New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5388632 = | 56 (1.110) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.8% | coding (2142/2811 nt) | dld2 | D‑lactate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5388688 = | 44 (0.900) | coding (2198/2811 nt) | dld2 | D‑lactate dehydrogenase |
CCGCAACCGCTTCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTGATCACCGCCCTGCTGCACGCCAGCC > NC_002947/5388540‑5388831 | ccGCAACCGCTTCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGATCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCct > 1:263046/1‑149 (MQ=255) ccGCAACCGCTTCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCct > 5:253190/1‑149 (MQ=255) cAACCGCTTCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGATCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCctgct < 2:263046/149‑1 (MQ=255) gggtagcccttggaggcgaacggttggccgcagcacaggctgtcggcgttgtcggggaacaccacctggtaaccggccttttccagcaGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCctgctg > 1:290567‑M1/89‑149 (MQ=255) aaCCGCTTCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCctgctg < 3:180227/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAgg > 1:98729/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGCCTTCGGCGCCACCACCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCgg < 4:206760/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGATGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAgg > 3:288978/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAggt > 3:192685/1‑149 (MQ=255) tCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAggt‑g > 6:36891/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAggt‑g < 3:95494/148‑1 (MQ=255) gcgcCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAggt‑gg > 8:211799/1‑147 (MQ=255) gcgcCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAggt‑gg < 7:211799/147‑1 (MQ=255) gcgcCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGgt‑ggtg < 2:50693/149‑1 (MQ=255) caccaGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTcc > 7:92843/1‑149 (MQ=255) caccaGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTcc < 4:192685/149‑1 (MQ=255) accaGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTccc > 5:221517/1‑149 (MQ=255) ccaGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTcccc < 2:305572/149‑1 (MQ=255) caGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGATGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GTGGTTaccc > 4:263736/1‑148 (MQ=255) aGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGGTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGa < 8:131212/149‑1 (MQ=255) cccgcccCCGCTTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGCGCCCGGCCTATGCCGACCTCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGa > 1:232350/1‑148 (MQ=255) gtgtACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCgg > 4:279749/1‑149 (MQ=255) gtgtACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCg < 2:313844/148‑1 (MQ=255) tgtACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGc > 3:78176/1‑149 (MQ=255) gtACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGc > 3:33372/1‑148 (MQ=255) gccgccTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGtt < 6:253190/149‑1 (MQ=255) gccgccTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGtt < 8:92843/149‑1 (MQ=255) ccgccTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTc < 5:36891/149‑1 (MQ=255) cgccTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCg > 4:14170/1‑149 (MQ=255) cagCGTTTCCCGGCTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAATAGGCCGGTAACCAGGT‑GCTGTACCCCGACAACTCCGACAGCCTGTCCTCCGGCCAACCGTACGACt > 6:54716/3‑149 (MQ=255) cTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCt < 4:251083/149‑1 (MQ=255) tGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTc > 8:192637/1‑149 (MQ=255) cGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTcc < 3:14170/148‑1 (MQ=255) gTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTcc > 4:20576/1‑147 (MQ=255) ccGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAgg > 6:324698/1‑146 (MQ=255) ccGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAgg < 5:324698/146‑1 (MQ=255) cagcagggcgcgggttttgtccagcagcgagctttgctcgcggtcggcataggccgggcccTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTAccc > 1:290567‑M2/62‑149 (MQ=255) aTGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAgg > 4:250058/1‑139 (MQ=255) aTGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAgg < 3:250058/139‑1 (MQ=255) ggcgcgggttttgtccagcagcgagctttgctcgcggtcggcataggccgggcccTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAg > 4:46136‑M2/56‑147 (MQ=255) gttttgtccagcagcgagctttgctcgcggtcggcataggccgggcccTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGaa < 2:290567‑M2/101‑1 (MQ=255) ccTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGaa < 4:33372/149‑1 (MQ=255) tATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAaca > 6:204281/1‑149 (MQ=255) tGCCGACCGCTAGCAAAGCTCGCTGCTGTACAAATCCCGCGCCCTGCTGGAAATGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCTACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAaca < 2:232350/147‑1 (MQ=255) tGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAacac < 2:98729/148‑1 (MQ=255) cGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAAc > 8:32763/1‑149 (MQ=255) gcgAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAg < 4:288978/149‑1 (MQ=255) aaaGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTg < 6:78630/149‑1 (MQ=255) gACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTGATCACCGCCctgc < 3:263736/148‑1 (MQ=255) aaCCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTGATCACCGCCCTGCTGCACg > 2:107060/1‑149 (MQ=255) aCCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGtgc < 1:9704/66‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGtgc > 2:9704/1‑66 (MQ=255) cgcgCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCaa > 7:164350/1‑86 (MQ=255) cgcgCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCaa < 8:164350/86‑1 (MQ=255) gcgcCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTGATCACCGCCCTGCTGCACGCCAGc < 3:20576/149‑1 (MQ=255) gcccTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGTGGGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTGATCACCGCCCTGCTGCACGCCAGcc > 1:34460‑M2/5‑149 (MQ=255) | CCGCAACCGCTTCGCCCGCTGGCCTTCGGCGCCACCAGCAACGACGCCCGCCCCCGCGTGGTGTACCTGGCCGCCTGCGTTTCCCGGGTAATGGGCCCGGCCTATGCCGACCGCGAGCAAAGCTCGCTGCTGGACAAAACCCGCGCCCTGCTGGAAAAGGCCGGTTACCAGGT‑GGTGTTCCCCGACAACGCCGACAGCCTGTGCTGCGGCCAACCGTTCGCCTCCAAGGGCTACCCCGAGCAGGCCGAACACAAACGCCAGGAGCTGATCACCGCCCTGCTGCACGCCAGCC > NC_002947/5388540‑5388831 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |