New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 478290 | 41 (0.600) | 7 (0.130) | 6/224 | 6.9 | 20.5% | intergenic (+38/+72) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
? | NC_002947 | = 478325 | 22 (0.410) | intergenic (+73/+37) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGA > NC_002947/478144‑478428 | tCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacag > 7:49572/1‑147 (MQ=255) ggCAAGTTCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAg < 6:10612/148‑1 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTTCTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGc < 1:120973/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGc < 4:269807/149‑1 (MQ=255) gTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAAc < 8:99671/149‑1 (MQ=255) gTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAAc > 1:357516/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCt > 1:162066/1‑137 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCt < 2:162066/137‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctc < 3:204539/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct < 5:267708/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACctct < 3:344295/149‑1 (MQ=255) gcggAGCTGTGGCAGGAAGCGCATATCGCTCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAt < 2:357516/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGCTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 1:109685/149‑1 (MQ=255) gcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt > 7:201928/1‑149 (MQ=255) cTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGc < 3:156748/149‑1 (MQ=255) tgGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGcccc > 7:310915/1‑149 (MQ=255) tgGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGcccc < 8:300470/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTg < 3:272323/149‑1 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGt < 8:201928/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAg > 3:314771/1‑149 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTTAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCGCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCgg < 8:279070/149‑1 (MQ=255) gatcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTa < 7:159667/148‑1 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 4:314771/149‑1 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGACGGGGTTTAccgcgg > 2:71518/1‑144 (MQ=255) tGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGCTGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag > 8:371224/1‑149 (MQ=255) tGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgtgt < 4:349792/116‑1 (MQ=255) tGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgtgt > 3:349792/1‑116 (MQ=255) ggCCCCCGGGGCCTTTGTGTGCCGCGGGTGGCCGTTGACCCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGCCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACCACGGGCTGAGCCCAACCTCTGTGGTGGGCCCCCTGTCGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAgg < 8:310915/149‑1 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTTAACCCGCTGCTTCGCCGGGCTGGGGCCAGCCCGGGATGTGTGCCCCCGGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc > 1:153863/1‑149 (MQ=255) ccgTTGACGCCGGCTGTCGCCTG‑AAGCGCCCTTTGCGCGGGTAAACCCGTTCCTCCCCGGGGCTGACCCAAACCTCTTATGTGGGCCCCGTGTTGTCGGGTTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc < 8:27809/146‑1 (MQ=255) aGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCTAAGACCGGCGGAGCCCAACCTCTGATGTGTGGCCCCTGTTGGAGCGGGTTTTCCCGCGAAGAGGCCGGTAGGGCTAACCGCGCGGGGAAGccgc > 4:108951/1‑145 (MQ=255) aGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTc > 7:109524/1‑147 (MQ=255) tagcGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGAGGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 1:65808/146‑1 (MQ=255) tATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 8:109524/149‑1 (MQ=255) tCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa < 2:73536/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCGCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg > 7:169751/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGAAAACCCGCTCCTACGCCGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGGGCCCCCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGt < 2:45954/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCCCTCCTACCACCGGCTGACCCCAACCACTGATGTGTGCCCCCAGTAGGAGCCGGAATAAACGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTATCAGCCGTTCACCTATGAGTGCtaag > 2:331972/1‑146 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTc > 1:126614/1‑120 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTc < 2:126614/120‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCt < 2:145908/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGa > 7:363830/1‑149 (MQ=255) | TCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTG‑TATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGA > NC_002947/478144‑478428 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |