New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4786030 = | 46 (0.910) | 4 (0.080) | 3/242 | NT | 9.4% | coding (1284/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4786078 = | 34 (0.720) | coding (1236/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
GTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGCTCCTGATGC > NC_002947/4785935‑4786225 | gTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCCACCTGCATAcc > 4:213056/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCt > 2:212074/1‑149 (MQ=255) ggCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAgg < 2:227955/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAggg > 7:278444/1‑149 (MQ=255) cTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCt > 6:293810/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCTCCGCTGAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCgctgc < 1:212074/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCgg < 8:197232/148‑1 (MQ=255) gTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCt > 6:140521/1‑148 (MQ=255) ggTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCa < 3:262144/148‑1 (MQ=255) ggTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGt > 2:222788/1‑149 (MQ=255) tGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAAGGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTc < 3:213056/149‑1 (MQ=255) tGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGccgccg < 7:21623/128‑1 (MQ=255) tGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGccgccg > 8:21623/1‑128 (MQ=255) aGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTgg < 5:293810/149‑1 (MQ=255) aGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTg < 5:140521/148‑1 (MQ=255) gCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCCGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAg > 7:174346/1‑149 (MQ=255) ccTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGc < 5:250272/149‑1 (MQ=255) gATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGc > 7:218031/1‑82 (MQ=255) gATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGc < 8:218031/82‑1 (MQ=255) gATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTg < 3:133067/148‑1 (MQ=255) aCCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACt > 3:91131/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCggg < 8:278444/149‑1 (MQ=255) aTCAGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGt > 6:168123/1‑149 (MQ=255) gTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATg > 5:59396/1‑149 (MQ=255) tGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATgg < 2:201049/149‑1 (MQ=255) aGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTg < 4:91131/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAg > 4:237731/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTgcg < 1:222788/149‑1 (MQ=255) caggtcgaggagtacccgttgagcggcgccgatgcgcgtttcgacctgCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTgcgc < 7:232583‑M2/100‑1 (MQ=255) caggtcgaggagtacccgttgagcggcgccgatgcgcgtttcgacctgCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTgcgc > 8:232583‑M2/49‑148 (MQ=255) caggtcgaggagtacccgttgagcggcgccgatgcgcgtttcgacctgCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGct > 4:50086‑M2/49‑149 (MQ=255) AGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGctc < 4:258955‑M1/149‑1 (MQ=255) GTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTg < 6:187929‑M1/149‑1 (MQ=255) GTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTg < 2:69101‑M1/149‑1 (MQ=255) CGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTggg > 6:59396‑M1/1‑149 (MQ=255) AAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTgcg > 8:264780‑M1/1‑140 (MQ=255) AAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTgcg < 7:264780‑M1/140‑1 (MQ=255) AAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGc < 2:165790‑M1/149‑1 (MQ=255) gagtacccgttgagcggcgccgatgcgcgtttcgacctgCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCa < 3:50086‑M2/110‑1 (MQ=255) gcgcATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAgc < 2:176220/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCAt < 5:168123/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATc < 1:69101/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGa > 3:70461/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGAc > 7:86114/1‑149 (MQ=255) cTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATg > 6:142637/1‑110 (MQ=255) cTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATg < 5:142637/110‑1 (MQ=255) aaCGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCt > 4:97520/1‑148 (MQ=255) cctcGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGc > 3:94089/1‑149 (MQ=255) cctcGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGc > 4:203748/1‑149 (MQ=255) ctcGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGc > 8:176219/1‑148 (MQ=255) ctcGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGc < 7:176219/148‑1 (MQ=255) acctgCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGCTCCTg < 6:159652‑M2/144‑1 (MQ=255) tccAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTACTAGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGCTTGCGCTCTGGGGACAGCGCATCGACCAGATGCTCAAACGCCAGCTCCTGATg > 6:78007/3‑149 (MQ=255) gCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGCTCCTGATGc > 6:90943‑M2/2‑149 (MQ=255) cAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCAGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGCTCCTGATGc > 7:72793/1‑148 (MQ=255) | GTCACCAGGCGCTCGACGGTGCTGGCCTTGAACAGGTCGGTTGCATAGGTGAAGTACGCCTGGATACCGTCGGCGCCATCGGTGAAGTCGAAGGCCAGGTCGAAACGCGCATCGGCGCCGCTCAACGGGTACTCCTCGACCTGCAGACCGCTGAGGGTCTTGCGCTGCTCGCCGCCGGCAGCTTCACCCGCGACGTTCTGGTTGAGCTTGAACTGGAACAGCGGGTTATGGCTGAGGTTGCGCTCTGGGGCCAGCGCATCGACCAGTTGCTCAAACGGCAGCTCCTGATGC > NC_002947/4785935‑4786225 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |