ=255) cccGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCCCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGcc > 4:181472/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGccc > 4:9476/1‑149 (MQ=255) cGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGcc < 2:18931/125‑1 (MQ=255) cGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCACGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCCCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCg > 1:202274/1‑149 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGcg > 7:93521/1‑149 (MQ=255) gCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGcggc > 4:280596/1‑149 (MQ=255) tCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGcggccggc > 7:115306/1‑149 (MQ=255) cTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGgctgct > 1:146543/1‑149 (MQ=255) gacgacACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTgg < 7:176610/148‑1 (MQ=255) gacACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGa < 4:92933/149‑1 (MQ=255) gacACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCAGCAgccggccg > 3:312166/1‑148 (MQ=255) acacGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCAGCAgccggccgca < 4:312166/149‑3 (MQ=255) cccGCCATGGCTGGTCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAgc < 7:281172/147‑1 (MQ=255) acGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAgct > 8:282643/1‑149 (MQ=255) gCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCCGGGTGATCGGGCCGGTGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAgctg > 1:223670/1‑149 (MQ=255) gCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGc < 1:315928/141‑1 (MQ=255) gCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGc > 2:315928/1‑141 (MQ=255) ggCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACt > 4:282900/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTg > 3:289145/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTg < 2:36116/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGa < 3:9476/149‑1 (MQ=255) cgccgccCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGcc < 7:282643/149‑1 (MQ=255) ggACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTACTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCcg > 7:98389/1‑149 (MQ=255) gcCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCgcgctgt > 8:116035/1‑144 (MQ=255) gcCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTAc < 3:282900/149‑1 (MQ=255) ccc‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACa < 2:269060/149‑1 (MQ=255) ccc‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACa < 8:93521/149‑1 (MQ=255) aTCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAAGTTGGGGCTTGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAg < 4:50154/99‑1 (MQ=255) aTCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAg > 3:50154/1‑99 (MQ=255) aTCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGAc < 5:7138/149‑1 (MQ=255) gggCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCg > 2:51700/1‑149 (MQ=255) ggCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGgctgct < 2:86449/88‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGgctgct > 1:86449/1‑88 (MQ=255) ccGGTGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGttt < 2:223670/149‑1 (MQ=255) cgccgcgccACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGAc < 3:181472/149‑1 (MQ=255) gccgcgccACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGACt > 1:7416/1‑149 (MQ=255) gcgccaCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGACTGaa < 3:280596‑M2/143‑1 (MQ=255) gcgccaCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGACTGaa > 3:81926‑M2/7‑149 (MQ=255) cgccaCCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGACTGAAc > 1:99314‑M2/6‑149 (MQ=255) | CTGGCAACCAGATCCAGTTGGGCCGCTGCGAGGCCTTGGCGCGCAAGCTGTTCCCGGCCCTCGGCGATCGTCTGGACGACACGCCATGGCTGGGCCGCCGCCCCTGCCTGCCGGACATGCGCCC‑GGTGATCGGGCCGGCGCCGCGCCACCCAGGGCTGTGGTTCAACTTCGGCCATGCCCATCACGGCCTCACGCTGGGCCCGGTCTGCGGCCGGCTGCTGGCCGAGCTGCTCACTGGCGAGCCCCCCTTCACCGACCCCGCGCCTTACAGCGCGACCCGTTTCGACTGAAC > NC_002947/4086257‑4086548 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |