New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4132905 = | 57 (1.130) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 6.9% | coding (256/1206 nt) | PP_3636 | sulfonate ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 4132934 = | 54 (1.120) | coding (227/1206 nt) | PP_3636 | sulfonate ABC transporter substrate‑binding protein |
CACGTGGTTCCAGGCCACCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGCAACGGCAA > NC_002947/4132786‑4133079 | cACGTGGTTCCAGGCCACCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCt > 7:176458/1‑149 (MQ=255) cGTGGTTCCAGGCCAGCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGTATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCg < 2:316046/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGGCCACCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGcc < 5:180516/148‑1 (MQ=255) tCCAGGCCACCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCtt > 5:248316/1‑148 (MQ=255) cAGGCCACCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGa < 1:230945/148‑1 (MQ=255) cctatcTTGGCTGGCACCTTGCTTCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCtt < 7:293308/143‑1 (MQ=255) accaccTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTc > 7:148046/1‑149 (MQ=255) ccaccTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCg < 8:271621/149‑1 (MQ=255) caccTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGAt > 7:153260/1‑141 (MQ=255) caccTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGAt < 8:153260/141‑1 (MQ=255) caccTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCgg > 2:123970/1‑149 (MQ=255) caccTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCgg > 7:90219/1‑149 (MQ=255) cTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCt > 2:78040/1‑149 (MQ=255) ggctggcACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCtt > 8:293308/1‑140 (MQ=255) ctggcACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGCCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAAc < 1:26173/149‑1 (MQ=255) tggcACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGaa > 6:164577/1‑147 (MQ=255) cgcatcggctacctgccgatcaccgatgccacgccgctgctggtggcacataacaacggcctgttcgaggccgaaggcatcaaggccgaGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCg > 8:177234‑M1/90‑121 (MQ=255) cgcatcggctacctgccgatcaccgatgccacgccgctgctggtggcacataacaacggcctgttcgaggccgaaggcatcaaggccgaGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCg < 7:177234‑M1/32‑1 (MQ=255) ctgcCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCgttgtt < 2:79983/149‑1 (MQ=255) ctgcCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCgttgtt < 2:75742/149‑1 (MQ=255) tgcCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGACCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCgttgtt < 7:208197/148‑1 (MQ=255) ccATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTa < 2:261265/147‑1 (MQ=255) gcgcCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGccac > 3:48226/1‑148 (MQ=255) ccATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCGGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACcagca < 8:148046/149‑1 (MQ=255) ccATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACcag > 7:53119/1‑147 (MQ=255) ccGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAgcggc < 8:90219/149‑1 (MQ=255) tCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTg < 4:48226/149‑1 (MQ=255) tCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTg > 5:108310/1‑149 (MQ=255) ggCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATc < 8:127049/149‑1 (MQ=255) gCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCg < 8:176458/149‑1 (MQ=255) cGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCgg < 8:53119/149‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGa > 7:73428/1‑149 (MQ=255) aGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATc < 2:73045/147‑1 (MQ=255) aGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCAGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATc > 1:73045/1‑147 (MQ=255) gTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCgg > 1:61134/1‑147 (MQ=255) tGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCCGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAg > 7:232489/1‑149 (MQ=255) tGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAg > 1:49949/1‑149 (MQ=255) cATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCg < 5:164577/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATgcgc < 2:108630/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCa < 5:285920/149‑1 (MQ=255) gCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCg < 1:78040/149‑1 (MQ=255) cGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGgc < 8:73428/149‑1 (MQ=255) cGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGgc > 8:257114/1‑149 (MQ=255) gagaTGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGgcgc > 6:78939/1‑149 (MQ=255) gagaTGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGgcgc > 8:290824/1‑149 (MQ=255) tGAATGCCTCGATCACCCGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTcc < 8:232489/149‑1 (MQ=255) gAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTg < 3:203645/115‑1 (MQ=255) gAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTg > 4:203645/1‑115 (MQ=255) gAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCg > 3:163459/1‑149 (MQ=255) tGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCt < 5:111189/149‑1 (MQ=255) ccTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCg > 8:90850/1‑149 (MQ=255) cTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCgg > 3:44492/1‑149 (MQ=255) tCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCgg > 6:238821/1‑148 (MQ=255) tCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCgg > 5:308434/1‑148 (MQ=255) cgagcgcccggtgctgctgcgcagctgggcgcTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATgcg < 7:177234‑M2/89‑1 (MQ=255) cgagcgcccggtgctgctgcgcagctgggcgcTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATgcg > 8:177234‑M2/33‑121 (MQ=255) cTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCAc < 6:308434/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCAc > 3:135332/1‑149 (MQ=255) GCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACgcgc > 6:108310‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCAGCGGGGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACgcgc > 7:257114‑M1/1‑149 (MQ=255) ccggtgctgctgcgcagctgggcgcTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGt > 6:15257‑M2/26‑84 (MQ=255) ccggtgctgctgcgcagctgggcgcTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGt < 5:15257‑M2/59‑1 (MQ=255) gcagcagcaCCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTc > 2:102642/1‑149 (MQ=255) agcagcaCCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGa < 1:123970/149‑1 (MQ=255) caCCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGc > 3:248845/1‑148 (MQ=255) aCCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGCaa > 3:49515/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGCAACg > 4:251169/1‑149 (MQ=255) cgcTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGCAACGGCaa < 5:238821‑M2/146‑1 (MQ=255) cgcTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGCAACGGCaa < 2:61134‑M2/146‑1 (MQ=255) | CACGTGGTTCCAGGCCACCACCTTGGCTGGCACCTTGCTGCCATAGCGCGCCCATACCGTCATCGGCGAAAGCAGGTGGATGACATTGACCTGGCCGGAGATGAATGCCTCGATCACCTGCGCCCAGCTGCGCAGCAGCACCGGGCGCTCGGCCTTGATGCCTTCGGCCTCGAACAGGCCGTTGTTATGTGCCACCAGCAGCGGCGTGGCATCGGTGATCGGCAGGTAGCCGATGCGCACCGGCGCGTCCGGCTCGGCAGCGGCACGCGCCTGCAAGCTCGACAGCAACGGCAA > NC_002947/4132786‑4133079 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |